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1、代謝組學(xué)的研究方法和研究流程,生物化學(xué)與分子生物學(xué),主 要 內(nèi) 容,定義 概述 特點(diǎn) 研究方法 研究流程,定 義,代謝組學(xué)(metabonomics)是指通過組群指標(biāo)分析,進(jìn)行高通量檢測和數(shù)據(jù)處理,研究生物體整體或組織細(xì)胞系統(tǒng)的動態(tài)代謝變化,特別是對內(nèi)源代謝、遺傳變異、環(huán)境變化乃至各種物質(zhì)進(jìn)入代謝系統(tǒng)的特征和影響的學(xué)科,概 述,代謝組學(xué)是效仿基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)的研究思想,對生物體內(nèi)所有代謝物進(jìn)行定量分析,并尋找代謝物與生理病理變化的相對關(guān)系的研究方式,是系統(tǒng)生物學(xué)的組成部分。 其研究對象大都是相對分子質(zhì)量1000以內(nèi)的小分子物質(zhì)。 先進(jìn)分析檢測技術(shù)結(jié)合模式識別和專家系統(tǒng)等計(jì)算分析方法是代謝組
2、學(xué)研究的基本方法。 其樣品主要是動植物的細(xì)胞和組織的提取液。 主要技術(shù)手段是核磁共振(nmr)、質(zhì)譜(ms)、色譜(hplc,gc),其中以nmr為主,特 點(diǎn),關(guān)注內(nèi)源化合物 對生物體系的小分子化合物進(jìn)行定量定性研究 上述化合物的上調(diào)和下調(diào)指示了與疾病、毒性、基因修飾或環(huán)境因子的影響 上述內(nèi)源性化合物的知識可以被用于疾病的診斷和藥物篩選,代謝組學(xué)的研究方法,2021/3/6,真正意義的代謝組學(xué)研究。預(yù)處理和檢測技術(shù)需滿足高靈敏度、高選擇性和高通量的要求。需要對獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行解析,代謝產(chǎn)物分析4個層次,代謝物靶標(biāo)分析。對個別特定組分分析。 代謝輪廓分析。對預(yù)設(shè)組分的分析。 代謝組學(xué)。特定樣品中所
3、有代謝物分析。 代謝指紋分析。比較代謝物指紋圖譜,目前最常用的分離分析手段是: 氣相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用(gcms) 液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用(lcms) 毛細(xì)管電泳與質(zhì)譜聯(lián)用(cems) 核磁共振(nmr,gc-ms,氣相色譜原理:氣相色譜的流動向?yàn)槎栊詺怏w,氣-固色譜法中以表面積大且具有一定活性的吸附劑作為固定相。當(dāng)多組分的混合樣品進(jìn)入色譜柱后,由于吸附劑對每個組分的吸附力不同,經(jīng)過一定時間后,各組分在色譜柱中的運(yùn)行速度也就不同。吸附力弱的組分容易被解吸下來,最先離開色譜柱進(jìn)入檢測器,而吸附力最強(qiáng)的組分最不容易被解吸下來,因此最后離開色譜柱。如此,各組分得以在色譜柱中彼此分離,順序進(jìn)入檢測器中被檢測、
4、記錄下來,質(zhì)譜原理:質(zhì)譜分析是一種測量離子荷質(zhì)比(電荷-質(zhì)量比)的分析方法,其基本原理 是使試樣中各組分在離子源中發(fā)生電離,生成不同荷質(zhì)比的帶正電荷的離子,經(jīng)加速電場的作用,形成離子束,進(jìn)入質(zhì)量分析器。在質(zhì)量分析器中,再利用電場和磁場使發(fā)生相反的速度色散,將它們分別聚焦而得到質(zhì)譜圖,從而確定其質(zhì)量,gc-ms的基本流路圖,gc,接口,ms,數(shù)據(jù)處理,真空系統(tǒng),gc-ms聯(lián)用儀器,優(yōu)點(diǎn):集色譜法的高分離能力和質(zhì)譜法的結(jié)構(gòu)鑒定能力于一體 , 靈敏度高,可檢測到大量低含量的小分子代謝產(chǎn)物。 缺點(diǎn):無法分析熱不穩(wěn)定性的物質(zhì)和分子量較大的代謝產(chǎn)物,nmr,核磁共振基本原理:當(dāng)以射頻照射外磁場中的自旋核,且射頻的能量正好等于核磁矩不同取向的能級差時,低能級的核將吸收射頻躍遷致高能態(tài) 核磁共振現(xiàn)象,共振條件: (1) 核有自旋(磁性核) (2)外磁場,能級裂分; (3)照射頻率與外磁場的比值0 / b0 = / (2,優(yōu)點(diǎn):能夠?qū)悠穼?shí)現(xiàn)非破壞性、非選擇性分析。它是唯一既能定性, 又能在微摩爾范圍定量有機(jī)化合物的技術(shù)。 缺點(diǎn):靈敏度相對較低, 不適合分析低濃度代謝物,代謝組學(xué)的研究流程,代謝組學(xué)研究流程,代謝組學(xué)各分析流程技術(shù),樣品的提取,樣品預(yù)處理,自動進(jìn)樣,檢測及鑒定,化合物的分離,數(shù)據(jù)分析與可 視化,建模與 仿真,固相微萃取 固相萃取 親
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