SSR相關(guān)基礎(chǔ)知識教案資料

1、Good is good, but better carries it.精益求精，善益求善。SSR相關(guān)基礎(chǔ)知識-共顯性：很多已圖譜類分子標(biāo)記都是共顯性，簡單說就是基因型AA，Aa，aa都能在圖譜中區(qū)分開來，A和a是兩條不同大小的帶。復(fù)雜點(diǎn)說就自己查閱下文獻(xiàn)吧。高度重復(fù)性：高度重復(fù)是，說重復(fù)單元的重復(fù)次數(shù)是多變的，因此多態(tài)性較強(qiáng)，可以用來進(jìn)行多樣性分析，群體遺傳分析等（應(yīng)該是指重復(fù)單元次數(shù)較多，所以為高度重復(fù)，衛(wèi)星DNA都是這個(gè)特點(diǎn)，當(dāng)然要說實(shí)驗(yàn)結(jié)果為高度重復(fù)也是有道理，但措辭不適應(yīng)，實(shí)驗(yàn)結(jié)果只有重復(fù)性好或者重復(fù)性不好，基本不上實(shí)驗(yàn)結(jié)果高度重復(fù)，所以高度重復(fù)指前者的意思可能性更大。當(dāng)然，像這種成

2、熟的分子標(biāo)記技術(shù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果肯定都是重復(fù)性好的。）可靠性：說試驗(yàn)的重復(fù)比較好，比較穩(wěn)定。不想RAPD那樣，今天出來了，明天就可能不行了期望雜合度He是理論計(jì)算得出的雜合度。觀測雜合度是隨機(jī)抽取的兩個(gè)樣本的HYPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因不相同的概率。計(jì)算公式如下：觀測雜合度(Ho)=觀察得到雜和個(gè)體數(shù)/樣本個(gè)體數(shù)雜合度HYPERLINKjavascript:void(0)編輯本詞條缺少概述、信息欄、名片圖，補(bǔ)充相關(guān)內(nèi)容使詞條更

3、完整，還能快速升級，趕緊來編輯吧！1.一般雜合度是指由所有標(biāo)記檢測到的兩親本間的差異程度，而特殊雜合度是指根據(jù)單因子HYPERLINK/view/786804.htmt_blank方差分析所確定的對某一性狀有顯著效應(yīng)的標(biāo)記（陽性標(biāo)記）計(jì)算的親本間差異程度2.雜合度是指隨機(jī)抽取的樣本中其兩個(gè)HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因不相同的可能性(Nei,1975)。期望雜合度主要是根據(jù)種群內(nèi)當(dāng)前優(yōu)勢等位基因的分布頻率來推算的,稀有基因的貢獻(xiàn)極其微弱3.遺傳學(xué)上的雜合度，用H表示:雜合性的一種狀態(tài)程度,反映一個(gè)位點(diǎn)具有兩個(gè)以上等位基因的狀態(tài)：H=1-pi期望雜合度是理

4、論計(jì)算得出的雜合度。觀測雜合度是隨機(jī)抽取的兩個(gè)樣本的等位基因不相同的概率。計(jì)算公式如下：觀測雜合度(Ho)=觀察得到雜和個(gè)體數(shù)/樣本個(gè)體數(shù)總數(shù)。預(yù)期雜合度值（He）根據(jù)Nei(1978)提供的公式計(jì)算：nHe=1pi2i=1其中pi是第i個(gè)等位形式的頻率，所有位點(diǎn)的等位形式頻率由軟件POPGENE32計(jì)算得出，n是等位形式的數(shù)目。He值的范圍從0（說明無多態(tài)性）到1（說明無限多個(gè)等位形式具有相同的頻率，是個(gè)極限值多態(tài)信息含量是指DNA的多態(tài)性指標(biāo)等位基因數(shù)是反映群體遺傳變異大小的一個(gè)指標(biāo)，其數(shù)值越接近所檢測到的等位基因的絕對數(shù)，表明等位基因在群體中分布越均勻。(最后一個(gè)是同源染色體上的)有效H

5、YPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因數(shù)是反映群體HYPERLINK/s?wd=%E9%81%97%E4%BC%A0%E5%8F%98%E5%BC%82&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank遺傳變異大小的一個(gè)指標(biāo)，其數(shù)值越接近所檢測到的HYPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn

6、=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因的HYPERLINK/s?wd=%E7%BB%9D%E5%AF%B9%E6%95%B0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank絕對數(shù)，表明HYPERLINK/s?wd=%E7%AD%89%E4%BD%8D%E5%9F%BA%E5%9B%A0&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank等位基因在群體中分布越均勻。等位基因（allele）：位于一對HYPERLINK/s?wd=%E5%90%8C%E6%BA%90%E6%9F%

7、93%E8%89%B2%E4%BD%93&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank同源染色體的相同位置上控制某一性狀的不同形態(tài)的基因。不同的等位基因產(chǎn)生例如發(fā)色或血型等遺傳特征的變化。等位基因控制HYPERLINK/s?wd=%E7%9B%B8%E5%AF%B9%E6%80%A7%E7%8A%B6&hl_tag=textlink&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank相對性狀的顯隱性關(guān)系及HYPERLINK/s?wd=%E9%81%97%E4%BC%A0%E6%95%88%E5%BA%94&hl_tag=textli

8、nk&tn=SE_hldp01350_v6v6zkg6t_blank遺傳效應(yīng)，可將等位基因區(qū)分為不同的類別。在個(gè)體中，等位基因的某個(gè)形式（顯性的）可以比其他形式（隱性的）表達(dá)得多。有效等位基因數(shù)HYPERLINKjavascript:void(0)編輯本詞條缺少信息欄、名片圖，補(bǔ)充相關(guān)內(nèi)容使詞條更完整，還能快速升級，趕緊來編輯吧！中文名稱有效等位基因數(shù)英文名稱effectivenumberofallele定義理想群體中(所有等位基因頻率相等)，一個(gè)基因座上產(chǎn)生與實(shí)際群體中相同的純合度所需的等位基因數(shù)。它等于實(shí)際群體的純合度的倒數(shù)。等位基因頻率HYPERLINKjavascript:void(0

9、)編輯本詞條缺少信息欄、名片圖，補(bǔ)充相關(guān)內(nèi)容使詞條更完整，還能快速升級，趕緊來編輯吧！HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因頻率是群體遺傳學(xué)的術(shù)語，用來顯示一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中基因的多樣性，或者說是基因庫的豐富程度。目錄1HYPERLINK/view/553310.html1#1概念2HYPERLINK/view/553310.html2#2概念比較HYPERLINK/view/553310.html2_1#2_1相關(guān)計(jì)算HYPERLINK/view/553310.html2_2#2_2摘要HYPERLINK/

10、view/553310.html2_3#2_3理想狀態(tài)HYPERLINK/view/553310.html2_4#2_4自然狀態(tài)3HYPERLINK/view/553310.html3#3遺傳平衡4HYPERLINK/view/553310.html4#4高考信息5HYPERLINK/view/553310.html5#5特殊情況1概念HYPERLINK/view/553310.html#o編輯本段編輯HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因頻率是群體遺傳學(xué)的術(shù)語，用來顯示一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中基因的多樣性，或者說

11、是基因庫的豐富程度。HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因頻率的定義如下：如果1）一個(gè)染色體中存在某特定HYPERLINK/view/212451.htmt_blank基因座，2）該基因座上有一個(gè)基因，3）一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中的每一個(gè)個(gè)體的體細(xì)胞都有n個(gè)該特定基因座（例如HYPERLINK/view/31204.htmt_blank二倍體生物的細(xì)胞中有兩個(gè)該特定基因座），4）該基因有等HYPERLINK/picture/553310/553310/0/d1a20cf431adcbef4ed870acacaf2e

12、dda2cc9faf?fr=lemma&ct=singlet_blank位基因或變種；那么HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因頻率為-等位基因在這個(gè)種群中所有該等位基因在特定基因座中所占的百分比。舉例來說，如果在某HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中一個(gè)等位基因的基因頻率為20%，那么在種群的所有成員中，1/5的染色體帶有那個(gè)等位基因，而其他4/5的染色體帶有該HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的其他對應(yīng)變種可以是一種也可以是很多種。如人們熟悉的人的MN血型，它是由一對HYPERLINK/vi

13、ew/544143.htmt_blank共顯性等位基因M和N所決定，產(chǎn)生3種基因型M/M、M/N和N/N，而相應(yīng)的表型是M、MN和N，而且比例是1/4M、1/2MN和1/4N。這個(gè)原理可以推廣到一般群體內(nèi)婚配，如以群體中MN表型（HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型）的具體樣本數(shù)被所觀察到總數(shù)相除即可得到（轉(zhuǎn)換）相對頻率數(shù)。2概念比較HYPERLINK/view/553310.html#o編輯本段編輯基因頻率是某種基因在某個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中出現(xiàn)的比例。HYPERLINK/view/99532.htmt_bla

14、nk基因型頻率是某種特定基因型的個(gè)體占群體內(nèi)全部個(gè)體的比例。前者是某基因個(gè)體數(shù)占全部基因數(shù)的比例，后者是某基因型個(gè)體數(shù)占群體總數(shù)的比例。相關(guān)計(jì)算設(shè)二倍體生物個(gè)體的某一HYPERLINK/view/212451.htmt_blank基因座上有兩個(gè)HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因A和a，假設(shè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中共有N個(gè)個(gè)體，而AA、Aa、aa三種HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型的個(gè)體數(shù)分別為n1、n2、n3，那么種群中A基因的頻率和AA基因型的頻率分別是：A基因的頻率=A基因

15、的總數(shù)/（A基因的總數(shù)+a基因的總數(shù)）=（2n1+n2）/2N或n1/N+n2/2NAA基因型的頻率=AA基因型的個(gè)體數(shù)/該二倍體群體總數(shù)=n1/N。基因頻率與HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率的計(jì)算關(guān)系，由上述推得：A基因的頻率=n1/N+1/2n2/N=AA基因型的頻率+1/2Aa基因型的頻率?；蝾l率計(jì)算類型及其公式推導(dǎo)摘要生物進(jìn)化的實(shí)質(zhì)是HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群HYPERLINK/view/91738.htmt_blank基因庫基因頻率在環(huán)境選擇作用下的定向改變。運(yùn)用數(shù)學(xué)方法計(jì)算HYPERLINK/view

16、/43530.htmt_blank種群基因頻率有利于理解種群進(jìn)化情況，本文結(jié)合實(shí)例探討種群在不同情況下種群基因頻率計(jì)算類型和計(jì)算公式的推導(dǎo)過程。關(guān)鍵詞：HYPERLINK/view/698262.htmt_blank遺傳平衡基因頻率基因頻率是指在一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群基因庫中，某個(gè)基因占全部HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因數(shù)的比例。HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中某一HYPERLINK/view/1678151.htmt_blank基因位點(diǎn)上各種不同的基因頻率之和以及各種H

17、YPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率之和都等于1。對于一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群來說，理想狀態(tài)下種群基因頻率在世代相傳中保持穩(wěn)定，然而在自然條件下卻受基因突變、HYPERLINK/view/242197.htmt_blank基因重組、自然選擇、遷移和HYPERLINK/view/16508.htmt_blank遺傳漂變的影響，種群基因頻率處于不斷變化之中，使生物不斷向前發(fā)展進(jìn)化。因此，通過計(jì)算某HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群的基因頻率有利于理解該種群的進(jìn)化情況。為了進(jìn)一步加深對這部

18、分知識的理解和掌握，現(xiàn)將基因頻率計(jì)算類型和計(jì)算公式推導(dǎo)歸納如下：理想狀態(tài)理想狀態(tài)下的HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群就是處于HYPERLINK/view/698262.htmt_blank遺傳平衡狀況下的種群，遵循“哈迪溫伯格HYPERLINK/view/4619426.htmt_blank平衡定律”。遺傳平衡指在一個(gè)極大的隨機(jī)自由交配的HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中，在沒有突變發(fā)生，沒有自然選擇和遷移的條件下，種群的基因頻率和HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率在代代相傳中穩(wěn)定不變，保

19、持平衡。一個(gè)具有Aa基因型的大群體(處于遺傳平衡狀態(tài)的零世代或某一世代），A基因的頻率P(A)=p，a基因的頻率P(a)=q，HYPERLINK/view/551490.htmt_blank顯性基因A的基因頻率與隱性基因a的基因頻率之和p+q=1，其雌雄個(gè)體向后代傳遞基因A型HYPERLINK/view/826358.htmt_blank配子的頻率為p，與其相對應(yīng)的傳遞隱性基因a型配子的頻率為q，則可用下表1來表示各類配子的組合類型、HYPERLINK/view/2347746.htmt_blank子代基因型及其出現(xiàn)的概率：表1雄配子雌配子A（p）a（q）A（p）AA（p）Aa（pq）a（q）

20、Aa（pq）aa（q）由上表可知該HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群后代中出現(xiàn)三種HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型AA、Aa、aa，并且三種HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型出現(xiàn)的頻率分別為P（AA）=pp=p=D；P（Aa）=2pq=2pq=H；P（aa）=qq=q=R。且它們的頻率之和為p+2pq+q=（p+q）=1。其基因頻率為A基因的頻率P（A）=D+1/2H=p+pq=p（p+q）=p；a基因的頻率P（a）=R+1/2H=q+pq=q（p+q）=q。可見HYPERLINK/vie

21、w/2347746.htmt_blank子代基因頻率與親代基因頻率一樣。所以，在以后所有世代中，如果沒有突變、遷移和選擇等因素干擾，這個(gè)群體的HYPERLINK/view/71511.htmt_blank遺傳成分將永遠(yuǎn)處于p+2pq+qHYPERLINK/view/84757.htmt_blank平衡狀態(tài)。伴性基因和多HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因HYPERLINK/view/698262.htmt_blank遺傳平衡的計(jì)算仍遵循上述規(guī)律。運(yùn)用此規(guī)律，已知HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率可求基因頻率；反之，已知基因

22、頻率可求基因型頻率。例題：已知苯丙酮尿癥是位于常染色體上的隱性遺傳病。據(jù)調(diào)查，該病的發(fā)病率大約為1/10000，請問在人群中該苯丙酮尿癥隱性HYPERLINK/view/8482009.htmt_blank致病基因（a）的基因頻率以及攜帶此HYPERLINK/view/808569.htmt_blank隱性基因的攜帶者(Aa)HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率分別是（）A1%和099%B1%和198%C1%和396%D1%和0198%解析：苯丙酮尿癥是一種常染色體隱性遺傳病。由于該病則發(fā)病HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因

23、型為aa,即aa=00001，a=001，A=1-a=1-001=099，攜帶者基因型為Aa的頻率=2001099=00198。答案：B變式1在某個(gè)海島上，每一萬個(gè)人中有500名男子患紅綠色盲，則該島上的人群中，女性攜帶者的數(shù)量為每萬人中有多少?(假設(shè)男女比為1：1)（B）A1000人B900人C800人D700人變式2：人的ABO血型決定于3個(gè)HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因I、I、i。通過抽樣調(diào)查發(fā)現(xiàn)血型頻率：A型=045，B型=013，AB型=006，O型=036。試計(jì)算I、I、i這3個(gè)HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等

24、位基因的頻率。答案：I頻率為03，I頻率為01，i頻率為06。自然狀態(tài)對于生活在HYPERLINK/view/262972.htmt_blank自然界中的HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群來說，理想狀態(tài)下的條件是不可能同時(shí)存在，種群基因頻率不可能保持平衡，而是處于不斷變動和發(fā)展的。這種非HYPERLINK/view/3874467.htmt_blank平衡群體常采用抽樣調(diào)查的方法獲得的數(shù)據(jù)來計(jì)算其基因頻率，根據(jù)基因所在位置可分為兩種類型。21關(guān)于HYPERLINK/view/3873846.htmt_blank常染色體遺傳基因頻率的計(jì)算由定義可知，某基因頻率=某

25、基因的數(shù)目/該基因的HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因總數(shù)100%。若某二倍體生物的常染色體的某一HYPERLINK/view/1678151.htmt_blank基因位點(diǎn)上有一對HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因A、a，他們的基因頻率分別為p、q,可組成三種HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型AA、Aa、aa，HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率分別為D、H、R，個(gè)體總數(shù)為N，AA個(gè)體數(shù)為n1，Aa個(gè)體數(shù)為n2，aa個(gè)體數(shù)為n3，n1+n2+n3=N。

26、那么：HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基因型AA的頻率=D=n1/N，n1=ND；基因型Aa的頻率=H=n2/N。n2=NH基因型aa的頻率=R=n3/N，n3=NR；基因A的頻率P(A)=（2n1+n2）/2N=（2ND+NH）/2N=D+1/2H=p基因a的頻率P(a)=（2n3+n2）/2N=（2NR+NH）/2N=R+1/2H=q因?yàn)閜+q=1所以D+1/2H+R+1/2H=D+R+H=1由以上推導(dǎo)可知，HYPERLINK/view/773204.htmt_blank常染色體基因頻率的基本計(jì)算式：某基因頻率=（2該基因HYPERLINK/view/293

27、126.htmt_blank純合子個(gè)數(shù)+1HYPERLINK/view/293127.htmt_blank雜合子個(gè)數(shù)）/2HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群調(diào)查個(gè)體總數(shù)常染色體基因頻率的推導(dǎo)計(jì)算式：某基因頻率=某種基因的純合子頻率+1/2雜合子頻率例題：從某個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中隨機(jī)抽出100個(gè)個(gè)體，測知基因型為AA、Aa和aa的個(gè)體分別是30、60和10個(gè)。求這對HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的基因頻率。解法一：先求出該HYPERLINK/view/43530.htmt_b

28、lank種群HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的總數(shù)和A或a的個(gè)數(shù)。100個(gè)個(gè)體共有200個(gè)基因；其中，A基因有230+60=120個(gè)，a基因有210+60=80個(gè)。然后由常染色體基因頻率的基本式計(jì)算求得：A基因的頻率為：120200=60%a基因的頻率為：80200=40%解法二：由題意可知，AA、Aa和aa的HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率分別是30%、60%和10%，由HYPERLINK/view/773204.htmt_blank常染色體基因頻率的推導(dǎo)式計(jì)算求得：A基因的頻率為：30%+1/260%=60%a基

29、因的頻率為：10%+1/260%=40%變式1：已知人眼的褐色（A）對藍(lán)色（a）是顯性，屬常染色體上基因控制的HYPERLINK/view/71511.htmt_blank遺傳。在一個(gè)30000人的人群中，藍(lán)眼的有3600人，褐眼的有26400人，其中HYPERLINK/view/293126.htmt_blank純合子有12000人，那么，這一人群中A和a基因的基因頻率分別為（A）A64%和36%B36%和64%C50%和50%D82%和18%變式2：在一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中隨機(jī)抽出一定數(shù)量的個(gè)體，其中，HYPERLINK/view/1426

30、44.htmt_blank基因型為BB的個(gè)體占40%，基因型為Bb的個(gè)體占50%，基因型為bb的個(gè)體占10%，則基因B和b的頻率分別是（B）A90%，10%B65%，35%C50%，50%D35%，65%22關(guān)于X或Y染色體遺傳基因頻率的計(jì)算對于HYPERLINK/view/225681.htmt_blank伴性遺傳來說，位于X、YHYPERLINK/view/3874191.htmt_blank同源區(qū)段上的基因，其基因頻率計(jì)算與HYPERLINK/view/773204.htmt_blank常染色體計(jì)算相同；而位于X、Y非同源區(qū)段上的基因，伴X染色體遺傳，在Y染色體上沒有該基因及其HYPER

31、LINK/view/87876.htmt_blank等位基因。同理伴Y染色體HYPERLINK/view/71511.htmt_blank遺傳，在X染色體上也沒有其對等的基因。所以在計(jì)算基因總數(shù)時(shí)，應(yīng)只考慮X染色體（或Y染色體）上的基因總數(shù)。若某HYPERLINK/view/31204.htmt_blank二倍體生物的X染色體的某一基因位點(diǎn)上有一對HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因B、b，他們的基因頻率分別為p、q,可組成五種基因型XX、XX、XX、XY和XY，HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率分別為E、F、G、H和I，

32、個(gè)體總數(shù)為N，XX個(gè)體數(shù)為n1，XX個(gè)體數(shù)為n2，XX個(gè)體數(shù)為n3，XY個(gè)體數(shù)為n4、XY個(gè)體數(shù)為n5。且n1+n2+n3=n4+n5那么：E=n1/N、F=n2/N、G=n3/N、H=n4/N、I=n5/N；p(X)=(2n1+n2+n4)/2（n1+n2+n3）+（n4+n5）=(2n1+n2+n4)/15N=2/3(2E+F+H)q(X)=(2n3+n2+n5)/2（n1+n2+n3）+（n4+n5）=(2n3+n2+n5)/15N=2/3(2G+F+I)由以上推導(dǎo)可知，X染色體基因頻率的基本計(jì)算式：某基因頻率=（2該基因雌性純合子個(gè)數(shù)+雌性雜合子個(gè)數(shù)+雄性含該基因個(gè)數(shù)）/（2雌性個(gè)體總

33、數(shù)+雄性個(gè)體數(shù)）X染色體基因頻率的推導(dǎo)計(jì)算式：某種基因的基因頻率=2/3（2某種基因雌性HYPERLINK/view/232382.htmt_blank純合體頻率+雌性雜合體頻率+雄性該HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率）（雌、雄個(gè)體數(shù)相等的情況下）例題：從某個(gè)種群中隨機(jī)抽出100個(gè)個(gè)體，測知基因型為XX、XX、XX和XY、XY的個(gè)體分別是44、5、1和43、7。求X和X的基因頻率。解法一：就這對HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因而言，每個(gè)雌性個(gè)體含有2個(gè)基因，每個(gè)雄性個(gè)體含有1個(gè)基因（Y染色體上沒有其等位基因）。那么，

34、這100個(gè)個(gè)體共有150個(gè)基因，其中雌性個(gè)體的基因有2(44+5+1)=100個(gè)，雄性個(gè)體的基因有43+7=50個(gè)。而X基因有442+5+43=136個(gè)，基因X有5+12+7=14個(gè)。于是，根據(jù)X染色體基因頻率的基本式計(jì)算求得：X的基因頻率為：136150907%X的基因頻率為：1415093%解法二：由題意可知，XX、XX、XX和XY、XY的HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率分別44%、5%、1%和43%、7%，因?yàn)榇菩?、雄性個(gè)體的基因型頻率各占50%，于是，由X染色體基因頻率的推導(dǎo)式計(jì)算求得：X基因的基因頻率=2/3（244%+5%+43%）907%X

35、基因的基因頻率=2/3（21%+5%+7%）93%變式1：某工廠有男女職工各200名，調(diào)查發(fā)現(xiàn)，女性色盲基因的攜帶者為15人，患者5人，男性患者11人。那么這個(gè)群體中色盲基因的頻率是（B）A45%B6%C9%D78%變式2：對歐洲某學(xué)校的學(xué)生進(jìn)行遺傳調(diào)查時(shí)發(fā)現(xiàn)，血友病患者占07%（男女=21）；血友病攜帶者占5%，那么，這個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群的X的頻率是(C)A297%B07%C396%D32%解析：方法一：這里首先要明確2:1為患者中男女的比例，人群中男女比例為1：1。假設(shè)總?cè)藬?shù)為3000人。則男患者為300007%2/3=14，女患者為300

36、007%1/3=7。攜帶者為30005%=150。則X的頻率=（14+72+150）/(15002+1500)=396%。方法二：人群中男女比例為1：1，根據(jù)X染色體基因頻率的推導(dǎo)式計(jì)算求得：X的頻率=2/3（07%1/32+07%2/3+5%）=396%。答案：選C。總之，盡管基因頻率的計(jì)算類型復(fù)雜多樣，其思維方法又迥然各異，但是我們只要把握住基因頻率計(jì)算的條件和方法規(guī)律，弄清原委并靈活運(yùn)用，就能準(zhǔn)確地計(jì)算出正確的答案。主要參考文獻(xiàn)1李難進(jìn)化論教程北京：高等教育出版社，19909：2442762朱正威，趙占良普通高中課程標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)教科書生物必修2遺傳與進(jìn)化北京：人民教育出版社，2007：115

37、3遺傳平衡HYPERLINK/view/553310.html#o編輯本段編輯也稱“定律”，1908年，英國數(shù)學(xué)家戈弗雷哈羅德哈代（GodfreyHaroldHardy）最早發(fā)現(xiàn)并證明這一定律；1909年，德國醫(yī)生威廉溫伯格（WilhelmWeinberg）也獨(dú)立證明此定律，故得名哈代-溫伯格定律。主要用于描述群體中HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因頻率以及HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率之間的關(guān)系。內(nèi)容為：一個(gè)無窮大的群體在理想情況下進(jìn)行HYPERLINK/view/1363602.htmt_blank隨機(jī)交配，經(jīng)過

38、多代，仍可保持基因頻率與HYPERLINK/view/99532.htmt_blank基因型頻率處于穩(wěn)定的HYPERLINK/view/84757.htmt_blank平衡狀態(tài)1。在一對HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的情況下，基因p（HYPERLINK/view/1552488.htmt_blank顯性）與基因q（隱形）的基因頻率的關(guān)系為：（p+q）2=1二項(xiàng)展開得：p2+2pq+q2=1可見，式中“p2”為HYPERLINK/view/1457609.htmt_blank顯性純合子的比例，2pq為HYPERLINK/view/293127.htmt_b

39、lank雜合子的比例，“q2”為HYPERLINK/view/1457613.htmt_blank隱形純合子的比例。哈代-溫伯格定律在HYPERLINK/view/232535.htmt_blank多倍體等更加復(fù)雜的情況下也可應(yīng)用。例1一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中AA個(gè)體占30%，Aa的個(gè)體占60%，aa的個(gè)體占10%。計(jì)算A、a基因的頻率。剖析A基因的頻率為30%+1/260%=60%a基因的頻率為10%+1/260%=40%答案60%40%4高考信息HYPERLINK/view/553310.html#o編輯本段編輯例2（2006河北高考）在豚鼠

40、中，黑色對白色是顯性。如果基因庫中90%是HYPERLINK/view/551490.htmt_blank顯性基因B，10%是HYPERLINK/view/808569.htmt_blank隱性基因b，則HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中基因BB、Bb、bb的頻率分別是（）A81%18%1%B45%40%15%C18%81%1%D45%45%10%解題思路BB頻率為（90%）2=81%，bb頻率為（10%）2=1%，Bb頻率為290%10%=18%，故選A答案A某小島上原有果蠅20000只，其中HYPERLINK/view/142644.htmt_blank基

41、因型VV、Vv、vv的果蠅分別占15%、55%和30%。若此時(shí)從島外上入侵了2000只基因型為VV的果蠅，且所有果蠅均HYPERLINK/view/1363602.htmt_blank隨機(jī)交配，則F1中V的基因頻率約是多少？V基因頻率=(20000*15%*2+20000*55%+2000*2)/44000=47.7%5特殊情況HYPERLINK/view/553310.html#o編輯本段編輯值得注意的是在HYPERLINK/view/31204.htmt_blank二倍體基因中，帶有該HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的個(gè)體最多可能有2/5。如果HYPE

42、RLINK/view/87876.htmt_blank等位基因HYPERLINK/view/3844979.htmt_blank隨機(jī)分布的話，那么可以用HYPERLINK/view/392493.htmt_blank二項(xiàng)式定理來計(jì)算：HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群中32%的個(gè)體會是該HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的雜合體（帶有一個(gè)該等位基因和另一個(gè)變種）,4%的個(gè)體為該等位基因的純合體（帶有兩個(gè)該等位基因）。所以加起來就有36%的個(gè)體帶有該等位基因。然而，等位基因的HYPERLINK/view/3844979.htmt

43、_blank隨機(jī)分布是在選擇不參與和其他前提下成立的。當(dāng)這些前提成立時(shí)，一個(gè)HYPERLINK/view/43530.htmt_blank種群的狀態(tài)被稱為哈蒂溫伯格平衡（en:Hardy-Weinbergprinciple)。一個(gè)基因中所有HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因的頻率可以被繪制為等位基因分布HYPERLINK/view/663861.htmt_blank柱狀圖。HYPERLINK/view/33283.htmt_blank群體遺傳學(xué)研究的內(nèi)容包括影響HYPERLINK/view/87876.htmt_blank等位基因頻率的因素?fù)Q句話說，進(jìn)化。除

44、了自然和HYPERLINK/view/321381.htmt_blank人工選擇外，這些因素還包括HYPERLINK/view/16508.htmt_blank遺傳漂變、突變和遷移。多態(tài)信息量用于連鎖分析時(shí)對標(biāo)志基因（或標(biāo)志序列）的多態(tài)性估計(jì)，雜合度則用于群體遺傳學(xué)上對群體多態(tài)性的描述；前者主要服務(wù)于基因定位和產(chǎn)前診斷，而后者則可對進(jìn)化因子的效應(yīng)予以分析，兩者不僅含義不同，而且往往值也不同。本文對上述問題進(jìn)行了分析提出了自己的一些看法。HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=70158451t_blank多態(tài)信息含量（PICpolymorphismi

45、nformationcontent）:在HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=10625808t_blank連鎖分析中一個(gè)遺傳標(biāo)記HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=8437869t_blank多態(tài)性可提供的信息量的度量。它是一個(gè)親本為HYPERLINK/lemma/ShowInnerLink.htm?lemmaId=355361&ss_c=ssc.citiao.link雜合子，另一親本為不同基因型的概率?，F(xiàn)常用來衡量座位多態(tài)性高低的程度。HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=a

46、laddinl#32香農(nóng)-威納指數(shù)HYPERLINKjavascript:void(0)編輯本詞條缺少概述、名片圖，補(bǔ)充相關(guān)內(nèi)容使詞條更完整，還能快速升級，趕緊來編輯吧！中文名香農(nóng)-威納指數(shù)外文名ShannonWienerindex是用方法信息論方法提出者費(fèi)歇爾和普雷斯頓目錄1HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl1#1香農(nóng)-威納指數(shù)的公式及其含義2HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl2#2均勻性指數(shù)1香農(nóng)-威納指數(shù)的公式及其含義HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl#o編輯本段

47、編輯費(fèi)歇爾和普雷斯頓的方法所表示的多樣性指數(shù)僅包括種的多寡一方面。香農(nóng)-威納指數(shù)和辛普森指數(shù)則包括了測量HYPERLINK/view/43532.htmt_blank群落的異質(zhì)性。香農(nóng)-威納指數(shù)借用了信息論方法。信息論的主要測量對象是系統(tǒng)的序（order）或無序(disorder)的含量。在通訊工程中，人們要進(jìn)行預(yù)測，預(yù)測信息中下一個(gè)是什么字母，其不定性的程度有多大。例如，bbbbbbb這樣的信息流，都屬于同一個(gè)字母，要預(yù)測下一個(gè)字母是什么，沒有任何不定性，其信息的不定性含量等于零。如果是a，b，c，d，e，f，g，每個(gè)字母都不相同。那么其信息的不定性含量就大。在群落多樣性的測度上，就借用了這

48、個(gè)信息論中不定性測量方法，就是預(yù)測下一個(gè)采集的個(gè)體屬于什么種，如果群落的多樣性程度越高，其不定性也就越大。其中，H=樣品的信息含量（彼得/個(gè)體）=群落的多樣性指數(shù)，S=種數(shù)，Pi=樣品中屬于第i種的個(gè)體的比例，如樣品總個(gè)體數(shù)為N，第i種個(gè)體數(shù)為ni，則Pi=ni/N下面用一個(gè)假設(shè)的簡單數(shù)字為例，說明香農(nóng)一威納指數(shù)的含義，設(shè)有A，B，C三個(gè)群落，各有兩個(gè)種所組成，其中各種個(gè)體數(shù)組成如下：物種甲物種乙群落A100（1.0）0(0)群落B50(0.5)50(0.5)群落C99(0.99)1(0.01)括號內(nèi)數(shù)字即Pi因?yàn)槿郝銩的所有個(gè)體均屬于物種甲，沒有任何多樣性，從理論上說H應(yīng)該等于零，其香農(nóng)一威

49、納指數(shù)是：H=(1.0log21.0)+0）=0由于在群落B中兩個(gè)物種各有50個(gè)體，其分布是均勻的。它的香農(nóng)指數(shù)是：H=0.50（log20.50）+0.50（log20.50）=l群落C的兩個(gè)物種分別具有99和1個(gè)個(gè)體，則：H=一0.99（log20.99）+0.01（log20.01）=0.081顯然，H值的大小與我們的直覺是相符的：群落B的多樣性較群落C大，而群落A的多樣性等于零。2均勻性指數(shù)HYPERLINK/view/1900198.htm?fr=aladdinl#o編輯本段編輯在香農(nóng)-威納指數(shù)中，包含著兩個(gè)成分：種數(shù)；各種間個(gè)體分配的均勻性（equiability或evenness

50、）。各種之間，個(gè)體分配越均勻，H值就越大。如果每一個(gè)體都屬于不同的種，HYPERLINK/view/3850035.htmt_blank多樣性指數(shù)就最大；如果每一個(gè)體都屬于同一種，則其多樣性指數(shù)就最小。那么，均勻性指數(shù)如何來測定呢？可以通過估計(jì)群落的理論上的最大HYPERLINK/view/3850035.htmt_blank多樣性指數(shù)（Hmax），然后以實(shí)際的HYPERLINK/view/3850035.htmt_blank多樣性指數(shù)對Hmax的比率，從而獲得均勻性指數(shù)，具體步驟如下：Hmax=S（1/Slog21/S）=log2S，其中Hmax=在最大均勻性條件下的種多樣性值，S=群落中種

51、數(shù)如果有S個(gè)種，在最大均勻性條件下，即每個(gè)種有1/S個(gè)體比例，所以在此條件下Pi=1/S，舉例說，HYPERLINK/view/43532.htmt_blank群落中只有兩個(gè)種時(shí)，則：Hmax=log22=1這與前面的計(jì)算是一致的，因此，我們可以把均勻性指數(shù)定義為：E=H/Hmax，其中E=均勻性指數(shù)，H=實(shí)測多樣性值，Hmax=最大多樣性值=log2SSSR標(biāo)記HYPERLINKjavascript:void(0)編輯SSR(SimpleSequenceRepeats)標(biāo)記是近年來發(fā)展起來的一種以特異引物PCR為基礎(chǔ)的HYPERLINK/view/938289.htmt_blank分子標(biāo)記技

52、術(shù),也稱為HYPERLINK/view/365396.htmt_blank微衛(wèi)星DNA(MicrosatelliteDNA),是一類由幾個(gè)核苷酸（一般為16個(gè)）為重復(fù)單位組成的長達(dá)幾十個(gè)核苷酸的HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串聯(lián)重復(fù)序列.由于每個(gè)SSR兩側(cè)的序列一般是相對保守的HYPERLINK/view/1457586.htmt_blank單拷貝序列中文名SSR標(biāo)記外文名SimpleSequenceRepeats特征相關(guān)重復(fù)單位首尾相連、成串排列釋義以PCR為基礎(chǔ)的HYPERLINK/view/938289.htmt_blank分子標(biāo)記技術(shù)分類兩大類優(yōu)點(diǎn)四大

53、優(yōu)點(diǎn)應(yīng)用HYPERLINK/view/87880.htmt_blank遺傳圖譜的構(gòu)建、HYPERLINK/view/5628.htmt_blank指紋圖的繪制等目錄1HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1#1SSR標(biāo)記HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1_1#1_1簡介HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1_2#1_2特征HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl1_3#1_3分類2HYPERLINK/view/628299.htm?fr=alad

54、dinl2#2特點(diǎn)HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl2_1#2_1優(yōu)點(diǎn)HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl2_2#2_2應(yīng)用1SSR標(biāo)記HYPERLINK/view/628299.htm?fr=aladdinl#o編輯本段編輯簡介生物的基因組中，特別是高等生物的基因組中含有大量的重復(fù)序列14，根據(jù)重復(fù)序列在基因組中的分布形式可將其分為HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串聯(lián)重復(fù)序列和散布重復(fù)序列。特征其中，HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串聯(lián)重復(fù)序列是由相關(guān)

55、的重復(fù)單位首尾相連、成串排列而成的。分類目前發(fā)現(xiàn)的HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串聯(lián)重復(fù)序列主要有兩類：一類是由功能HYPERLINK/view/8563.htmt_blank基因組成的(如rRNA和HYPERLINK/view/837143.htmt_blank組蛋白基因)；另一類是由無功能的序列組成的。根據(jù)HYPERLINK/view/113693.htmt_blank重復(fù)序列的重復(fù)單位的長度，可將HYPERLINK/view/119373.htmt_blank串聯(lián)重復(fù)序列分為衛(wèi)星DNA、HYPERLINK/view/365396.htmt_blank微衛(wèi)

56、星DNA、HYPERLINK/view/3852020.htmt_blank小衛(wèi)星DNA等3。微衛(wèi)星DNA又叫HYPERLINK/view/3874643.htmt_blank簡單重復(fù)序列，指的是基因組中由16個(gè)HYPERLINK/view/117213.htmt_blank核苷酸組成的基本單位重復(fù)多次構(gòu)成的一段DNA，廣泛分布于基因組的不同位置，長度一般在200bp以下。研究表明，微衛(wèi)星在HYPERLINK/view/77362.htmt_blank真核生物的基因組中的含量非常豐富，而且常常是HYPERLINK/view/3844979.htmt_blank隨機(jī)分布于核DNA中15，38。在植物中通過對擬南芥7、玉米35、水稻11、小麥28，32，33等的研究表明微衛(wèi)星在植物中也很豐富，均勻分布于整個(gè)植物基因組中，但不同植物中微衛(wèi)星出現(xiàn)的HYPERLINK/view/30964.htmt_blank頻率變化是非常大的，如在主要的農(nóng)作物中兩種最普遍的二HYPERLINK/view/117213.htmt_blank核苷酸重復(fù)單位(AC)n和(GA)