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生物化學(xué)與分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)1.分光光度計(jì)(1)基本理(1)基本理:溶液溶質(zhì)在其定波長(zhǎng)的吸收光中,其吸光度值與液層厚度和溶液濃度的乘積成正比,即遵循朗伯一比爾定律,通過也在一定液體厚度時(shí)測(cè)定其吸光度來與標(biāo)準(zhǔn)曲線比較從而測(cè)得待測(cè)液溶質(zhì)濃度。(2)吸光度與液層厚度和溶液濃度的乘積成正比,稱為朗伯一比爾定律,簡(jiǎn)稱比爾定律,即光的吸收定律。其數(shù)學(xué)表達(dá)式為:A=-lgT=ebcA:吸光度,又稱光密度"O.D";「吸光系數(shù)(L-mol-i-cm-i);比例常數(shù),稱吸光系數(shù)b:樣品光程(cm),通常使用1.0cm的吸收池,則b=1cm;c:樣品濃度(mol/L工吸光度“A”具有加和性,即混合物的總吸光度等于溶液中的各組份各自在該波長(zhǎng)下吸光度的算術(shù)和。這是多元混合物分光光度法定量分析的基礎(chǔ)。若溶液中各溶質(zhì)的吸光系數(shù)£相同,則各溶質(zhì)吸光度的大小與溶質(zhì)濃度成比例。例:尿嘧啶核昔酸溶液用1cm石英吸收池測(cè)定260nm的吸光度為0.650,用同一吸收池測(cè)定純?nèi)軇┑奈舛葹?.070,已知其摩爾吸光系數(shù)=8.2x103M-icm,計(jì)算其摩爾濃度.vA=£bC??八二(溶劑加樣品的吸光度)-(溶劑的吸光度)aA=0.650-0.070=0.580vb=1cm.?.C==7.1x10-5mol/L(2)等電點(diǎn)的計(jì)算方法;標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作(1)配置一系列濃度不同的標(biāo)準(zhǔn)溶液。(2)在測(cè)定條件相同的情況下,分別測(cè)定其吸光度。(3)以標(biāo)準(zhǔn)溶液濃度為橫坐標(biāo)(不必考慮顯色劑等引起的濃度變化),以相應(yīng)的吸光度為縱坐標(biāo),繪制A-C關(guān)系圖。(4)在相同條件下測(cè)出樣品溶液的吸光度,從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出濃度。2、酪蛋白的提取過程:牛乳2nli七水浴獲熱]必H(4)在相同條件下測(cè)出樣品溶液的吸光度,從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出濃度。2、酪蛋白的提取過程:牛乳2nli七水浴獲熱]必H中<jial熨?zèng)_液F1M詼熱〉用油管加入11AC短沖懣為2nli U>離心,,5分鐘(1).原理;牛乳中主要的蛋白質(zhì)是酪蛋白,它是一些含磷蛋白質(zhì)的混合物,等電點(diǎn)為4.8。近淀用4nuL蒸鐲水洗濯離心徒/分盧先沖〔除譏院中可溶物)近程9b%N南0I洗滌離心,IQQQCtt/分,吊分鐘(陳膈)沉淀W.ltnoilXLX30H2ttil力至lOrnl沉淀內(nèi)耐4ml選泮離心,IflOOOK■分,5分鐘[脫水)潔液潔、液利用蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)時(shí)溶解度最低的性質(zhì),將牛乳的PH調(diào)至4.8時(shí),酪蛋白就沉淀出來。用乙醇洗滌沉淀物,除去脂類雜質(zhì)后便可得到純化的酪蛋白。(2).主要試劑:牛乳醋酸鈉緩沖液0.2M,PH4.6,乙醇,乙醚,氫氧化鈉PPT后面問題:(1)醋酸緩沖液、蒸餾水、乙醇、丙酮洗滌沉淀的目的分別是什么?醋酸緩沖液:調(diào)節(jié)PH到等電點(diǎn)4.8。蒸餾水:出去沉淀中的可溶物。乙醇:除去沉淀中的脂類物質(zhì)。丙酮洗滌:脫水。(2)最后所得的沉淀中加入0.1m。l/LNaOH的作用是什么?酪蛋白是酸性蛋白質(zhì),溶解于堿性溶液中,方便下次雙縮脲法測(cè)定。(3)制備高產(chǎn)率酪蛋白的關(guān)鍵是什么?剛開始時(shí)對(duì)牛奶的ph的調(diào)節(jié),最好是調(diào)節(jié)到4.7,越接近越好,這是最主要的。(4)請(qǐng)?jiān)O(shè)計(jì)另一種提取酪蛋白的方法。1、向酪蛋白溶液中加入高濃度(NH4)2SO4溶液2、10000轉(zhuǎn)/分,5分鐘,去上清液3、95%乙醇4ml洗滌離心,10000轉(zhuǎn)/分,5分鐘,去上清液4、丙酮4ml洗滌離心,10000轉(zhuǎn)/分,5分鐘,去上清液5、0.1mol/LNaOH2ml加水至10ml3、雙縮脲法測(cè)蛋白質(zhì)含量(1).蛋白質(zhì)測(cè)定的5種方法:凱式定氮法(Kjedahl法)紫外吸收法雙縮脲法(Biuret法)Folin-酚試劑法(Lorry法)考馬斯亮藍(lán)法(Bradford法)思緒二五種不同蛋白質(zhì)含量測(cè)定方法的比較方法靈敏度時(shí)同原理干擾物質(zhì)說明凱氏定氮注(Kjedahte)靈敏度相,,適用于口上~1.0電且氮1景若為±2%費(fèi)時(shí)8—10小時(shí)將費(fèi)白氮酎化為氨L用酸吸收后浦定北串白氮(可用ica沉浣里白質(zhì)而分離)用丁標(biāo)在樂白質(zhì)含量的暹確測(cè)定;十?dāng)_少;費(fèi)時(shí)太長(zhǎng)雙縮服法(Biuret^)靈敏度低工--20mg中速多肽犍+喊性Cu?T紫色絡(luò)合物硫酸鉉二如緩沖液,某些氨基酸用于快速測(cè)定,但不太靈敏;不信蛋白質(zhì)顯色相似紫外吸收法較為靈敏到快速5—10■各種法白質(zhì)中的T燈和Trp殘基在280nm士卜的引1吸收喋1鉗W密麻;各種核甘酸用于層析柱流出強(qiáng)的檢根h梯&的吸收可校正Folin-醐試劑法[Lgriy法》靈敢度回-T世g慢速4。?石儕鐘雙縮眠反應(yīng);璘相酸一硝4懶試劑被T/和Ph。耕硫酸餒:Tris緩沖液用氨釀;各種旃耗費(fèi)時(shí)間L操作要嚴(yán)格計(jì)M;顏色深淺隨不同走白質(zhì)變化老馬斯犬聶法(Bradford^)靈敏度最圖快速5?1S考弓斯虎籃染料與蛋白質(zhì)結(jié)合產(chǎn),其丸oiax由465um變?yōu)?Htim強(qiáng)減注第中Vfe;TritonX-100;SDS最好的方法;干擾物質(zhì)少3顏色檢定,顏色深淺隨不同蛋白質(zhì)變化TCA:三氯乙酸4.考馬斯克藍(lán)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量實(shí)驗(yàn)步驟管等標(biāo)潴蛋白質(zhì)(0.1管等標(biāo)潴蛋白質(zhì)(0.1mg--t-nr)未知蛋白質(zhì)蒸幄水考馬斯亮曾G-250充分振蕩混勻后k2分鐘于595HII1處比色n以蛋白質(zhì)嫉里知釉,吸光度月為許W-以蛋白質(zhì)嫉里知釉,吸光度月為許W-繪能師淮求出樣后睡白質(zhì)含量〃原理:考馬斯亮藍(lán)G-250染料,在酸性溶液中與蛋白質(zhì)結(jié)合,染料主要是與蛋白質(zhì)中堿性氨基酸和芳香氨基酸殘基結(jié)合,使染料最大吸收峰位置由465nm變?yōu)?95nm,溶液的顏色也由棕黑色變?yōu)樗{(lán)色。在595nm下測(cè)定的吸光度A595,與蛋白質(zhì)濃度成正比。⑴.干擾物質(zhì)有哪些?TritonX-100、SDS、強(qiáng)堿性緩沖液等.G250與R250的區(qū)別:比考馬斯亮藍(lán)R250多二個(gè)甲基,染色靈敏度不如R250,但比氨基黑高3倍。優(yōu)點(diǎn)在于它在三氯乙酸中不溶而成膠體,能選擇地染色蛋白而幾乎無本底色。所以常用于需要重復(fù)性好和穩(wěn)定的染色,適于作定量分析。⑶所后的4個(gè)思考題。說明各種蛋白質(zhì)含量測(cè)定法中哪幾種可以測(cè)出蛋白質(zhì)的絕對(duì)含量哪幾種只能測(cè)定其相對(duì)含■,為什么?只有凱氏定氮法可以測(cè)定蛋白質(zhì)的絕對(duì)含量,因?yàn)槊?.25蛋白質(zhì)含1g氮,試驗(yàn)中可以除去非蛋白氮,所以,通過氮含量的測(cè)定,可以得到蛋白質(zhì)的絕對(duì)含量。其他的幾種方法,由于都使用了標(biāo)準(zhǔn)蛋白制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,所以,所測(cè)得的未知蛋白的含量,都是相對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)蛋白含量而言的??捡R斯克藍(lán)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量使用的局限性有哪些?(1)由于各種蛋白質(zhì)中的精氨酸和芳香族氨基酸的含量不同,因此Bradford法用于不同蛋白質(zhì)時(shí)有較大的偏差,最好選用與待測(cè)樣品氨基酸成份相同的標(biāo)準(zhǔn)蛋白。(2)仍有一些物質(zhì)干擾此法的測(cè)定,主要的TritonX-100、SDS、強(qiáng)堿性緩沖液等。(3)標(biāo)準(zhǔn)曲線也有輕微的非線形,因而不能用比爾定律進(jìn)行計(jì)算而只能用標(biāo)準(zhǔn)曲線來測(cè)定未知蛋白質(zhì)的濃度。在實(shí)驗(yàn)中,使用的水一定是蒸餾水嗎?為什么?因?yàn)锽radford檢測(cè)中要用的試劑配制標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作都要用到水.如果不是使用蒸餾水,可能水里面會(huì)有一些游離的離子或者電解質(zhì)會(huì)影響試劑配制的準(zhǔn)確性,干擾實(shí)驗(yàn)結(jié)果.而水中殘留的有機(jī)物等可能會(huì)和考馬斯亮藍(lán)發(fā)生變色反應(yīng)這樣制作的標(biāo)準(zhǔn)曲線會(huì)比實(shí)際值偏高,導(dǎo)致最終濃度檢測(cè)的結(jié)果比實(shí)際結(jié)果偏低。SDS干擾考馬斯克藍(lán)法測(cè)定蛋白質(zhì)含量的原理是什么?當(dāng)溶液中存在一定量的SDS后所測(cè)得的吸光度比正常值相對(duì)減小。但是隨著SDS濃度的增加,吸光度的減小量應(yīng)沒有呈現(xiàn)出很明顯的規(guī)律。由于SDS的存在,阻礙了染料與堿性氨基酸和芳香族氨基酸的結(jié)合使得吸光度減小。由于SDS與染料分子對(duì)蛋白質(zhì)的競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合,使得顯色減弱,吸光度值降低,因此在曲線前段呈下降趨勢(shì);但由于SDS破壞氫鍵,使得蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)更加伸展,一些原來包裹在結(jié)構(gòu)中的堿性氨基酸和芳香族氨基酸暴露出來,所以會(huì)有少量的吸光度回升;
但最終SDS與蛋白質(zhì)的結(jié)合達(dá)到所處溶液條件下的“飽和"時(shí),過量的SDS就不起作用了,曲線是最后為平緩段。要去除SDS的干擾,可以利用它與K+結(jié)合生成沉淀的性質(zhì)將其去除。K+對(duì)考馬斯亮藍(lán)方法不產(chǎn)生干擾。5、醋酸纖維薄膜電泳原理:生物分子在某個(gè)特定的pH值下可以帶正電或負(fù)電,在電場(chǎng)的作用下,這些帶電分子會(huì)向著與其所帶電荷極性相反的電極方向不同分子以不同速度移動(dòng)。電泳影響因素: 蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中移動(dòng)的速度取決于蛋白質(zhì)所帶的電荷性質(zhì)、數(shù)量、自身大小和形狀;此外還受外界因素的影響如,電場(chǎng)強(qiáng)度、溶液的PH、離子強(qiáng)度等。.結(jié)合實(shí)驗(yàn)報(bào)告冊(cè),回憶操作過程,首先醋酸纖維薄膜先看粗糙面,在粗糙面上畫點(diǎn)樣線,畫好后做標(biāo)記,泡在緩沖溶液中浸泡完全(上面無白斑,然后點(diǎn)樣,點(diǎn)樣后放掉電泳槽中電泳,電泳后染色,然后脫色。(熟悉整個(gè)過程,如果把過程打亂,能否正確排序?)(選擇題)3、平衡工3、平衡工無光澤面朝下,點(diǎn)樣例位于陰極(5nir)4、電泳:打開電源,U=160丫或1=1.刎t=45—50tnin:小時(shí)5、染色;氨基黑IOB染色充分,5—lOuiit6、漂洗:3—4個(gè)漂洗皿,洗去蝴至背景無色.實(shí)驗(yàn)操作1、準(zhǔn)備(1)電泳儀的準(zhǔn)備⑵薄膜的準(zhǔn)備:■在薄膜無光澤面標(biāo)H點(diǎn)樣位置■將薄膜置于巴比妥緩沖液中浸泡2,點(diǎn)樣(1)無光澤面朝上,吸去多余Buffer,色,用蓋城片播取少量血.蒙,垂直印在劃稿處.lew注意,不能超出邊緣;不能重豆點(diǎn)樣;必須與邊緣中行要適量、均勻和垂直,并避免弄破薄膜,結(jié)果是5條帶,哪條帶最接近點(diǎn)樣線,哪條線最遠(yuǎn)。要求會(huì)畫圖,畫圖要記得畫點(diǎn)樣醋酸纖維薄膜法顯示血清蛋白質(zhì)從正極起依次為白蛋白、al壬蛋白、a2聲蛋白、回白和下-球蛋白五條區(qū)帶口白茶口=Bal-5^蛋白垢自=3R-整系口厚冢白點(diǎn)樣處I !三里殍、線。.血清蛋白的臨床意義。組成:白蛋白、a1、a2、B和y-球蛋白;功能:維持血漿膠體滲透壓;調(diào)節(jié)血漿pH值,維持酸堿平衡;運(yùn)輸營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)、代謝物、激素、藥物及金屬離子等;免疫作用。血清蛋白是血漿中最主要的固體成分,含量為60~80g/L減少:長(zhǎng)期慢性發(fā)熱、大面積燒傷(白細(xì)胞增多),惡性腫瘤、肝癌(淋巴細(xì)胞和核細(xì)胞增多),肝功能嚴(yán)重受損、肝壞死、肝硬化(谷丙轉(zhuǎn)氨酶增多),甲狀腺功能亢進(jìn)、漿膜滲出性損害、結(jié)核病、慢性腹瀉、慢性肝炎、腎病綜合征、吸收不良綜合征,營(yíng)養(yǎng)不良、貧血(紅細(xì)胞,紅蛋白稍偏低)等。增加:大量出汗、多發(fā)性骨髓瘤、腹瀉、巨球蛋白血癥、嚴(yán)重嘔吐、中毒等。6、血糖測(cè)定(吳憲血糖測(cè)定法)⑴.吳憲血糖測(cè)定法的優(yōu)勢(shì)(波長(zhǎng)620nm):優(yōu)點(diǎn):靈敏度高,比雙縮尿法靈敏得多工作原理:葡萄糖+Cu(OH)2 - Cu2OlCu2O +磷鉬酸一鉬藍(lán)鉬藍(lán)的藍(lán)色深淺與葡萄糖的含量成正比所以可以用比色法來測(cè)定鉬藍(lán)的光吸收值來測(cè)定血糖的含量(波長(zhǎng)620nm)。(2)為什么選用無蛋白血濾液?有蛋白的話會(huì)與堿性銅試劑發(fā)生雙縮脲反應(yīng),也呈藍(lán)色,干擾最后的結(jié)果(3)水浴8min后,取出為何切記搖動(dòng)? 氧化亞銅易已被氧化(4)空腹血糖的正常范圍:一般空腹全血血糖為3.9?6.1mmol/L(70?110毫克/分升),血漿血糖為3.9?6.9mmol/L(70?125毫克/分升)??崭谷侵?.7mmol/L(120毫克/分升)、血漿血糖"8mmol/L(140毫克/分升),2次重復(fù)測(cè)定可診斷為糖尿當(dāng)空腹全血血糖在5.6mmol/L(100毫克/分升)以上,血漿血糖在6.4mmol/L(115毫克/分升)以上,應(yīng)做糖耐量試驗(yàn)。當(dāng)空腹全血血糖超過11.1mmol/L(200毫克/分升)時(shí),表示胰島素分泌極少或缺乏。因此,空腹血糖顯著增高時(shí),不必進(jìn)行其它檢查,即可診斷為糖尿病。(5)PPT后的3個(gè)思考題Folin-吳憲法為什么要用無蛋白血濾液?有蛋白的話會(huì)與堿性銅試劑發(fā)生雙縮脲反應(yīng),也呈藍(lán)色,干擾最后的結(jié)果Folin-吳法測(cè)定血糖的優(yōu)缺點(diǎn)是什么優(yōu)點(diǎn):靈敏度高,比雙縮尿法靈敏得多,缺點(diǎn)是費(fèi)時(shí),要精確控操作時(shí)間,標(biāo)準(zhǔn)曲線也不是嚴(yán)格的直線形式,且專一性比較差,干擾物質(zhì)比較多進(jìn)行比色法測(cè)定時(shí),如果測(cè)得樣品的A值超過100%,該如何處理,為什么?測(cè)得樣品值超過100%是因?yàn)橛衅渌€原物質(zhì),使其待測(cè)液中血糖的濃度過高所造成的,應(yīng)該將待測(cè)液稀釋后再進(jìn)行比色。7、谷丙氨酸酶的臨床意義;臨床意義丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶(AlanineTransaminase,ALT)谷丙轉(zhuǎn)氨酶(GlutamicpyruvicTransaminase,GPT)ALT(GPT)廣泛存在于機(jī)體各種組織中,但在肝細(xì)胞中含量最多.當(dāng)肝臟有病變,特別是急性肝炎及肝細(xì)胞抹死,血清中谷丙轉(zhuǎn)氨疇活性顯著升高.在肝癌.肝硬變以及膽道疾睛時(shí),此峰活性也可中度或輕度增高.(11谷丙氨酸酶的測(cè)定方法;知道什么是賴氏法,什么是改良賴氏法?拉門氏法分光光度法谷氮酸十拉門氏法分光光度法谷氮酸十丙酮酸-賴氏法(Reitman)本身并未對(duì)普氨彝活,性單位提出規(guī)定,吊包是_用卡門氏法(Karman)來定單隹的門即用卡門氏法所,測(cè)出的單餞據(jù)H自當(dāng)于林氏法所產(chǎn)生的丙陋酸量的相關(guān)系藪,受用卡門氏單4立而來^山由此可見,刑定向,一份血清的樗-氫酶活?吐,用不同方法測(cè)笄,其值不一樣“因而它們的工帑值危國(guó)也可南疆著.差異.(21改良后的方法優(yōu)勢(shì)在哪?.反應(yīng)溫度:40℃改為37℃;.底物濃度:高改低;.套用卡門氏單位,與速率法一致,反映了酶的真實(shí)活性(3人在做實(shí)驗(yàn)時(shí)用到。一酮戊二酸、丙酮酸、硝基苯肼,他們的原理以及試劑的作用;(4\該實(shí)驗(yàn)的注意事項(xiàng):2,4-二硝基苯肼可與有酮基的化合物作用形成苯腙硝醌化合物;溶血標(biāo)本不宜采用,因血細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)氨酶活力較高,影響測(cè)定結(jié)果;在測(cè)定時(shí),如酶活力較大(大于150KarU),應(yīng)將樣品稀釋后再進(jìn)行測(cè)定。(51PPT后的6個(gè)思考題1、ALT的臨床意義?AST的測(cè)定對(duì)于肝病的診斷具有十分重要的意義,特別是AST/ALT比值大小對(duì)于臨床判定肝病嚴(yán)重程度具有十分重要的意義,是臨床診治肝病的重要指標(biāo)之一2、血清谷丙轉(zhuǎn)氨酶測(cè)定的注”項(xiàng)?以及為何要避免溶血?常溫下標(biāo)本不宜久存,(2)嚴(yán)重脂血、黃疸、溶血和糖尿病酮癥酸中毒病人血清標(biāo)本可增加測(cè)定的吸光度,測(cè)定這類標(biāo)本應(yīng)做血清標(biāo)本對(duì)照組(3)當(dāng)標(biāo)本的酶活性超過150K時(shí),應(yīng)將血清中用0.145mol/L氯化鈉稀釋重做,其結(jié)果乘以稀釋倍數(shù)(4)酮戊二酸,2,4-二硝基甲苯肼是直接顯色物,NAOH的濃度與顯色深淺有關(guān),因此它們的濃度必須很準(zhǔn)確(5)丙酮酸標(biāo)準(zhǔn)濃度要求十分精確(6)加入2,4-二硝基苯肼溶液之后應(yīng)充分混勻當(dāng)溶血之后,紅細(xì)胞中的ALT會(huì)進(jìn)入血液中,導(dǎo)致測(cè)得的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)較大,不符合實(shí)際情況3、對(duì)照管的意義是什么?減少非試驗(yàn)因素對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響4、底物液為何要37℃預(yù)溫5min?人體的體溫為37℃,只有在此溫度下酶的活性才會(huì)達(dá)到最大,因此必須先讓酶的活性達(dá)到最大才與底物反應(yīng)5、為什么在制作標(biāo)準(zhǔn)曲線時(shí)要加入基質(zhì)液?使反應(yīng)的溶液體積相同,減少因體積不同而造成的實(shí)驗(yàn)非決定性因素的影響6、為什么在制作標(biāo)準(zhǔn)曲線時(shí)加入基質(zhì)液的體積不同,對(duì)反應(yīng)沒有影響?基底液與底物和酶都不反應(yīng),它的作用只是調(diào)節(jié)溶液的體積酶活性的單位:國(guó)際單位:1961年酶學(xué)委員會(huì)建議使用統(tǒng)一單位,在規(guī)定條件下,1分鐘內(nèi)轉(zhuǎn)化1pmol底物所需的酶量,稱為一個(gè)國(guó)際單位(IU,又稱U)。
卡門氏單住的定義為;在紫外分光用度計(jì)中,1ml血清(反應(yīng)謬液思量為3mL)在34Onm波長(zhǎng)下,用內(nèi)程為L(zhǎng)0cm的比色皿,在25XJ,1分鐘內(nèi)生般的丙酮酸,在乳酸脫氫晦催4匕下,在NADH+H*變成NAD+,使光密度下降CL001為1個(gè)轉(zhuǎn)氨醯活牲單住。GPT丙氮酸+B-酮戊一一酸- '?省氨酸十丙酮酸■N.4DH在260nm和340nm處備有一吸q史上粉、而NAD+只有260nm一一處吸耳文心至、國(guó)止匕以NA口II為輔彝的答種脫氫酶.都可通過340nm龍吸收值的法變,定量測(cè)定崎法力.8、豬肝DNA基因組DNA的提取取一支WmlEF管.裝入鞭狀物(基本NAJDH+H+乳酸脫氫酶NAI>++乳酸制備DNA溶液工DNA沉淀溶于O.zLmol/L的NQH<lmL>在沉淀中加入NAJDH+H+乳酸脫氫酶NAI>++乳酸制備DNA溶液工DNA沉淀溶于O.zLmol/L的NQH<lmL>在沉淀中加入N3C1-EDTA溶液洗2次,FW_t/SijC?將沉淀懸于:LOmlNmCI-EDTA溶液中,分裝于2支TOnilEP管離心二4ODOrpimr5min<.絲狀物)t小心吸出上層清液,向上清液中加入1.5—N倍體積的95%乙醇每管痼力[llnil250/oSDS溶液,邊加邊振蕩緩◎加入約1倍體型的氯仿虎醉海合液,蝴蝶形振薄5m『n,離心1口riiin(lOOOOrpm>*6Q1?水塔10Ei門(不停振蕩)5mol/lNaCI迷5mIn,1mL,蝴蝶形振肝臟口NA提取的流程圖實(shí)驗(yàn)原理一定要掌握。提取過程中用到的試劑作用;(1)實(shí)驗(yàn)原理:DNA與RNA的分離:DNP在0.14MNaCl鹽溶液中溶解度很低,而RNP則溶于0.14MNaCl鹽溶液,利用這一性質(zhì)可將生物組織中的DNA與RNA分開。DNA在高濃度的鹽溶液中溶解度最大。去除DNP中的蛋白:SDS使之變性除去(同時(shí)破壞核酸分解酶。進(jìn)一步純化則利用氯仿-異戊醇震蕩除蛋白,震蕩時(shí),蛋白質(zhì)變性,形成凝膠,并與DNA分開,DNA則留在水層中。沉淀DNA:利用DNA不溶于乙醇,因而用乙醇將DNA從溶液中沉淀出來。提取過程中用到的試劑作用1、取新鮮豬肝4g,用0.14mol/LNaCl-0.15mol/LEDTA溶液洗去血液,剪碎。加入10mL0.14mol/LNaCl-0.15mol/LEDTA溶液,置勻漿器中研磨。(初步破碎細(xì)胞入(已做)2、取一支10mLEP管,裝入糊狀物(基本裝滿),離心5min(10000rpm),棄去上清液。沉淀用0.14mol/lNaCl-0.15mol/LEDTA溶液洗兩次。每次加入溶液后用吸管吹打均勻再離心(同上),直到上清液無血細(xì)胞。棄上清液,所得沉淀為DNP(DNA蛋白復(fù)合物)粗制品3、向上述沉淀物加入0.14mol/LNaCl-0.15mol/LEDTA溶液5mL,然后每管滴加25%的SDS溶液1mL,邊加邊振蕩。加畢,置60℃水浴10min(不停振蕩),直至溶液變得粘稠并略透明,取出冷卻至室溫。此步驟使核酸與蛋白質(zhì)分離。4、每管加入5mol/lNaCl溶液2mL,蝴蝶形振蕩5min。加入約1倍體積的氯仿一異戊醇混合液,蝴蝶形振蕩5min,離心10min(4000rpm)。(此步驟后溶液分三個(gè)相:上層水相(DNA);中層變性蛋白質(zhì)相;下層有機(jī)相和殘余的RNA。)5、吸出上清液,棄去沉淀。向上清液中緩慢加入1.5—2倍體積的95%乙醇,DNA沉淀析出,[離心(4000rpm)5min]用玻棒攪出的絲狀物則為粗DNA6、制備DNA溶液:用0.1mol/L的NaOH1mL,溶解DNA沉淀,為下次的《DNA含量測(cè)定》提供材料PPT^MS^fi.核酸提取中SDS、氯仿-異戊醇各有什么作用?SDS是陰離子去污劑,作為變性劑和助溶試劑,它能斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,破壞蛋白分子的二、三級(jí)結(jié)構(gòu)。而強(qiáng)還原劑如巰基乙醇,二硫蘇糖醇能使半胱氨酸殘基間的二硫鍵斷裂。在樣品和凝膠中加入還原劑和SDS后,分子被解聚成多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈和SDS結(jié)合成蛋白-SDS膠束,所帶的負(fù)電荷大大超過了蛋白原有的電荷量,這樣就消除了不同分子間的電荷差異和結(jié)構(gòu)差異。氯仿可去除DNA溶液中微量酚的污染,異戊醇還可減少蛋白質(zhì)變性操作過程中產(chǎn)生的氣泡.結(jié)合本人操作的體會(huì),試述在提取過程中應(yīng)應(yīng)該注意些什么?且如何避免大分子DNA的降解和斷裂?震蕩過程中力度不能過大,力度過大會(huì)導(dǎo)致DNA分子斷裂,也會(huì)影響實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。離心時(shí)間應(yīng)適合,時(shí)間太長(zhǎng)可能會(huì)導(dǎo)致DNA分子斷裂,時(shí)間太短,會(huì)導(dǎo)致DNA分子不能得以與蛋白質(zhì)分離,水浴時(shí)間與溫度應(yīng)該適宜,溫度為65度時(shí)間為6分鐘最適合。.核酸提取過程中,除去雜蛋白的方法主要有哪幾種?4種:紫外線吸收法,定磷法,二苯胺法,地衣酚(苔黑酚)法.預(yù)習(xí):核酸定量測(cè)定方法有幾種?9、DNA樣品含量的測(cè)定(有5種方法;我們做了紫外法和二苯胺法,其他方法要掌握實(shí)驗(yàn)原理,做實(shí)驗(yàn)的兩種方法不僅要掌握實(shí)驗(yàn)原理,還要掌握操作過程。)二苯胺法實(shí)驗(yàn)原理脫氧核糖核酸中的2-脫氧核糖在酸性環(huán)境中與二苯胺試劑一起加熱產(chǎn)生藍(lán)色反應(yīng),在595nm處有最大光吸收。DNA在40-400ug范圍內(nèi),光吸收與DNA的濃度成正比。在反應(yīng)液中加入少量乙醛,可以提高反應(yīng)靈敏度。除DNA外,脫氧木糖、阿拉伯糖也有同樣反應(yīng)。其他多數(shù)糖類,包括核糖在內(nèi),一般無此反應(yīng)。紫外吸收法實(shí)驗(yàn)原理DNA和RNA都有吸收紫外光的性質(zhì),它們的吸收高峰在260nm波長(zhǎng)處。吸收紫外光的性質(zhì)是瞟呤環(huán)和嘧啶環(huán)的共軛雙鍵系統(tǒng)所具有的,所以瞟呤和嘧啶以及一切含有它們的物質(zhì),不論是核昔、核昔酸或核酸都有吸收紫外光的特性10、質(zhì)粒DNA提?。ㄕ莆諏?shí)驗(yàn)原理,試劑的作用;什么叫做質(zhì)粒?質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)?質(zhì)粒有什么特點(diǎn)?我們用堿裂解法,該法中用到溶液1、溶液2、溶液3的主要成分和作用;以及最后的實(shí)驗(yàn)步驟和注意事項(xiàng);PPT后的3個(gè)思考題。)二苯胺法實(shí)驗(yàn)原理脫氧核糖核酸中的2-脫氧核糖在酸性環(huán)境中與二苯胺試劑一起加熱產(chǎn)生藍(lán)色反應(yīng),在595nm處有最大光吸收。DNA在40-400ug范圍內(nèi),光吸收與DNA的濃度成正比。在反應(yīng)液中加入少量乙醛,可以提高反應(yīng)靈敏度。除DNA外,脫氧木糖、阿拉伯糖也有同樣反應(yīng)。其他多數(shù)糖類,包括核糖在內(nèi),一般無此反應(yīng)。質(zhì)粒是一類存在于細(xì)菌和真菌細(xì)胞中具有自主復(fù)制能力的、共價(jià)閉合環(huán)狀超螺旋結(jié)構(gòu)的小型DNA分子。堿裂解法提取質(zhì)粒是實(shí)驗(yàn)室常用的方法這種方法是根據(jù)共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒DNA與線性染色體DNA在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)特點(diǎn):1、染色體外的小型DNA分子;2、共價(jià)閉合環(huán)狀超螺旋結(jié)構(gòu)3、自主復(fù)制。作用:1、外源DNA的載體2、保存基因3、表達(dá)蛋白用堿裂解法,該法中用到溶液1、溶液2、溶液3的主要成分和作用;溶液工:由葡萄糖、EDTATris-HCl組成(保護(hù)、緩沖)50mmol/L葡萄糖的作用是增加溶液的粘度(懸浮細(xì)胞)25mmol/LEDTA的作用是絡(luò)合掉鎂等二價(jià)金屬離子,防止DNA酶對(duì)質(zhì)粒分子的降解作用(保護(hù)作用)10mmol/LTris-HCl使溶菌液維持溶菌作用的最適PH范圍(緩沖作用)溶液11:由SDS(十二烷基硫酸鈉)與NaOH組成(裂解、變性)0.2mol/LSDS:?1%NaOH(PH>12):破壞細(xì)胞膜,裂解細(xì)胞注意:堿裂解的時(shí)間不要太長(zhǎng),以免基因組DNA斷裂成小片段。溶液111:3mol/LHAc(pH4.8)和3mol/LKAc組成的高鹽溶液(復(fù)性,分離)HAc溶液能中和溶液^的堿性,使染色體DNA變性而發(fā)生纏繞,并使質(zhì)粒DNA復(fù)性。KAc會(huì)與SDS形成溶解度很低的鹽POD(十二烷基磺酸鉀),并與蛋白質(zhì)形成沉淀而除去溶液中的DNA也會(huì)與蛋白質(zhì)6。5復(fù)合物纏繞成大分子而與小分子質(zhì)粒DNA分離。PPT后的3個(gè)思考題。質(zhì)粒提取除了堿裂解法,還有其他什么方法?各種方法的優(yōu)缺點(diǎn)?核酸提取過程中,除去雜蛋白的方法主要有哪幾種?如果質(zhì)粒DNA中有蛋白質(zhì)殘留,如何判斷?在提取過程中應(yīng)如何避免大分子DNA的降解和斷裂?11、PCR技術(shù)(知道操作中加了哪些試劑?試劑的作用是什么?PCR的原理主要是3個(gè)步驟:變性,退火,延伸。過程是什么樣的?PCR的特性。)(11過程:首先95℃預(yù)變性設(shè)置1min,1min后94℃30s進(jìn)入變性過程;然后是退火52℃30min;然后引物的延伸,72℃30s,從這開始循環(huán),72℃10min,最后0℃保溫。(2)、試劑的作用是什么?(一)DNAB^BTaqDNA聚合酶的用量為1~2.5U/100ul,酶的濃度偏高,非特異性的產(chǎn)物將會(huì)增加,若酶的濃度偏低,側(cè)合成產(chǎn)物偏少。TaqDNA聚合酶可分為兩大類:1、具有校正功能的(有3'-5'核酸酶活性)比如:Vent,pfu,pwo等2、不具有校正功能的(無3'-5'核酸酶活性)比如:一般的TaqDNA聚合酶(二)模板核酸模板的量與純化程度,是PCR成敗與否的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,傳統(tǒng)的DNA純化方法通常采用SDS和蛋白酶K來消化處理標(biāo)本。一般臨床檢測(cè)標(biāo)本,可采用快速簡(jiǎn)便的方法溶解細(xì)胞,裂解病原體,消化除去染色體的蛋白質(zhì)使靶基因游離,直接用于PCR擴(kuò)增。RNA模板提取一般采用異硫氨酸胍或蛋白酶K法,要防止RNase降解RNA。(三)引物引物是待擴(kuò)增核酸片段兩端的已知序列,它決定了PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的大小,引物的選擇是整個(gè)PCR反應(yīng)的關(guān)鍵,引物的優(yōu)劣直接關(guān)系到PCR的特異性及成功與否。 引物是PCR特異性反應(yīng)的關(guān)鍵,PCR產(chǎn)物的特異性取決于引物與模板DNA互補(bǔ)的程度。(21PCR的原理主要是3個(gè)步驟:變性,退火,延伸。過程是什么樣的?過程:首先95℃預(yù)變性設(shè)置1min,1min后94℃30s進(jìn)入變性過程然后是退火52℃30min;然后引物的延伸,72℃30s,從這開始循環(huán),72℃10min,最后0℃保溫1、模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;2、模板DNA與引物的退火:模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;3、引物的延伸:DNA模板-引物結(jié)合物在Ta
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