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優(yōu)選蛋白質(zhì)研究方法演示文稿目前一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1蛋白質(zhì)提取分離要研究蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,通常需要從某一復(fù)雜的體系中分離純化目的蛋白。蛋白質(zhì)種類很多,性質(zhì)上差異很大,即使是同類蛋白質(zhì),因選材不同,使用方法差別也很大,且又處于不同的體系中,因此不可能有一個(gè)固定的程序適用各類蛋白質(zhì)的分離。目前二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)分離純化流程目前三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)但一般分離中的關(guān)鍵部分的基本手段是相同的,大部分蛋白質(zhì)可溶于水、稀鹽、稀酸或稀堿溶液,少數(shù)與脂類結(jié)合的蛋白質(zhì)溶于乙醇、丙酮及丁醇等有機(jī)溶劑。因此可采用不同溶劑提取、分離及純化蛋白質(zhì)(酶)。目前四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)實(shí)驗(yàn)前應(yīng)查閱有關(guān)文獻(xiàn)資料,了解欲分離提純物質(zhì)的理化及生物學(xué)性質(zhì)。對(duì)于未知結(jié)構(gòu)及性質(zhì)的試樣進(jìn)行創(chuàng)造性的分離提純時(shí),需要經(jīng)過(guò)各種方法比較和摸索,才能找到規(guī)律和獲得預(yù)期結(jié)果。目前五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)在分離提純工作前,須建立相應(yīng)的分析鑒定方法,以正確指導(dǎo)整個(gè)分離純化工作的順利進(jìn)行。高度提純某一生物大分子,一般要經(jīng)過(guò)多種方法、步驟及不斷變換各種外界條件才能達(dá)到目的。因此,整個(gè)實(shí)驗(yàn)方法的優(yōu)劣,選擇條件效果的好壞,需要通過(guò)分析鑒定來(lái)判斷。目前六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)在不同溶劑中溶解度的差異,主要取決于蛋白分子中非極性疏水基團(tuán)與極性親水基團(tuán)的比例,其次取決于這些基團(tuán)的排列和偶極矩。因此,分子結(jié)構(gòu)性質(zhì)是不同蛋白溶解差異的原因。溫度、pH、離子強(qiáng)度等是影響蛋白質(zhì)溶解度的外界條件。提取蛋白質(zhì)時(shí)常根據(jù)這些內(nèi)外因素綜合加以利用。目前七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)簡(jiǎn)單蛋白質(zhì):白蛋白和球蛋白:溶于水及稀鹽、稀酸、稀堿,可被50%飽和度硫酸銨析出。真球蛋白:一般在pI時(shí)不溶于水,但加入少量的鹽、酸、堿則可溶解。擬球蛋白:溶于水,可為50%飽和度硫酸銨析出。目前八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)醇溶蛋白:溶于70~80%乙醇中,不溶于水及無(wú)水乙醇?xì)さ鞍祝涸趐I不溶于水,也不溶于稀鹽酸,易溶于稀酸、稀堿溶液精蛋白:溶于水和稀酸,易在稀氨水中沉淀組蛋白:溶于水和稀酸,易在稀氨水中沉淀硬蛋白質(zhì):不溶于水、鹽、稀酸及稀堿目前九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)綴合蛋白:包括磷蛋白、粘蛋白、糖蛋白、核蛋白、脂蛋白、血紅蛋白、金屬蛋白、黃素蛋白和氮苯蛋白等。此類蛋白質(zhì)溶解性質(zhì)隨蛋白質(zhì)與非蛋白質(zhì)結(jié)合部分的不同而異,除脂蛋白外,一般可溶于稀酸、稀堿及鹽溶液中,脂蛋白如脂肪部分露于外,則脂溶性占優(yōu)勢(shì),如脂肪部分被包圍于分子之中,則水溶性占優(yōu)勢(shì)。目前十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)的制備主要原理:①利用混合物中幾個(gè)組分分配率的差別,把它們分配于可用機(jī)械方法分離的兩個(gè)或幾個(gè)物相中,如鹽析、有機(jī)溶劑提取、層析和結(jié)晶等;②將混合物置于單一物相中,通過(guò)物理力場(chǎng)的作用使各組分分配于不同區(qū)域而達(dá)到分離的目的,如電泳、超離心、超濾等。目前十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)由于蛋白質(zhì)不能溶化,也不能蒸發(fā),所能分配的物相只限于固相和液相,并在這兩相間互相交替進(jìn)行分離純化。制備方法可按照分子大小、形狀、帶電性質(zhì)及溶解度等主要因素進(jìn)行分類。目前十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)按分子大小和形態(tài)分為差速離心、超濾、分子篩及透析等方法;按溶解度分為鹽析、溶劑抽提、分配層析、逆流分配及結(jié)晶等方法;按電荷差異分為電泳、電滲析、等電點(diǎn)沉淀、離子交換層析及吸附層析等;按生物功能專一性有親合層析法等。目前十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)常與其他物質(zhì)以結(jié)合形式存在。如極微量的金屬和糖對(duì)巨大蛋白質(zhì)的穩(wěn)定性起決定作用,若被除去則不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結(jié)晶化的難度也隨之增加。目前十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)主要依靠氫鍵、鹽鍵和范德華力等維持,構(gòu)象很不穩(wěn)定。為得到天然狀態(tài)的蛋白質(zhì),盡量采用溫和的手段,如中性、低溫、避免起泡等,并還要注意防腐。一些共存成分的影響。如蝮蛇粗毒的蛋白質(zhì)水解酶活性很高,純化蝮蛇神經(jīng)毒素時(shí),當(dāng)室溫超過(guò)20℃時(shí)神經(jīng)毒素被水解,可用0.1mol/LEDTA抑制蝮蛇毒中的蛋白水解酶。目前十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)制備過(guò)程一般可分為5個(gè)階段:①材料的選擇和預(yù)處理,②細(xì)胞的破碎(有時(shí)需進(jìn)行細(xì)胞器的分離),③提取,④純化(包括鹽析,有機(jī)溶劑沉淀,有機(jī)溶劑提取、吸附、層析、超離心及結(jié)晶等),⑤濃縮、干燥及保存。每個(gè)個(gè)案不一定都具備5個(gè)階段,每一階段也不是截然分開的。目前十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.1原料選擇尋找含某種蛋白質(zhì)豐富的器官?gòu)闹刑崛〉鞍踪|(zhì)。原料的選擇主要依據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康亩?。工業(yè)生中選含量高、來(lái)源豐富及成本低的新鮮原料。目前十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)選材要注意種屬的關(guān)系,如鰹的心肌細(xì)胞色素C較馬的易結(jié)晶,馬的血紅蛋白較牛的易結(jié)晶。若利用蛋白質(zhì)的活性,對(duì)原料的種屬應(yīng)無(wú)影響。如利用胰蛋白酶水解蛋白質(zhì)的活性,用豬或牛胰臟均可。目前十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)若研究蛋白質(zhì)自身的性質(zhì)及結(jié)構(gòu)時(shí),原料的來(lái)源種屬必須一定。研究由于病態(tài)引起的特殊蛋白質(zhì)時(shí),不但使用種屬一定的原料,而且要取自同一個(gè)體的原料。可能時(shí)盡量用全年均可采到的原料。對(duì)動(dòng)物生理狀態(tài)間的差異(如饑餓時(shí)脂肪和糖類相對(duì)減少),采收期及產(chǎn)地等因素也要注意。目前十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.2前處理4.1.2.1細(xì)胞的破碎動(dòng)物材料要剔除結(jié)締組織及脂肪組織。如不立即進(jìn)行實(shí)驗(yàn),應(yīng)冷凍保存。除提取胞細(xì)外成分,對(duì)細(xì)胞內(nèi)及多細(xì)胞生物組織中的蛋白質(zhì)的分離提取均須先將細(xì)胞破碎,使其充分釋放到溶液中。目前二十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)①機(jī)械方法:通過(guò)機(jī)械切力作用使組織細(xì)胞破壞。高速組織搗碎機(jī)宜用于植物組織和動(dòng)物內(nèi)臟組織的破碎;小量的樣品也可用研缽與適當(dāng)?shù)木彌_劑磨碎提取,也可加氧化鋁、石英砂及玻璃粉磨細(xì)。但在磨細(xì)時(shí)局部往往生熱導(dǎo)致變性或pH顯著變化。目前二十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)②物理方法:主要通過(guò)各種物理因素的作用,使組織細(xì)胞破碎的方法。反復(fù)凍融法:于-15~-20℃冰凍,然后緩慢融解,如此反復(fù)操作,使大部分細(xì)胞及細(xì)胞內(nèi)顆粒破壞。由于滲透壓的變化,使結(jié)合水結(jié)凍,冰晶將細(xì)胞膜破碎,使蛋白質(zhì)可溶解,成為粘稠的濃溶液,但脂蛋白凍結(jié)變性。目前二十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)冷熱變替法:將材料投入沸水中,于90℃左右維持?jǐn)?shù)分鐘,立即置于冰浴中使之迅速冷卻,絕大部分細(xì)胞被破壞。超聲波法:暴露于9~10千周聲波或10~500千周超聲波所產(chǎn)生的機(jī)械振動(dòng)。應(yīng)用超聲波處理時(shí)應(yīng)注意避免溶液中氣泡的存在。處理一些超聲波敏感的蛋白質(zhì)酶時(shí)宜慎重。加壓破碎法:一定氣壓或水壓也可使細(xì)胞破碎。目前二十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③化學(xué)方法有機(jī)溶媒法:粉碎后的材料在0℃以下加入5~10倍量的丙酮,迅速攪拌均勻,可破碎細(xì)胞膜,破壞蛋白質(zhì)與脂質(zhì)的結(jié)合。蛋白質(zhì)一般不變性,被脫脂和脫水成為干燥粉末。用少量乙醚洗,經(jīng)濾紙干燥,如脫氫酶等可保存數(shù)月不失去活性。表面活性劑處理:SDS、氯化十二烷基吡啶及去氧膽酸鈉等。目前二十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)④生物化學(xué)方法自溶法:將待破碎的鮮材料在一定pH和適當(dāng)?shù)臏囟认?,利用自身的蛋白酶將?xì)胞破壞,使細(xì)胞內(nèi)含物釋放出來(lái)。利用該法可從胰臟制取羧肽酶。自體融解時(shí)需要時(shí)間,需加少量甲苯、氯仿等。應(yīng)防止細(xì)菌污染。自體融解過(guò)程中pH會(huì)變化,隨時(shí)調(diào)節(jié)pH。自溶溫度選在0~4℃,因自溶時(shí)間較長(zhǎng),所以制備活性蛋白質(zhì)時(shí)較少用。目前二十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)酶法:用胰蛋白酶等蛋白酶除去變性蛋白質(zhì)。溶菌酶用于細(xì)菌菌體的裂解。例如,1g菌體加1~10mg溶菌酶,在pH6.2~7.0下,1h可完全溶菌。蝸牛酶及纖維素酶常用于破壞植物細(xì)胞。目前二十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)一些細(xì)胞膜較脆弱的細(xì)胞,可把它們置于水或低滲緩沖劑中透析將細(xì)胞脹破。動(dòng)物材料中的蛋白質(zhì)有些可溶性的形式存在于體液(如血漿)中,可不經(jīng)過(guò)破碎直接進(jìn)行分離。目前二十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.2.2細(xì)胞器的分離為了純化某一特定細(xì)胞器上的生物大分子,防止其他細(xì)胞組分的干擾,細(xì)胞破碎后常將細(xì)胞內(nèi)各組分先行分離,對(duì)于制備一些難度較大需求純度較高的生物大分子是有利的。各類生物大分子在細(xì)胞內(nèi)的分布是不同的。DNA幾乎全部集中在細(xì)胞核內(nèi)。RNA則大部分分布于細(xì)胞質(zhì)。各種酶在細(xì)胞內(nèi)分布也有一定位置。目前二十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)、酶及核酸在肝細(xì)胞內(nèi)分布情況目前二十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)細(xì)胞器的分離一般采用差速離心法。細(xì)胞經(jīng)過(guò)破碎后,在適當(dāng)介質(zhì)中進(jìn)行差速離心。利用細(xì)胞各組分質(zhì)量大小不同,沉降于離心管內(nèi)不同區(qū)域,分離后即得所需組分。細(xì)胞器分離制備的介質(zhì)一般用蔗糖、Ficoll或葡萄糖-聚乙二醇等高分子溶液。目前三十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)的提取細(xì)胞破碎后,用水、稀鹽酸及緩沖液等適當(dāng)溶劑,將蛋白質(zhì)溶解出來(lái),再用離心法除去不溶物,即得粗提取液。角蛋白、膠原及絲蛋白等不溶性蛋白質(zhì),用適當(dāng)?shù)娜軇┫慈タ扇苄缘碾s質(zhì),如脂類、糖類及其他可溶性蛋白質(zhì),剩下就是不溶性蛋白質(zhì)。目前三十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)①水溶液提取大部分蛋白質(zhì)均溶于水、稀鹽、稀堿或稀酸溶液中。因此蛋白質(zhì)的提取一般以水為主。水適用于白蛋白類蛋白質(zhì)的抽提,用適當(dāng)?shù)南←}溶液或緩沖液提取,可增加蛋白質(zhì)穩(wěn)定性及溶解度。目前三十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)②鹽溶液提取以鹽溶液及緩沖液提取蛋白質(zhì)進(jìn)常注意下面幾個(gè)因素。鹽濃度等滲鹽溶液常用0.02~0.05mol/L磷酸鹽緩沖液和碳酸鹽緩沖液,以及0.15mol/L氯化鈉溶液。例如,用0.1mol/L碳酸氫鈉提取6-磷酸葡萄糖脫氫酶等。目前三十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)有時(shí)為了螯合某些金屬離子和解離酶分子與其他雜質(zhì)的靜電結(jié)合,常用枸櫞酸鈉緩沖液和焦磷酸鈉緩沖液。有些蛋白質(zhì)在低鹽濃度下溶解度低,如脫氧核糖核蛋白質(zhì)需用1mol/L以上氯化鈉提取。目前三十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)選擇適當(dāng)?shù)柠}濃度及pH即可提取與細(xì)胞顆粒結(jié)合不太緊密的水溶性蛋白。某些與細(xì)胞顆粒上的脂類物質(zhì)結(jié)合較緊的蛋白,需用有機(jī)溶劑或加入表面活性劑處理等方法提取。例如,脂蛋白可用稀的去垢劑(SDS、洋地黃皂苷)或有機(jī)溶劑抽提。其它不溶于水的蛋白質(zhì)通常用稀堿溶液抽提。目前三十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)pH值提取液的pH值應(yīng)保證在蛋白質(zhì)穩(wěn)定的范圍內(nèi),即選擇在偏離等電點(diǎn)兩側(cè)。如堿性蛋白質(zhì)則選在偏酸一側(cè),酸性蛋白質(zhì)選擇偏堿一側(cè),以增大蛋白質(zhì)的溶解度。如細(xì)胞色素C屬堿性蛋白質(zhì),常用稀酸提?。患∪飧视腿?3-磷酸脫氫酶屬酸性蛋白質(zhì),用稀堿提取。某些蛋白與其它物質(zhì)以離子鍵結(jié)合,選擇pH3~6的提取液有利于分離提取。目前三十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)溫度多數(shù)酶的提取溫度<4℃。少數(shù)對(duì)溫度耐受性較高的蛋白質(zhì),可適當(dāng)提高溫度,使雜蛋白變性分離且也有利于提取和進(jìn)一步純化。如胃蛋白酶等及一些多肽激素類,選擇37~50℃條件下提取。提取酶時(shí)加入底物或輔酶,改變酶分子表面電荷分布,能提高提取效果。目前三十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③有機(jī)溶劑提取用有機(jī)溶劑提取蛋白的情況較少。一些和脂結(jié)合較牢或分子中非極性側(cè)鏈較多的蛋白質(zhì),不溶于水、稀鹽或稀堿液中,可用不同比例的有機(jī)溶劑提取。從線粒體和微粒體等含脂質(zhì)較多的原料中提取蛋白時(shí),采用丁醇提取效果較好。目前三十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)丁醇使蛋白質(zhì)的變性較少,親脂性強(qiáng),易透入細(xì)胞內(nèi)部,與水能溶解10%,因此具有脂質(zhì)與水之間的表面活性作用,可占據(jù)蛋白質(zhì)與脂質(zhì)的結(jié)合點(diǎn),也阻礙蛋白質(zhì)與脂質(zhì)的再結(jié)合,使蛋白質(zhì)在水中溶解能力增加。丁醇提取法的pH及溫度選擇范圍較廣(pH3~10,溫度-2℃至40℃)。用丁醇曾成功提取琥珀酸脫氫酶、堿性磷酸脂酶等。目前三十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)胰島素既能溶于稀酸、稀堿又能溶于酸性乙醇或酸性丙酮中。以60~70%的酸性乙醇提取,一方面可抑制蛋白質(zhì)水解酶對(duì)胰島素的破壞,同時(shí)也達(dá)到大量除去雜蛋白的目的。目前四十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)④表面活性劑的利用與脂質(zhì)結(jié)合的蛋白質(zhì),采用表面活性劑如膽酸鹽及SDS等處理。表面活性劑有陰離子型(如脂肪酸鹽、烷基苯磺酸鹽及膽酸鹽等),陽(yáng)離子型(如氧化芐烷基二甲基銨等)及非離子型(TritonX-100、TirtonX-114、吐溫-60及吐溫-80)等。非離子型表面活性劑較溫和,不易引起酶失活。目前四十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)⑤對(duì)提取物的保護(hù)細(xì)胞中普遍存在蛋白酶,多數(shù)蛋白酶的最適pH在3~5或更高。因此,一般采用低溫和較低的pH,可降低蛋白酶引起水解程度。低pH也可使許多酶原在提取中不被激活,不表現(xiàn)水解活力。目前四十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白酶抑制劑也可起保護(hù)作用,用二異丙基氟磷酸抑制以絲氨酸為活性中心的酶,用對(duì)氯汞苯甲酸抑制以巰基為中心的酶等。提取溶液中加有機(jī)溶劑時(shí)也能產(chǎn)生相類似的作用。蛋白酶的性質(zhì)變化很大,應(yīng)根據(jù)具體對(duì)象而變化。目前四十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)一些含巰基的蛋白,這些巰基可能是活性所必需。提取時(shí)應(yīng)避免金屬離子和氧化劑。一般可在提取液中加金屬螯合劑(如EDTA)以及還原劑(抗壞血酸)。有某些蛋白質(zhì)帶一些非共價(jià)鍵結(jié)合的配基。提取時(shí)要注意保護(hù),不要使配基丟失。目前四十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.4蛋白質(zhì)的粗分離從破碎材料或細(xì)胞器提出的蛋白質(zhì)需進(jìn)一步分離純化。純化包括將蛋白質(zhì)與非蛋白質(zhì)分開,將各種不同的蛋白質(zhì)分開。選擇提取條件時(shí),就要考慮盡量除去非蛋白質(zhì)。有些雜質(zhì),如脂肪應(yīng)首先除去,可用有機(jī)溶劑除去。目前四十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)提取蛋白中混有的核酸或多糖,可用專一性酶水解,有機(jī)溶劑抽取及選擇性部分沉淀等方法處理。小分子物質(zhì)常在整個(gè)制備過(guò)程中通過(guò)多次液相與固相轉(zhuǎn)化中被分離或最后用透析法除去。目前四十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)對(duì)同類物質(zhì)如酶與雜蛋白、RNA、DNA以及不同結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)、酶、核酸之間的分離,主要采用鹽析、有機(jī)溶劑沉淀,等電點(diǎn)沉淀、吸附、結(jié)晶、電泳、超離心及柱層析等方法。鹽析法、等電點(diǎn)法及結(jié)晶法用于蛋白質(zhì)和酶的提純;有機(jī)溶劑抽提和沉淀多用于核酸提純;柱層析和梯度離心廣泛應(yīng)用于蛋白和核酸的提純。目前四十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)的分離純化較難,而其本身的性質(zhì)又限制了某些方法的使用,因此要根據(jù)其微細(xì)特征,如分子形狀、分子量大小、電離性質(zhì)、溶解度、生物功能專一性等。巧妙的聯(lián)用各種方法并進(jìn)行嚴(yán)密的操作。目前四十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)同時(shí)應(yīng)掌握純化過(guò)程的精制程度和回收率。具有活性的蛋白質(zhì)可利用其比活力增加為尺度進(jìn)行追蹤。其他蛋白質(zhì)可用電泳、超離心、層析、擴(kuò)散及溶解等測(cè)定純度。目前四十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)除去蛋白質(zhì)提取液中雜質(zhì)的方法①核酸沉淀法:用氯化錳、魚精蛋白硫酸鹽等沉淀劑使其沉淀而除去。也可用核酸酶將核酸降解后除去。即在粗勻漿中加入少量DNase,4℃保溫30~60min,可使DNA降解。②醋酸鉛沉淀法:用醋酸鉛沉淀除去雜蛋白,當(dāng)然,目的蛋白也會(huì)緩慢變性,因此應(yīng)迅速進(jìn)行透析除去醋酸鉛。目前五十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③調(diào)pH值或加熱沉淀法:利用蛋白質(zhì)酸堿變性性質(zhì)的差異除去雜蛋白。利用蛋白質(zhì)的熱變性的溫度系數(shù)差異,可在一定的pH下將蛋白提取液加熱到一定的溫度,使對(duì)熱不穩(wěn)定的雜蛋白性沉淀而除去。目前五十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)④選擇性變性法:利用各種蛋白質(zhì)穩(wěn)定性的不同,可用選擇性變性法來(lái)除去雜蛋白。例如胰蛋白酶及細(xì)胞色素C等少數(shù)特別穩(wěn)定的酶,甚至可用2.5%三氯醋酸處理,此時(shí)其它雜蛋白均變性而沉淀,而胰蛋白酶和細(xì)胞色素C則仍留在溶液中。⑤透析法:小分子物質(zhì)可透析除去。目前五十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)提取液通過(guò)鹽析、有機(jī)溶劑沉淀、結(jié)晶和等電點(diǎn)沉淀方法可獲得較粗產(chǎn)品,若要得到精制的產(chǎn)品還需要進(jìn)一步純化。目前五十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.4.1鹽析法分離蛋白質(zhì)在蛋白質(zhì)和酶的提純過(guò)程中,一般粗抽提物常用鹽析法進(jìn)行粗分,也可反復(fù)用鹽析法純化蛋白。蛋白質(zhì)在低鹽濃度下的溶解度隨鹽液濃度升高而增加(鹽溶,與離子強(qiáng)度0~1間成比例增加)。當(dāng)鹽濃度不斷上升時(shí),蛋白質(zhì)的溶解度又以不同程度下降并先后析出(鹽析,離子強(qiáng)度2~10)。目前五十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)由于蛋白質(zhì)分子內(nèi)和分子間電荷基團(tuán)的靜電引力,當(dāng)水中加入少量鹽時(shí),鹽離子與水分子對(duì)蛋白質(zhì)分子的極性基團(tuán)的影響,使蛋白質(zhì)在水中溶解度增大。但鹽濃度增加一定程度時(shí),水的活度降低,蛋白質(zhì)表面的電荷大量被中和,水化膜被破壞,蛋白質(zhì)相互聚集而沉淀析出。鹽析法是根據(jù)不同蛋白質(zhì)在一定濃度鹽溶液中溶解度降低程度不同達(dá)到彼此分離的方法。目前五十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)在某一鹽溶液中鹽析效果與鹽的性質(zhì)(鹽離子價(jià)數(shù)和平均半徑)和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)有關(guān)。蛋白質(zhì)是具有許多親水基團(tuán)的偶極離子,常需用要較高的離子強(qiáng)度才能從溶液中析出。一般可在一定的pH和溫度下改變離子強(qiáng)度,或在一定離子強(qiáng)度下改變pH及溫度,進(jìn)行分段鹽析法,將不同的蛋白組分先后析出,達(dá)到分離的目的。目前五十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)鹽的選擇蛋白質(zhì)在水中溶解度取決于蛋白質(zhì)分子上離子基團(tuán)周圍的水分子數(shù)目,即蛋白質(zhì)的水合程度。因此,控制水合程度也就是控制蛋白質(zhì)的溶解度。加入中性鹽可控制蛋白質(zhì)的水合程度,例如用硫酸銨、硫酸鎂、硫酸鈉、氯化鈉、磷酸鈉等,其中應(yīng)用最廣的是硫酸銨。目前五十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)硫酸銨具有溫度系數(shù)小而溶解度大(25℃時(shí)飽滿和溶解度為4.1mol,即767g/l;0℃時(shí)飽滿和溶解度為3.9mol,即676g/l)的優(yōu)點(diǎn)。在這一溶解度范圍內(nèi),許多蛋白質(zhì)均可鹽析出來(lái),且硫酸銨價(jià)廉易得,分段效果較其它鹽好,不易引起蛋白質(zhì)變性。目前五十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)硫酸銨對(duì)蛋白氮的測(cè)定有干擾,緩沖能力較差,有時(shí)也應(yīng)用硫酸鈉,如鹽析免疫球蛋白,硫酸鈉的缺點(diǎn)是30℃以下溶解度太低。磷酸鈉的鹽析作用比硫酸銨好,但溶解度低,受溫度影響大。氯化鈉的溶解度不如硫酸銨,但在不同溫度下它的溶解度變化不大。目前五十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)硫酸銨濃溶液的pH常在4.5~5.5之間,純度不高的硫酸銨還常含有少量游離硫酸,pH值往往降至4.5以下,當(dāng)用其他pH值進(jìn)行鹽析時(shí),需用硫酸或氨水調(diào)節(jié)。目前六十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)在分段鹽析時(shí),加鹽濃度一般以飽和度表示,飽和溶液的飽和度為100%。用硫酸銨鹽析時(shí)其溶液飽和度調(diào)整方法有3種。①加入飽和溶液法:當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液體積不大所需調(diào)整的濃度不高時(shí),加入飽和硫酸銨溶液。目前六十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)配制法:加入過(guò)量硫酸銨,熱至50~60℃保溫?cái)?shù)分鐘,趁熱濾去沉淀,再于0℃或25℃下平衡1~2天,有固體析出時(shí)即達(dá)100%飽和度。鹽析所需飽和度計(jì)算:V=V0(S2-S1)/(1-S2)式中V:所需加入飽和硫酸銨溶液的體積V0:待鹽析溶液的體積S1:待鹽析溶液的原始飽和度S2
:所需達(dá)到的硫酸銨飽和度目前六十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)②加入固體鹽法:當(dāng)鹽析所需達(dá)到飽和度較高而溶液的體積又不再過(guò)分增大時(shí),可直接加固體硫酸銨,在25℃及0℃時(shí)所需硫酸銨飽和度可查表。目前六十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③透析平衡法:將鹽析的樣品液裝于透析袋內(nèi),浸入飽和硫酸銨溶液中進(jìn)行透析,外部的硫酸銨不斷擴(kuò)散進(jìn)入透析袋內(nèi),此法濃度變化較連續(xù),不會(huì)出現(xiàn)鹽的局部過(guò)高現(xiàn)象,但鹽析時(shí)測(cè)定鹽的飽和度手續(xù)較繁,運(yùn)用較少。目前六十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)確定沉淀蛋白質(zhì)所需硫酸銨濃度的方法將少量樣品冷卻到0~5℃,然后攪拌加入固體硫酸銨粉末,見蛋白質(zhì)產(chǎn)生沉淀時(shí),離心除去沉淀,分析上清液確定所要蛋白質(zhì)的濃度,如它仍在溶液中則棄去沉淀,再加更多的硫酸銨于上清液中,直到產(chǎn)生蛋白質(zhì)沉淀時(shí)止。以所要提取的蛋白質(zhì)在溶液中的濃度對(duì)硫酸銨濃度作圖,得沉淀曲線,找出蛋白質(zhì)開始沉淀的濃度。如不考慮收率,飽和度區(qū)間可取得窄一些,使純度高一些。目前六十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)鹽析時(shí)注意的問題鹽的飽和度:不同蛋白質(zhì)鹽析時(shí)要求鹽的飽和度不同。分離幾個(gè)混合組成的蛋白質(zhì)時(shí),鹽的飽和度常由稀到濃漸次增加。每出現(xiàn)一種蛋白沉淀進(jìn)行離心或過(guò)濾分離后,再繼續(xù)增加鹽的飽和度,使第2種蛋白質(zhì)沉淀。目前六十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)例如用硫酸銨鹽析分離血漿中的蛋白質(zhì)飽和度達(dá)20%時(shí),纖維蛋白原首先析出;飽和增至28~33%時(shí),優(yōu)球蛋白析出;飽和度再增至33~50%時(shí),擬球蛋白析出;飽和度大于50%以上時(shí)清蛋白析出。用硫酸銨不同飽和度分段鹽析法,可從牛胰酸性提取液中分離得到9種以上蛋白質(zhì)及酶。目前六十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)pH值:在等電點(diǎn)時(shí)蛋白質(zhì)溶解度最小易沉淀析出。因此鹽析時(shí)除個(gè)別特殊情況外,pH值常選擇在被分離的蛋白質(zhì)等電點(diǎn)附近。由于硫酸銨有弱酸性,它的飽和溶液的pH值低于7,如所要蛋白質(zhì)遇酸易變性則應(yīng)在適當(dāng)緩沖液中進(jìn)行。目前六十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)濃度:在相同鹽析條件下蛋白質(zhì)濃度愈高愈易沉淀。使用鹽的飽和度的極限也愈低。如血清球蛋白的濃度從0.5%增至3.0%時(shí),需用中性鹽的飽和度的最低極限從29%遞減至24%。目前六十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)進(jìn)行兩次鹽析,可提高分離純度。較高濃度的蛋白質(zhì)雖然對(duì)沉淀有利,但濃度過(guò)高也易引起雜蛋白的共沉作用。因此,必須選擇適當(dāng)濃度盡可能避免共沉作用的干擾。一般2.5%~3.0%的蛋白濃度比較適中。目前七十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)溫度:由于濃鹽液對(duì)蛋白質(zhì)有一定保護(hù)作用,鹽析操作一般可在室溫下進(jìn)行。至于某些對(duì)熱特別敏感的酶,則宜維持低溫條件。通常蛋白質(zhì)鹽析時(shí)對(duì)溫度要求不太嚴(yán)格。但在中性鹽中結(jié)晶純化時(shí),溫度影響則比較明顯。目前七十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)脫鹽:蛋白質(zhì)用鹽析法分離沉淀后,常需脫鹽才能獲得純品。常用透析法脫鹽,透析法所需時(shí)間較長(zhǎng),常在低溫下進(jìn)行并加入防腐劑避免微生物污染。也可用分子篩層析,常用SephadexG-25柱層析法,上樣不要超過(guò)床體積的20%。目前七十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)有些金屬離子能和蛋白質(zhì)形成較為專一的結(jié)合而使蛋白質(zhì)沉淀。這不是典型的鹽析,但在制備蛋白質(zhì)中也有應(yīng)用。例如,鋅離子在特定pH下與胰島素結(jié)合形成沉淀。目前七十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)從懸浮液中沉淀出來(lái)的速度極慢,鹽析后一般放置0.5~1h,待沉淀完全后再分離,低濃度的鹽析后固液分離一般用離心法,高濃度的溶液常用過(guò)濾法。目前七十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.4.2有機(jī)溶劑分離蛋白質(zhì)有機(jī)溶劑能降低溶液的介電常數(shù),增加蛋白質(zhì)分子上不同電荷的引力,導(dǎo)致溶解度降低。有機(jī)溶劑與水作用能破壞蛋白質(zhì)的水化膜,使蛋白質(zhì)在一定濃度的有機(jī)溶劑中沉淀析出。目前七十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)常用的有機(jī)溶劑有乙醇和丙酮,由于有機(jī)溶劑的加入易引起變性失活,尤其乙醇和水混合釋放熱量,操作一般宜在低溫下進(jìn)行,且在加入有機(jī)溶劑時(shí)注意攪拌均勻以免局部濃度過(guò)大。目前七十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)有機(jī)溶劑沉淀一般比鹽析法易過(guò)濾或離心沉降。分離后的蛋白質(zhì)沉淀應(yīng)立即用水或緩沖液溶解,以降低有機(jī)溶劑的濃度。操作時(shí)的pH值大多數(shù)控制在待沉淀蛋白質(zhì)等電點(diǎn)附近。有機(jī)溶劑在中性鹽存在時(shí)能增加蛋白質(zhì)的溶解度,減少變性和提高分離的效果。目前七十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)一般在有機(jī)溶劑沉淀時(shí)添加中性鹽的濃度在0.05mol左右,過(guò)多不僅耗費(fèi)有機(jī)溶劑,而且可能導(dǎo)致沉淀不好。沉淀的條件一經(jīng)確定,就必須嚴(yán)格控制,才能得到重復(fù)性結(jié)果。有機(jī)溶劑濃度通常以有機(jī)溶劑和水容積比或用百分濃度表示,故操作條件比鹽析法嚴(yán)格。目前七十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.4.3蛋白質(zhì)的結(jié)晶影響蛋白質(zhì)結(jié)晶的因素很多,一般包括①pH值:與沉淀蛋白質(zhì)原理相同,結(jié)晶的溶液pH值一般選擇在被結(jié)晶的蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)附近,以利于晶體的析出。②溫度:除少數(shù)情況外,通常在低溫條件下進(jìn)行。低溫使蛋白質(zhì)溶解度低且不易變性。在中性鹽溶液中結(jié)晶時(shí)可在0℃至室溫范圍內(nèi)選擇,在有機(jī)溶劑中結(jié)晶要求溫度較低。目前七十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③晶種:不易結(jié)晶蛋白質(zhì)和酶如糜蛋白酶,往往加入微量的糜蛋白酶結(jié)晶可導(dǎo)致大量結(jié)晶的形成。有時(shí)用玻璃輕輕摩擦容器壁也可達(dá)到此目的。需加晶種才能形成結(jié)晶的蛋白質(zhì)或酶,大多數(shù)結(jié)晶收率都不高。目前八十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)利用成核劑(nucleant)使蛋白質(zhì)分子附著其上并形成一個(gè)晶格(crystallattice)。然后,使用一種由鈣、磷酸和硅制成的多孔材料Bioglass(生物玻璃)作為支架讓晶體在其上生長(zhǎng)。找到好的成核劑是獲得好結(jié)晶的關(guān)鍵。目前八十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)④金屬離子:有些蛋白結(jié)晶時(shí)需加入金屬離子,如鐵蛋白在硫酸銨溶液中結(jié)晶時(shí),加入少量鎘離子才形成菱狀結(jié)晶,烯醇化酶常加入汞鹽后形成結(jié)晶。目前八十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)⑤結(jié)晶時(shí)間:在結(jié)晶條件適合的情況下,在幾小時(shí)即可獲得結(jié)晶。但有些情況需數(shù)天甚至數(shù)月才能結(jié)晶完全。蛋白質(zhì)的結(jié)晶大多數(shù)是針狀、棒狀、片狀,有的為八面體或立方體的菱狀結(jié)晶。結(jié)晶的大小與結(jié)晶時(shí)間及條件有關(guān)。目前八十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)Thehangingdroptechnique目前八十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.4.4蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)沉淀蛋白質(zhì)在靜電狀態(tài)時(shí)顆粒間的靜電斥力最小,因而溶解度也最小,各種蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)有差別,可利用調(diào)節(jié)溶液的pH達(dá)到某一蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)使之沉淀,但此法很少單獨(dú)使用,可與鹽析法結(jié)合用。目前八十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)的純化純化包括將蛋白質(zhì)與非蛋白質(zhì)分開,將各種不同的蛋白質(zhì)分開。4.1.5.1根據(jù)蛋白質(zhì)分子大小分離純化①凝膠過(guò)濾②SDS③超濾④超速離心目前八十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.5.2根據(jù)電荷差異分離純化①離子交換層析②PAGE③等電聚焦目前八十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.5.3根據(jù)分子極性差異①反相色譜②鹽析③疏水層析目前八十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)等生物大分子的表面常暴露一些疏水性基團(tuán)(稱為疏水補(bǔ)丁),在高鹽濃度下,這些疏水補(bǔ)丁可與疏水性層析介質(zhì)相互作用而結(jié)合。洗脫時(shí)將鹽濃度逐漸降低,蛋白質(zhì)因疏水性不同而逐個(gè)地先后被洗脫而純化。此法能分離其它一些方法不易純化的蛋白質(zhì)。目前八十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)Phenyl-Sepharose是以交聯(lián)瓊脂糖為支持物,其上共價(jià)結(jié)合苯基為疏水性配體,可與疏水性物質(zhì)發(fā)生疏水作用。目前九十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.5.4根據(jù)親和性差異親和層析目前九十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.6濃縮、干燥及保存4.1.6.1樣品的濃縮生物大分子在制備過(guò)程中由于過(guò)柱純化而樣品變得很稀,為了保存和鑒定的目的,往往需要進(jìn)行濃縮。①蒸發(fā)濃縮:減壓蒸發(fā)濃縮。②冰凍法:操作時(shí)先將待濃縮的溶液冷卻使之變成固體,然后緩慢地融解,不含蛋白質(zhì)的純冰浮于液面,蛋白質(zhì)則集中于溶液中,移去冰塊,可得蛋白質(zhì)的濃縮液。目前九十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③吸收法:通過(guò)吸收劑(聚乙二醇,聚乙稀吡咯烷酮、蔗糖和凝膠等)直接收除去溶液中水使之濃縮。使用聚乙二醇吸收劑時(shí),先將溶液裝入透析袋里,外加聚乙二醇復(fù)蓋置于4℃下,袋內(nèi)水滲出即被聚乙二醇迅速吸去。④超濾法目前九十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.6.2干燥蛋白質(zhì)干燥方法有噴霧干燥、氣流干燥和真空冷凍干燥法等。真空冷凍干燥適用于不耐高溫和易氧化物質(zhì)的干燥和保存。在低溫低壓下,冰很易升華為氣體。操作時(shí)一般先將待干燥的液體冷凍結(jié)冰,然后在低溫低壓下將溶劑變成氣體而除去。干后的產(chǎn)品疏松、溶解度好、保持天然結(jié)構(gòu),適用于各類生物大分子的干燥保存。目前九十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.6.3貯存生物大分子的穩(wěn)定性與保存方法的很大關(guān)系。蛋白質(zhì)貯藏應(yīng)避免長(zhǎng)期暴露于空氣中防止微生物的污染。干燥的制品一般比較穩(wěn)定,在低溫情況下其活性可在數(shù)月甚至數(shù)年無(wú)明顯變化,貯藏要求簡(jiǎn)單,只要將干燥的樣品置于干燥器內(nèi)密封,保持0~4℃即可。目前九十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)液態(tài)貯藏的優(yōu)點(diǎn)是使樣品免去干燥步驟,生物大分子的生理活性和結(jié)構(gòu)破壞較少;缺點(diǎn)是需要較嚴(yán)格的防腐措施,貯藏時(shí)間不能太長(zhǎng),液態(tài)貯藏時(shí)應(yīng)注意①樣品不能太稀,必須濃縮到一定濃度才能封裝貯藏,樣品太稀易使生物大分子變性。目前九十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)②一般需加入防腐劑和穩(wěn)定劑,常用的防腐劑有甲苯、苯甲酸、氯仿、百里酚等。蛋白質(zhì)常用的穩(wěn)定劑有硫酸銨、蔗糖、甘油等,酶也可加入底物和輔酶以提高其穩(wěn)定性。此外,鈣、鋅、硼酸等溶液對(duì)某些酶也有一定保護(hù)作用。③貯藏溫度要求低,大多數(shù)在0℃左右保存,有的則要求更低。有些蛋白質(zhì)在低溫中反而引起變性。目前九十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.1.7蛋白質(zhì)純度蛋白質(zhì)純化后需要一定的指標(biāo)說(shuō)明其純度,其實(shí)許多制備純化蛋白的方法也可以作為分析方法,如電泳、微量凝膠過(guò)濾法、層析、結(jié)晶、生物活力及免疫分析等。目前九十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)由于蛋白種類繁多,有些性質(zhì)相似,一般需要用兩種以上方法來(lái)分析蛋白的純度。對(duì)蛋白質(zhì)純度的要求因需要而異,生物制品考慮制品體內(nèi)的副作用;物理化學(xué)研究要求不干擾對(duì)象的理化性質(zhì);化學(xué)結(jié)構(gòu)分析要求雜質(zhì)含量低于分析方法的靈敏度等。目前九十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)確定蛋白質(zhì)樣品純度的標(biāo)準(zhǔn)一般為:分子大小均一,電荷均一,氨基酸組成恒定,具有單一的N末端和C末端殘基,進(jìn)一步純化時(shí)生物活性是否再有提高及能否結(jié)晶等。目前一百頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)以上幾條是較嚴(yán)格的要求,很難全都達(dá)到。通常以電泳時(shí)呈現(xiàn)一條帶以及末端殘基鑒定是單一的即可進(jìn)行順序測(cè)定。從N末端測(cè)順序一般在4步以上,如果都是單一的氨基酸殘基,則含雜質(zhì)可能為十六萬(wàn)分之一。目前一百零一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)隨著分析技術(shù)水平的不斷提高,經(jīng)常還將一種曾認(rèn)為是純的蛋白質(zhì)分離成幾個(gè)組分,即出現(xiàn)微不均一性(Microheterogeneity)的現(xiàn)象。這種不均一性可分為兩類情況。目前一百零二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)一類是在蛋白質(zhì)肽鏈合成后在加工中產(chǎn)生的。如糖蛋白由于含糖量不同,它們的電泳行為常表現(xiàn)很大差異;又如賴氨酸的甲基化,絲氨酸的磷酰化以及磺?;?,也會(huì)產(chǎn)生電泳行為的不均一性;還有一些則是在分離純化過(guò)程中人為產(chǎn)生的,如脫酰氨等,這種不均一性對(duì)蛋白質(zhì)順序分析不會(huì)帶來(lái)太大的困難。目前一百零三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)另一類不均一性是由于基因家族產(chǎn)生的,它們之間的不同表現(xiàn)為個(gè)別氨基酸的替換、N端或C端肽段的缺失等,這種不均一性會(huì)給蛋白質(zhì)分析帶來(lái)很大困難。目前一百零四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)但蛋白質(zhì)分子的一部分分子的一個(gè)側(cè)鏈酰基變成了羧基,糖蛋白的配基相差一個(gè)單糖,這種情況下蛋白質(zhì)化學(xué)結(jié)構(gòu)仍是單元一蛋白質(zhì),生物功能也無(wú)任何影響。此外還有同功蛋白質(zhì)(Isoprotein),它的功能相同但化學(xué)結(jié)構(gòu)不同,從功能上看純了從結(jié)構(gòu)上看不純。因此,純度屬相對(duì)的概念,具體情況要多做具體分析,切不可簡(jiǎn)單化。目前一百零五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.2蛋白質(zhì)含量測(cè)定凱氏定氮法Folin-酚試劑法(Lowry法)考馬斯亮藍(lán)法(Bradford法)目前一百零六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)目前一百零七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)一種蛋白質(zhì)溶液用這幾種方法測(cè)定,可能得出不同的結(jié)果。每種測(cè)定法都不是完美無(wú)缺的,都有優(yōu)缺點(diǎn)。在選擇方法時(shí)應(yīng)考慮:①實(shí)驗(yàn)對(duì)測(cè)定所要求的靈敏度和精確度;②蛋白質(zhì)的性質(zhì);③溶液中存在的干擾物質(zhì);④測(cè)定所要花費(fèi)的時(shí)間。目前一百零八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.3蛋白質(zhì)序列測(cè)定蛋白質(zhì)的生物功能歸根結(jié)底是其一級(jí)結(jié)構(gòu)的反映,因此,搞清蛋白質(zhì)的氨基酸序列對(duì)闡明序列與功能的關(guān)系、生物進(jìn)化、遺傳變異等有重要意義。目前一百零九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)蛋白質(zhì)測(cè)序存在兩個(gè)難題:得到高精度純化的蛋白和提純低分子量蛋白。例如,在人類破譯干擾素結(jié)構(gòu)之前的20多年中,很難對(duì)其進(jìn)行純化。目前一百一十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)1955年Sanger用了10年時(shí)間測(cè)定了牛胰島素序列。之后測(cè)序技術(shù)迅速發(fā)展,并已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了自動(dòng)化,現(xiàn)在已經(jīng)對(duì)幾十萬(wàn)種蛋白質(zhì)進(jìn)行了序列測(cè)定。4.3.1蛋白質(zhì)測(cè)序策略目前一百一十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)Edman化學(xué)降解法、質(zhì)譜法、根據(jù)核酸序列推測(cè)肽鏈順序、肽鏈條數(shù)判定、二硫鍵斷裂及多肽鏈拆分、分子量測(cè)定、氨基酸組成分析、N-端和C-端殘基測(cè)定、肽鏈的部分裂解和純化、肽段氨基酸序列測(cè)定、肽段次序決定。目前一百一十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.3.2蛋白質(zhì)自動(dòng)序列分析儀1967年Edman推出第一臺(tái)自動(dòng)測(cè)序儀,測(cè)序儀的發(fā)展以后又經(jīng)歷了液相測(cè)序儀-固相測(cè)序儀-氣相測(cè)序儀的發(fā)展歷程。液相測(cè)序:樣品一直處于溶液狀態(tài),樣品沒有耦聯(lián)到任何載體上,樣品容易損失。目前一百一十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)固相測(cè)序:將蛋白質(zhì)共價(jià)耦聯(lián)于聚苯乙烯膜,微孔玻珠或PVDF膜上再進(jìn)行序列分析的方法。這樣可避免因沖洗而使樣品損失,同時(shí)在序列降解及沖洗步驟采取較劇烈的條件。目前一百一十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)氣相測(cè)序:蛋白質(zhì)通過(guò)polybrene等載體吸附在化學(xué)惰性的玻璃濾膜上,偶聯(lián)堿和裂解酸以氣相方式轉(zhuǎn)運(yùn),反應(yīng)副產(chǎn)物和ATZ氨基酸通過(guò)有機(jī)溶劑以氣相方式萃取,蛋白質(zhì)本身不會(huì)丟失。目前一百一十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)目前一百一十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)序列測(cè)試時(shí)應(yīng)注意的問題樣品純度:>90%,鹽含量在50mmol/L內(nèi),不含變性劑(如SDS)等雜質(zhì),其N-端必須是均一的高純樣品。例如樣品中含2個(gè)混合物,只有含量相差4~5倍以上才能對(duì)主序列和次序列進(jìn)行分析。純度鑒定方法:質(zhì)譜、SDS、HPLC、HPCE,一般采用2種以上的方法驗(yàn)證。目前一百一十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)樣品量:至少需要10pmol,例如標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)測(cè)定:10pmol樣品可測(cè)定20氨基酸殘基。一般樣品量大于50pmol或者更多測(cè)定序列越長(zhǎng)。如分子量為20kD的蛋白質(zhì),50pmol約為1g。所以蛋白質(zhì)N-端測(cè)序?qū)儆诔R?guī)測(cè)定。目前一百一十八頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)樣品存在狀態(tài)液體:液體樣品中不能含有蛋白酶以防降解,同時(shí)樣品測(cè)試前不能放置太久,在-20℃以下保存,最好盡早測(cè)試。轉(zhuǎn)膜樣品:樣品經(jīng)凝膠電泳分離后,應(yīng)馬上進(jìn)行電轉(zhuǎn)移至PVDF膜上面,轉(zhuǎn)膜前不能放置很久以防止樣品擴(kuò)散。含有樣品的PVDF可以用濾紙夾住保持在密封塑料袋中,可以在冰箱保存3~6個(gè)月。目前一百一十九頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)如果樣品沒有任何信號(hào)峰,要考慮蛋白N-端封閉。須經(jīng)蛋白質(zhì)化學(xué)降解或酶切后分離后分析。有時(shí)樣品在分離純化中也會(huì)產(chǎn)生N-端封閉,主要由于溶液中去垢劑或化學(xué)物質(zhì)與蛋白樣品N-端功能基團(tuán)反應(yīng),或者分離純化中pH過(guò)高(>9-10)。目前一百二十頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)轉(zhuǎn)膜樣品要求為防止部分蛋白質(zhì)在電泳過(guò)程被膠內(nèi)雜質(zhì)而封閉N-末端,請(qǐng)預(yù)先自做預(yù)電泳。即用低電壓跑空膠2~2.5h再上樣電泳分離。電泳過(guò)程中,用盡量避免條帶拖尾現(xiàn)象,用于測(cè)序的條帶用狹窄清晰。而且必須保證一定的量,測(cè)定20個(gè)氨基酸以上的蛋白質(zhì),至少需要2~3條明亮清晰的條帶。目前一百二十一頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)樣品轉(zhuǎn)膜后請(qǐng)用CoomassieR-250染色1分鐘以內(nèi),避免使用CoomassieG-250.電泳緩沖液建議使用CAPS(3-環(huán)己胺丙磺酸)緩沖液,不要使用Tris-Gly緩沖液。目前一百二十二頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.4WesternBlotting4.4.1試劑4.4.1.1電泳試劑①30%丙烯酰胺溶液:丙烯酰胺29.0g,甲叉雙丙烯酰胺1.0g,加水至100ml,棕色瓶4℃保存。②1.5mol/LTris-HCl分離膠緩沖液pH8.8(4×):取18.15gTris,用1MHCl調(diào)pH至8.8,加水至100ml,4℃保存。目前一百二十三頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)③0.5mol/LTris-HCl濃縮膠緩沖液,pH6.8(8×):取11.96gTris,用1MHCl調(diào)至pH6.8,加水至100ml,4℃保存。④電極緩沖液(pH8.3):取14.49g甘氨酸,3.02gTris,加100ml10%SDS,加水至1升,4℃保存。⑤10%SDS:取10gSDS加水至100ml,完全溶解后室溫保存。目前一百二十四頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)⑥10%過(guò)硫酸銨溶液(AP):臨用前現(xiàn)配。⑦染色液(0.25%考馬斯亮藍(lán)R-250、50%甲醇、7%乙酸):考馬斯亮藍(lán)R-2502.5g、甲醇(可用無(wú)水乙醇代替)500ml、70ml冰乙酸,溶解后補(bǔ)足水至總體積1000ml。⑧脫色液(30%甲醇、7%乙酸):甲醇(可用無(wú)水乙醇代替)300ml,冰乙酸70ml,補(bǔ)足水至1000ml。目前一百二十五頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)⑨樣品緩沖液(2×):H2O2.4ml,濃縮膠緩沖液1.0ml、甘油0.8ml、10%SDS3.2ml,β-巰基乙醇0.4ml,0.025%(W/V)溴酚蘭0.2ml。⑩TEMED(四甲基乙二胺)目前一百二十六頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)4.4.4.2轉(zhuǎn)移和雜交試劑①轉(zhuǎn)移緩沖液:3.03gTris、14.4g的Glycine、200ml甲醇、定容到1L。②TBS:0.1M的Tris、0.9%的NaCl、pH7.5③TTBS:TBS中含0.1%的Tween-20④預(yù)染的蛋白marker⑤硝酸纖維素膜目前一百二十七頁(yè)\總數(shù)一百四十五頁(yè)\編于十八點(diǎn)⑥脫脂奶粉⑦anti-
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