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1、P58,演示者:luyaping,蛋白質(zhì)的次級結(jié)構(gòu),P58,蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu),2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu)是指多肽鏈本身在特定方向上氫鍵纏繞折疊形成的形式。二次結(jié)構(gòu)的概念,2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),天然蛋白質(zhì)的主要二次結(jié)構(gòu)單位是a-螺旋B-折疊B-角(B- turn)2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),钚鏈的酰胺平面圍繞C旋轉(zhuǎn)一定角度,右手螺旋。酰胺平面平行于中心軸。1 .-螺旋,2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),钚鏈的酰胺平面圍繞C旋轉(zhuǎn)一定角度,右手螺旋。酰胺平面平行于中心軸。1 .-螺旋,2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),钚鏈的酰胺平面圍繞C旋轉(zhuǎn)一定角度,右手螺旋。酰胺平

2、面平行于中心軸。螺旋的所有氨基酸殘基側(cè)鏈向外延伸。1 .-螺旋,2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),钚鏈的酰胺平面圍繞C旋轉(zhuǎn)一定角度,右手螺旋。酰胺平面平行于中心軸。螺旋的所有氨基酸殘基側(cè)鏈向外延伸。每個氨基酸殘基的N-H是前面第四個殘基C=O和氫鍵;每3.6個氨基酸殘基螺旋上升一個蟑螂。每個旋轉(zhuǎn)間隔為0.54nm。1 .-螺旋(-螺旋),1。-螺旋(-helix),(3)輔助結(jié)構(gòu)單位的種類,2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),氫鍵,aa殘基的羰基,以及其后的第四次aa殘基,1-螺旋(-helix),(3)二次結(jié)構(gòu)單位的種類,2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu)、氫鍵、氫鍵等基本上與中軸平行。主鏈中的所有肽鍵基本上參與了氫鍵的形成,

3、因此a-螺旋相當(dāng)穩(wěn)定。側(cè)鏈在a-螺旋結(jié)構(gòu)中的作用,1 .-螺旋(-helix),(3)二級結(jié)構(gòu)單位的種類,2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),R牙齒Pro時N-Ca的旋轉(zhuǎn)受到限制。如果n沒有氫,氫鍵形成將渡邊杏。因此,螺旋中斷或旋轉(zhuǎn),因為存在Pro時無法形成a-螺旋。側(cè)鏈在a-螺旋結(jié)構(gòu)中的作用,1 .-螺旋(-helix),(3)二級結(jié)構(gòu)單位的種類,2 .如果蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),R牙齒Gly,兩邊S鍵(CA,a-螺旋結(jié)構(gòu)中側(cè)鏈的作用,1,因為Ca中有兩個氫。-螺旋(-helix),(3)二級結(jié)構(gòu)單位的種類,2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),具有相同電荷的氨基酸殘基連續(xù)出現(xiàn)時,側(cè)鏈之間有靜電斥力,傾向于展開螺旋,降低螺

4、旋的穩(wěn)定性。在角蛋白中,幾乎所有的a螺旋,球形蛋白質(zhì)中,通常a螺旋的分段,肌紅蛋白,膜蛋白分子中鑲嵌膜內(nèi)的部分,也幾乎垂直于a螺旋結(jié)構(gòu),2,-折疊,側(cè)鏈組和C之間的鍵。-折疊分裂并行和半并行,后者更為穩(wěn)定。n端位于同一端。沿氨基酸之間的軸0.325nm,N距離,N端不在同一端。沿氨基酸之間的軸0.35nm,(3)二級結(jié)構(gòu)單元的種類,2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),二次,-折疊(-pleated sheet),(3)二次結(jié)構(gòu)單位的種類,二次。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu)B-折疊通常存在于球形蛋白質(zhì)中。例如胰蛋白酶,羧肽酶:(3)二級結(jié)構(gòu)單元的種類,2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),3,-角(-turn),又稱-折疊,存在于球形蛋白質(zhì)中。其特點是氨基酸殘基的C=O和第四殘基的N-H氫鍵。-角落在蛋白質(zhì)分子的表面。(3)二次結(jié)構(gòu)單元的種類,2 .蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),3,-角(-turn),(3)二次結(jié)構(gòu)單位的種類,2。蛋白質(zhì)的二次結(jié)構(gòu),嘌呤和甘氨酸酶的功能部位經(jīng)常在這種構(gòu)想領(lǐng)域。不規(guī)則卷邊通常顯示在

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