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1、第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,侯艷飛 康紅勛 中國科學(xué)院計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)信息中心,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)研究與實(shí)踐,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 內(nèi)蒙古海拉爾,2005年6月1924日,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,目 錄,背景 科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)的分類 科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)框架 科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)制定實(shí)踐 科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)管理 總結(jié)和進(jìn)一步工作方向,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,背 景,元數(shù)據(jù)與資源 元數(shù)據(jù):“關(guān)于數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)” 。進(jìn)一步解釋:描述資源的特征的結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)。 資源:可以為人類或者計(jì)算機(jī)系統(tǒng)作為離散的實(shí)體標(biāo)識(shí)的任何東西,第
2、三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,背 景(Cont.),中國科學(xué)院科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng) 幾十家建庫單位近二十年的持續(xù)建設(shè),380多個(gè)專業(yè)數(shù)據(jù)庫,13TB數(shù)據(jù)量,涉及天文、地理、生物、化學(xué)、物理、材料、環(huán)境等若干自然科學(xué)領(lǐng)域 無論是每個(gè)專業(yè)子庫本身的數(shù)據(jù)量,還是專業(yè)子庫的種類和數(shù)量,都在不斷增長(zhǎng),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,背 景(Cont.),科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)對(duì)元數(shù)據(jù)的需求 科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)門戶站點(diǎn)暴露出專業(yè)子庫級(jí)數(shù)據(jù)資源的組織相對(duì)無序,用戶難以快速發(fā)現(xiàn)、快速選擇和正確使用數(shù)據(jù)庫的問題 數(shù)據(jù)庫的設(shè)計(jì)者和開發(fā)者大多都沒有將其最初的設(shè)計(jì)思想、數(shù)據(jù)庫的結(jié)構(gòu)、數(shù)據(jù)語義等相
3、關(guān)信息明確地、顯性地表達(dá)出來,為數(shù)據(jù)庫自身在日后的管理和應(yīng)用帶來困難 各建庫單位在專業(yè)子庫建設(shè)過程中的獨(dú)立性和自治性,導(dǎo)致有關(guān)專業(yè)數(shù)據(jù)庫之間天然的異構(gòu)性,集成和統(tǒng)一訪問服務(wù)面臨著困難,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)分類,數(shù)據(jù)資源組織管理的角度 各專業(yè)子庫內(nèi)的數(shù)據(jù)實(shí)例聚集成各專業(yè)子庫,專業(yè)子庫建設(shè)者負(fù)責(zé)專業(yè)子庫內(nèi)數(shù)據(jù)資源的組織 各專業(yè)子庫聚集成整個(gè)科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)門戶建設(shè)者負(fù)責(zé)專業(yè)子庫級(jí)數(shù)據(jù)資源的組織 用戶進(jìn)行資源發(fā)現(xiàn)的角度 一般流程:查找可能需要的專業(yè)子庫在相關(guān)專業(yè)子庫中查找可能需要的數(shù)據(jù)實(shí)例訪問和獲取選定的數(shù)據(jù)實(shí)例的全部或部分內(nèi)容 用戶在資
4、源發(fā)現(xiàn)的不同階段,查找和訪問不同粒度的數(shù)據(jù)資源,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)分類(Cont.),科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)從描述對(duì)象的粒度分類,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)分類(Cont.),數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)集:以一定結(jié)構(gòu)編碼的相關(guān)數(shù)據(jù)的可標(biāo)識(shí)集合,數(shù)據(jù)庫包含在內(nèi) 可進(jìn)一步分為數(shù)據(jù)集通用元數(shù)據(jù)和特定元數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)對(duì)象元數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)對(duì)象:不具備數(shù)據(jù)集這樣的容器性的實(shí)體,例如,一幅圖像、一篇文獻(xiàn)、一個(gè)視頻、數(shù)據(jù)庫中的一個(gè)數(shù)據(jù)實(shí)例(所指向的實(shí)體)等 可以劃分為單數(shù)據(jù)集內(nèi)數(shù)據(jù)對(duì)象元數(shù)據(jù)(例如單個(gè)數(shù)據(jù)庫模式的信息)和多數(shù)據(jù)集內(nèi)數(shù)據(jù)對(duì)象元
5、數(shù)據(jù),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)分類(Cont.),數(shù)據(jù)對(duì)象元數(shù)據(jù) 多數(shù)據(jù)集內(nèi)信息對(duì)象元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)主要服務(wù)于相關(guān)資源的整合集成,分析的是具有相同或者相關(guān)主題的若干數(shù)據(jù)集中的數(shù)據(jù)對(duì)象的描述模式,這些數(shù)據(jù)集的共同特點(diǎn)是所包含的數(shù)據(jù)對(duì)象指向同一類實(shí)體,但是它們或者是異構(gòu)的,或者包含了實(shí)體在不同特征上的信息 數(shù)據(jù)元素元數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)對(duì)象元數(shù)據(jù)都是由一組數(shù)據(jù)元素/元素值對(duì)構(gòu)成 數(shù)據(jù)元素元數(shù)據(jù)是前兩類元數(shù)據(jù)的基礎(chǔ),分析的是數(shù)據(jù)元素的描述模式,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)框架,數(shù)據(jù)元素元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),通用元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),特
6、定領(lǐng)域元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),特定數(shù)據(jù)集類型元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),數(shù)據(jù)對(duì)象元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),元數(shù)據(jù)應(yīng)用方案(Application Profiles),數(shù)據(jù)集層,數(shù)據(jù)對(duì)象層,數(shù)據(jù)元素,語義定義,抽象句法,編碼體系,句法描述語言,具體句法,擴(kuò)展和制定元數(shù)據(jù)應(yīng)用方案規(guī)則,元數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),參考標(biāo)準(zhǔn)集: ISO 11179,DC, ISO 19115,EML,MPEG7,ABCD,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),數(shù)據(jù)元素元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 用以規(guī)范作為其他元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)核心組成部分的數(shù)據(jù)元素的描述模式,在科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)體系中具有基礎(chǔ)性 基于ISO/IEC 11179第三部分,并規(guī)定對(duì)于每一個(gè)數(shù)
7、據(jù)元素,至少描述其名稱、英文標(biāo)簽、標(biāo)識(shí)符、定義、數(shù)據(jù)類型、值域、約束、最大出現(xiàn)次數(shù)這八個(gè)基本屬性,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(Cont.),數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 科學(xué)數(shù)據(jù)庫核心元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 為科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中的所有數(shù)據(jù)集資源提供的一套通用的描述元素和規(guī)范,保證各數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)施之間有較高程度的語義互操作性 按照“根元素元數(shù)據(jù)模塊復(fù)合數(shù)據(jù)元素簡(jiǎn)單數(shù)據(jù)元素”這樣一種樹狀層次結(jié)構(gòu)組織 可利用科學(xué)數(shù)據(jù)庫中心自主開發(fā)的“通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng)”實(shí)施,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(Cont.),科學(xué)數(shù)據(jù)庫生態(tài)研究元
8、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 在科學(xué)數(shù)據(jù)庫核心元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的基礎(chǔ)上制定的一個(gè)Application Profile 針對(duì)生態(tài)觀測(cè)、試驗(yàn)中產(chǎn)生的列表類型數(shù)據(jù)集 可借助“通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng)”實(shí)施;還開發(fā)了專門的“生態(tài)研究元數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)”,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(Cont.),科學(xué)數(shù)據(jù)庫大氣數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 基于核心標(biāo)準(zhǔn),針對(duì)大氣觀測(cè)臺(tái)站產(chǎn)生的大量格點(diǎn)資料和臺(tái)站資料制定的一個(gè)Application Profile,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(Cont.),數(shù)據(jù)對(duì)象元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 科學(xué)數(shù)據(jù)庫通用圖像元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 針對(duì)圖像提供一套通
9、用的數(shù)據(jù)元素和規(guī)范 直接基于本標(biāo)準(zhǔn)開發(fā)圖像管理系統(tǒng);將本標(biāo)準(zhǔn)用作科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)內(nèi)各圖像數(shù)據(jù)庫集成的基礎(chǔ) 科學(xué)數(shù)據(jù)庫圖像管理和檢索系統(tǒng),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)(Cont.),科學(xué)數(shù)據(jù)庫生物多樣性數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 以生物物種為研究對(duì)象,提供對(duì)生物物種的生物分類、分布地、形態(tài)、價(jià)值、核算序列、關(guān)聯(lián)物種、相關(guān)多媒體以及其他一些方面的特征進(jìn)行描述的一組數(shù)據(jù)元素,形成描述生物物種的概念數(shù)據(jù)模型 作為科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中生物物種數(shù)據(jù)庫語義互操作和集成的基礎(chǔ)和中心 科學(xué)數(shù)據(jù)庫材料數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn) 面向材料數(shù)據(jù)的整合和集成,分析研究材料數(shù)據(jù)的概念數(shù)據(jù)模型,第三屆兩岸三院
10、信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)管理,兩大部分:元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)管理、元數(shù)據(jù)實(shí)例管理。 對(duì)于元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn),以元數(shù)據(jù)注冊(cè)系統(tǒng)進(jìn)行管理 對(duì)于元數(shù)據(jù)實(shí)例,視元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的具體應(yīng)用而有所不同 以“通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng)”管理 以其他系統(tǒng)管理(例如,生態(tài)研究元數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)、圖像管理和檢索系統(tǒng)),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)管理(Cont.),科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)注冊(cè)系統(tǒng) 注冊(cè)、管理和發(fā)布元數(shù)據(jù)模式及包含的數(shù)據(jù)元素的語義和結(jié)構(gòu)的權(quán)威信息的系統(tǒng) 包含元數(shù)據(jù)模式、數(shù)據(jù)元素、編碼體系以及三者之間的關(guān)聯(lián)、元數(shù)據(jù)模式間數(shù)據(jù)元素之間的對(duì)應(yīng)關(guān)系等信息 功能 基本功能:以
11、上信息的登記、管理、發(fā)布和查詢 高級(jí)功能:元數(shù)據(jù)實(shí)例從符合一種元數(shù)據(jù)模式到符合另一種元數(shù)據(jù)模式的轉(zhuǎn)換,復(fù)用已有元數(shù)據(jù)模式中的數(shù)據(jù)元素創(chuàng)建新的元數(shù)據(jù)應(yīng)用方案,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)管理(Cont.),注:目前已完成本系統(tǒng)第一階段的開發(fā)工作,實(shí)現(xiàn)基本功能。,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)管理(Cont.),通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng) 配置不同元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的XML Schema定義文件,可完成對(duì)不同元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)施 通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng)的演變 元數(shù)據(jù)工具一期 元數(shù)據(jù)工具部署在數(shù)據(jù)中心,元數(shù)據(jù)提供者遠(yuǎn)程錄入元數(shù)據(jù),提供
12、元數(shù)據(jù)查詢服務(wù) 采用集中式管理,LDAP作為后端存貯 存在的問題:LDAP查詢速度慢,跨元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)查詢可能造成深層遞歸和內(nèi)存溢出;系統(tǒng)中間層和LDAP的交互式系統(tǒng)的主要瓶頸;用戶界面欠人性化,表單過長(zhǎng),錄入繁瑣;缺乏元數(shù)據(jù)校驗(yàn)功能。,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng)的演變 元數(shù)據(jù)工具二期 元數(shù)據(jù)工具本地安裝,元數(shù)據(jù)提供者本地錄入元數(shù)據(jù) 采用xml文件作為后端存貯結(jié)構(gòu),元數(shù)據(jù)實(shí)例文件通過上報(bào)方式匯總到數(shù)據(jù)中心 存在的問題:缺乏元數(shù)據(jù)校驗(yàn)功能;未解決不同版本元數(shù)據(jù)之間轉(zhuǎn)換問題;結(jié)構(gòu)描述信息抽取功能有待提高;不具備查詢功能,第三屆
13、兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng)的演變 從以往的元數(shù)據(jù)管理工具的使用中得出的“經(jīng)驗(yàn)教訓(xùn)” 需要對(duì)數(shù)據(jù)集URI進(jìn)行規(guī)范管理 需要提高工具的自動(dòng)化程度,以減少人工成本,包括部分元數(shù)據(jù)的自動(dòng)產(chǎn)生和元數(shù)據(jù)的自動(dòng)校驗(yàn) 不僅需要簡(jiǎn)單查詢功能,還需要復(fù)雜查詢功能,來滿足用戶需求 目前的元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),元數(shù)據(jù)管理工具 一個(gè)可在本地安裝的應(yīng)用程序,提供元數(shù)據(jù)編輯、錄入、校驗(yàn)、元數(shù)據(jù)上報(bào)/下
14、載等功能 元數(shù)據(jù)以xml文件形式存貯在本地,同時(shí)可通過上報(bào)功能提交到中心SubVersion元數(shù)據(jù)存貯庫中,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),元數(shù)據(jù)管理系統(tǒng) 部署在數(shù)據(jù)中心,基于元數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫 實(shí)現(xiàn)對(duì)元數(shù)據(jù)的集中管理,功能包括元數(shù)據(jù)實(shí)例審核、統(tǒng)計(jì)、版本管理、數(shù)據(jù)集URI管理、用戶管理和其他附加信息管理功能 元數(shù)據(jù)存貯庫分為兩個(gè)部分:SubVersion版本管理庫,用來存貯和管理各個(gè)版本的元數(shù)據(jù)實(shí)例;關(guān)系數(shù)據(jù)庫,用來存貯和管理建庫單位、URI、審核信息等其他的附加信息。 元數(shù)據(jù)服務(wù)系統(tǒng) 對(duì)外提供元數(shù)據(jù)服務(wù)的窗口,供查詢、瀏覽和獲取元數(shù)據(jù)信息。也通過WEB
15、服務(wù)接口對(duì)部分用戶提供應(yīng)用程序接口。 綜合使用xslt、js、css等技術(shù),實(shí)現(xiàn)元數(shù)據(jù)的樹狀顯示,很好地保持了元數(shù)據(jù)的層次結(jié)構(gòu),方便用戶的瀏覽。 Xml文件的存貯采用xml數(shù)據(jù)庫,解決元數(shù)據(jù)的檢索難題,第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)管理(Cont.),生態(tài)研究元數(shù)據(jù)管理系統(tǒng),第三屆兩岸三院信息技術(shù)與應(yīng)用研討會(huì) 2005-06,總結(jié)和進(jìn)一步工作方向,總結(jié) 中國科學(xué)院科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)經(jīng)過三年多的元數(shù)據(jù)研究和建設(shè),目前已經(jīng)完成科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)框架、核心元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、生態(tài)研究元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、大氣數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、通用圖像元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、生物多樣性數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)、數(shù)據(jù)元素元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)等的制定,并開發(fā)了和正在開發(fā)一些工具和系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)對(duì)元數(shù)據(jù)的著錄和管理 利用科學(xué)數(shù)據(jù)庫元數(shù)據(jù)注冊(cè)系統(tǒng),進(jìn)行元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的管理 已利用核心標(biāo)準(zhǔn)和通用元數(shù)據(jù)管理和服務(wù)系統(tǒng),收集到科學(xué)數(shù)據(jù)庫各主體庫、專業(yè)子庫等400多條通過了審核的元數(shù)據(jù)?;诖烁倪M(jìn)科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)門戶的資源管理與服務(wù)能力 在生物多樣性數(shù)據(jù)元數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)基礎(chǔ)上,設(shè)計(jì)了科學(xué)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)內(nèi)生物物種數(shù)據(jù)整合和統(tǒng)一訪
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