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密級(jí): 論文編號(hào): 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 碩士 學(xué)位論文 中國(guó)綿羊核心種質(zhì)構(gòu)建方法的初步研究 o: I 摘 要 綿羊品種資源是 一種可更新的生物遺傳資源, 是維持人類(lèi)生存、維護(hù)國(guó)家生態(tài)安全的物質(zhì)基礎(chǔ),是持續(xù)發(fā)展我國(guó)養(yǎng)羊業(yè)生 產(chǎn)和改善人民生活的重要生產(chǎn)資料和生活資料。正確認(rèn)識(shí)我國(guó)綿羊地方品種資源的地位和作用, 確定我國(guó)地方綿羊品種中具有特殊遺傳和開(kāi)發(fā)利用價(jià)值的群體, 加強(qiáng)對(duì)地方品種中特異基因資源的發(fā)掘、定位和創(chuàng)新利用是解決如何將我國(guó)的綿羊資源優(yōu)勢(shì)轉(zhuǎn)變?yōu)榧夹g(shù)優(yōu)勢(shì)和產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)這一重大問(wèn)題的基礎(chǔ),也是在傳統(tǒng)育種工作的基礎(chǔ)上開(kāi)展 分子標(biāo)記輔助 育種和品種分子 設(shè)計(jì) 的前提。 本文提出了中國(guó)綿羊核心種質(zhì)的構(gòu)建策略并對(duì)其可行性進(jìn)行了研究。在已有資料的基礎(chǔ)上以 33 個(gè)中國(guó)地方綿羊品種為總體,以系統(tǒng)的觀點(diǎn),采用統(tǒng)計(jì)學(xué)的方法結(jié)合起源,形態(tài)特征,地理分布和分子生物 學(xué)的信息構(gòu)建了中國(guó)綿羊的次級(jí)核心種質(zhì)并對(duì)它的代表性進(jìn)行了檢驗(yàn)。 主要的研究結(jié)果如下: 1. 根據(jù)地理分布信息、形態(tài)信息從 33 個(gè)地方綿羊品種中選取 6 個(gè)綿羊品種: 大尾寒羊 (湖羊 (騰沖羊 (烏珠穆沁羊 (哈薩克羊 (藏羊 (構(gòu)建了中國(guó)綿羊品種資源的初級(jí)核心種質(zhì)。 2. 用 31 對(duì) 物對(duì) 6個(gè)地方綿羊品種進(jìn)行遺傳多樣性分析。共檢測(cè)到 326個(gè)等位基因,每個(gè)位點(diǎn)的等位基因數(shù)在 6均等位基因數(shù)為 間,平均為 明中國(guó)綿羊初級(jí)核心種質(zhì)的遺傳多樣性較高。 3. 根據(jù)地理分布特征、形態(tài)特征和分子標(biāo)記特征對(duì) 6個(gè)地方綿羊品種進(jìn)行聚類(lèi)分析。以距離系數(shù) 10為標(biāo)準(zhǔn),將 6個(gè)中國(guó)地方綿羊品種分為類(lèi)。 4. 初步選取了大尾寒羊 (湖羊 (烏珠穆沁羊 (哈薩克羊 ( 個(gè)綿羊品種作為次級(jí)核心種質(zhì),通過(guò)對(duì)核心種質(zhì)的檢驗(yàn),證明了已構(gòu)建的核心種質(zhì)具有較好的代表性。 5. 采用 地理分布信息和形態(tài)信息進(jìn)行初步聚類(lèi)分析, 以合理的取樣方法及取樣比例選取初級(jí)核心群體,應(yīng)用 平的 據(jù)進(jìn)行再次聚類(lèi),可以構(gòu)建出具有最大遺 傳多樣性代表性的綿羊核心種質(zhì)。 關(guān)鍵詞 : 中國(guó)綿羊 , 核心種質(zhì) , 微衛(wèi)星 he a a of of in of to of In we of to to 4 as 3 of as 1. of by 2. 31 to A 26 of 7( IC( of 3. 33 on 4. as of 5. in SR to we of by 錄 第一章 緒 論 . 5 . 5 . 5 . 6 . 7 . 9 機(jī)保種理論 . 9 . 10 . 10 . 10 國(guó)綿羊生態(tài)類(lèi)型多樣化 . 11 . 12 羊核心種質(zhì) . 12 . 12 . 13 . 13 . 14 . 15 . 16 . 16 . 16 第二章 材料與方法 . 17 . 17 . 17 . 17 . 18 . 18 . 19 . 19 . 19 . 19 . 20 . 20 . 21 . 21 . 24 第三章 結(jié)果與分析 . 25 . 25 . 25 . 25 . 26 . 26 . 27 . 27 . 27 . 28 . 28 . 30 . 31 析 . 32 . 33 . 36 . 37 . 38 第四章 討 論 . 40 . 40 . 40 . 41 . 41 第五章 結(jié) 論 . 43 結(jié)論 . 43 . 43 參考文獻(xiàn) . 44 附 錄 . 49 致 謝 . 56 個(gè)人簡(jiǎn)歷 . 57 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 5 第一章 緒 論 傳多樣性的概念及其意義 生物多樣性( 單地說(shuō)是生命有機(jī)體及其借以存在的生態(tài)復(fù)合體的多樣性和變異性( ,1990)。確 切地說(shuō),生物多樣性是所有生物種內(nèi)遺傳變異和他們的生存環(huán)境的總稱(chēng)。包括所有不同種類(lèi)的動(dòng)物、植物和微生物,以及它們所擁有的基因,它們與生存環(huán)境所組成的生態(tài)系統(tǒng)(汪松,陳靈芝, 1990)。因此,生物多樣性包括 4 個(gè)層次,即遺傳多樣性、物種多樣性、生態(tài)系統(tǒng)多樣性和景觀多樣性。生物多樣性是人類(lèi)賴(lài)以生存的各種生命資源的總匯和未來(lái)工農(nóng)業(yè)、醫(yī)藥業(yè)發(fā)展的基礎(chǔ),為人類(lèi)提供了食物、能源、材料等基本需求,同時(shí)生物多樣性對(duì)于維持生態(tài)平衡、穩(wěn)定環(huán)境具有關(guān)鍵性作用,為全人類(lèi)帶來(lái)了難以估計(jì)的利益。生物多樣性的存在使人類(lèi)有可能多方面、多層次地 持續(xù)利用,甚至改造這個(gè)生機(jī)勃勃的生命世界。 喪失生物多樣性必然引起人類(lèi)生存與發(fā)展的根本危機(jī)。脊椎動(dòng)物中的生存期一般認(rèn)為是500萬(wàn)年,在過(guò)去上億年中,自然滅絕速率不斷加快,現(xiàn)在的滅絕速率是地球史上最高的( 988) ,為自然滅絕速度的 1000 倍!中國(guó)是世界上少數(shù)幾個(gè)“生物多樣性特別豐富的國(guó)家 ” ( 一,物種數(shù)約占世界總數(shù)的 10%。但現(xiàn)在中國(guó)有 15%物種受到嚴(yán)重威脅,在瀕危野生動(dòng)植物國(guó)際貿(mào)易公約列出的 640個(gè)世界性瀕危物種中,中國(guó)占 156種,約為總數(shù)的四分之一。面臨日益嚴(yán)重的物種喪失和生態(tài)環(huán)境破壞,人們?cè)絹?lái)越重視生物多樣性保護(hù)。世界觀察研究所( 國(guó)際保護(hù)自然和自然資源聯(lián)盟( 聯(lián)合國(guó)環(huán)境項(xiàng)目( 1991 年發(fā)布了生物多樣性現(xiàn)狀報(bào)告,起草了生物多樣性保護(hù)戰(zhàn)略和保護(hù)生物多樣性的十年行動(dòng)計(jì)劃。生物多樣性保護(hù)已成為國(guó)際關(guān)注的全球熱點(diǎn)問(wèn)題之一。 遺傳多樣性( 生物多樣性的重要組成部分。廣義的遺傳多樣性是指地球上的所有生物攜帶的遺傳信息的總和,蘊(yùn)藏在動(dòng)植物和微生物個(gè)體的基因里。通常談及生態(tài) 系統(tǒng)多樣性或物種多樣性時(shí)也就包含了各自的遺傳多樣性。狹義的遺傳多樣性主要是指種內(nèi)不同群體之間或一個(gè)群體內(nèi)不同個(gè)體的遺傳變異的總和。遺傳信息儲(chǔ)存在染色體和細(xì)胞器基因組的 列中。雖然動(dòng)植物和其他生物一樣都能準(zhǔn)確的復(fù)制自己的遺傳物質(zhì) 自己的遺傳信息代代相傳,以保持遺傳性狀的穩(wěn)定性。但有許多因素能影響 些影響因素有的是來(lái)自外界的,有的是本身的。可能引起的變化也是多種多樣的,小的可能是一個(gè)堿基對(duì)的變化,大的可能由于 位、缺失或轉(zhuǎn)座而引起多個(gè)堿基對(duì)的改變,從而導(dǎo)致不同 程度的遺傳變異。隨著遺傳變異的不斷積累,遺傳多樣性的內(nèi)容也就不斷地得到豐富。一個(gè)物種的遺傳變異愈豐富,對(duì)環(huán)境變換的適應(yīng)性就愈強(qiáng)。反之,遺傳多樣性貧乏的物種,通常在進(jìn)化上的適應(yīng)性就弱。也就是說(shuō)群體內(nèi)的遺傳變異反映了物中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 6 種的進(jìn)化潛力。 長(zhǎng)期以來(lái)人們?cè)缇椭赖厍蛏仙亩鄻有院统掷m(xù)性。動(dòng)植物分類(lèi)學(xué)上地理族(宗)、亞種的劃分;農(nóng)業(yè)上家養(yǎng)動(dòng)物和農(nóng)作物品種、品系或類(lèi)型的劃分也就說(shuō)明了這一點(diǎn)。只是以往的認(rèn)識(shí)多來(lái)自外表形態(tài)、地理分布、生態(tài)學(xué)以及生產(chǎn)性狀等方面的資料。動(dòng)植物的形態(tài)及表型是遺傳和環(huán)境相互作用的綜合結(jié)果。表型的多樣 性并不能完全真實(shí)地反映遺傳的多樣性,因此今天談動(dòng)植物的遺傳多樣性應(yīng)更多地關(guān)心遺傳信息或遺傳物質(zhì)載體 染色體數(shù)目、形態(tài)、行為即核型的多樣性,甚至基因本身,即 國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物遺傳多樣性研究的重要性和必要性 家養(yǎng)動(dòng)物不僅為當(dāng)今人類(lèi)生活提供了重要的動(dòng)物性蛋白質(zhì),而且在人類(lèi)社會(huì)發(fā)展過(guò)程中,在狩獵、運(yùn)輸?shù)榷喾矫娑计疬^(guò)重要的作用。家養(yǎng)動(dòng)物的多樣性是生物多樣性的重要組成部分,并在遺傳多樣性中具有特殊地位。 中國(guó)有著悠久的歷史和古老的文明,我們的祖先留給我們?cè)S多優(yōu)良的獨(dú)特地方品種。特別是西部地 區(qū),由于歷史上交通閉塞,少數(shù)民族社會(huì)經(jīng)濟(jì)和文化發(fā)展的緩慢,迄今還保留了不少耐粗放飼養(yǎng)管理、抗逆性強(qiáng)、可適應(yīng)社會(huì)多種需要的品種和類(lèi)型。據(jù) 20 世紀(jì) 80年代調(diào)查表明,我國(guó)傳統(tǒng)的家養(yǎng)動(dòng)物(畜禽)品種、品種群及其類(lèi)群共計(jì) 596個(gè),列入中國(guó)各畜禽品種志的品種 280 個(gè),包括地方品種 194 個(gè),培育品種 44個(gè),引入品種 42個(gè)。據(jù)近來(lái)有關(guān)報(bào)道,我國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物現(xiàn)有品種和類(lèi)群 1943 個(gè),其中馬 66個(gè),驢 22個(gè),牛 73個(gè),水牛 20個(gè),牦牛 5 個(gè),綿羊 79個(gè),山羊 48個(gè),豬 113 個(gè),雞 109個(gè),鴨 35個(gè),鵝 21 個(gè),火雞 3個(gè),兔 14個(gè)。截止 1989 年,我國(guó)先后從世界上 20多個(gè)國(guó)家(地區(qū))引進(jìn)了畜禽品種 120余個(gè),其中牛 29個(gè),綿羊 25個(gè),山羊(奶山羊、毛用山羊) 4個(gè),豬 11個(gè),家禽(不包括配套系)品種 39個(gè)(鄭丕留等, 1986維祺, 1996;陳幼春, 1998)。引入的良種家養(yǎng)動(dòng)物不僅豐富了中國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物品種資源,也對(duì)改良中國(guó)低產(chǎn)家養(yǎng)動(dòng)物品種起了積極的作用。中國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物的遺傳多樣性為遺傳育種提供了寶貴的遺傳資源,這不僅是中國(guó)而且也是世界動(dòng)物遺傳資源寶庫(kù)的重要組成部分,已經(jīng)能夠引起國(guó)際社會(huì)的濃厚興趣。但是隨著社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展和科學(xué)技術(shù)的進(jìn) 步,如冷凍精液和人工授精、胚胎分割、胚胎移植等育種技術(shù)的應(yīng)用,以及對(duì)畜禽經(jīng)濟(jì)性能的盲目追求,導(dǎo)致中國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物的遺傳多樣性已經(jīng)或正在發(fā)生深刻的變化。某些地方品種的群體數(shù)量急劇下降,甚至滅絕。 當(dāng)前國(guó)外畜種遺傳多樣性日趨縮小,畜種資源日趨貧乏、單調(diào)。中國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物的豐富遺傳多樣性及其特殊的遺傳基礎(chǔ)就更具有吸引力。中國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物正面臨特有的遺傳多樣性迅速縮小的危險(xiǎn),無(wú)論是從保護(hù)中國(guó)古老文明的遺產(chǎn)或是保護(hù)特有基因,還是隨著社會(huì)發(fā)展需要保存一些符合未來(lái)需求的基因角度,我國(guó)固有畜禽遺傳多樣性的保護(hù)都是一項(xiàng)緊迫的任務(wù)。許多學(xué) 者認(rèn)為,家養(yǎng)動(dòng)物遺傳多樣性的丟失比野生物種多樣性的丟失對(duì)人類(lèi)利益損害更大,因?yàn)榧倚螅ㄇ荩┦侨祟?lèi)主要的生產(chǎn)資料,是人類(lèi)長(zhǎng)期選擇的產(chǎn)物(馬月輝等, 1999;馮維祺, 1996)。品種是家禽(畜)多樣性的特殊形式。我國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物遺傳資源保護(hù)遠(yuǎn)沒(méi)有野生動(dòng)植物保護(hù)那樣受到重視。對(duì)家養(yǎng)動(dòng)物遺傳資源研究不夠,大多數(shù)畜種沒(méi)有進(jìn)行系統(tǒng)的起源、分類(lèi)、遺傳關(guān)系的研究,造成沒(méi)有足夠依據(jù)對(duì)家養(yǎng)動(dòng)物進(jìn)行保護(hù)和開(kāi)發(fā)。中國(guó)家養(yǎng)動(dòng)物品種間和品種內(nèi)的遺傳多樣性,特別是細(xì)胞和分子水平上的多樣性研究是一個(gè)薄弱的環(huán)節(jié)。因此,研究家養(yǎng)動(dòng)物的起源及遺傳多中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 7 樣 性,不僅是現(xiàn)代動(dòng)物遺傳育種和畜牧業(yè)的發(fā)展的基礎(chǔ),也是為了適應(yīng)未來(lái)人類(lèi)需求的變化培育相應(yīng)的品種做準(zhǔn)備。特別是隨著當(dāng)代生物技術(shù)的迅猛發(fā)展,基因轉(zhuǎn)移技術(shù)的日益成熟,這種研究更具現(xiàn)實(shí)意義。 傳多樣性研究的原理和方法 在研究家養(yǎng)動(dòng)物的遺傳多樣性時(shí),通常首先考慮種內(nèi)或種以下的分類(lèi)階元,即亞種間或亞種內(nèi)、群體間或群體內(nèi)豐富的遺傳變異。種內(nèi)的遺傳變異或遺傳多樣性即遺傳學(xué)中所說(shuō)的多態(tài)性,它包括外部形態(tài)(表型) 、 染色體水平、酶和蛋白質(zhì)以及核酸水平的多態(tài)等方面。遺傳多樣性的監(jiān)測(cè)方法也多種多樣,不同的技術(shù)、方法從不同 的角度、不同層次揭示了物種的遺傳背景信息。 從形態(tài)學(xué)或表型性狀上來(lái)檢測(cè)遺傳變異是最古老,最簡(jiǎn)便易行的方法。形態(tài)學(xué)水平的方法就是采用生物體的某些特定的,肉眼可見(jiàn)的或可度量的外部特征,如毛色、體尺、體重等形態(tài)或表型性狀來(lái)檢測(cè)的方法。通常利用的表型性狀主要有兩類(lèi):符合孟德?tīng)栠z傳規(guī)律的質(zhì)量性狀和多基因決定的數(shù)量性狀。通過(guò)種群間和種群內(nèi)體型外貌的比較研究可為探討物種起源和分類(lèi)提供有意義的提示和依據(jù)。這種遺傳多樣性可能是由于遺傳起源、生態(tài)環(huán)境、社會(huì)經(jīng)濟(jì)條件、選育方法的不同形成的。例如,我國(guó)綿羊尾型 有肥臀尾,短瘦尾,長(zhǎng)瘦尾,脂尾之分。在毛色的遺傳變異上 ,由于選育方法的不同 ,有黑、白、棕紅色三種毛色。畜禽品種體型外貌的這些多態(tài)性 ,在一定程度上反映了品種的形成歷史和選育程度。 蛋白水平上檢測(cè)遺傳多樣性主要包括檢測(cè)血型、蛋白質(zhì)、同工酶的基因座位的多態(tài)性。血液蛋白多態(tài)性是指功能相同的血液蛋白質(zhì)或酶存在兩種以上的遺傳變異 ,該變異可作為一個(gè)遺傳標(biāo)記因子來(lái)反映動(dòng)物個(gè)體的遺傳變異情況。同工酶是指具有同一底物專(zhuān)一性的不同形式的酶,其具有組織,發(fā)育以及物種的特異性。根據(jù)畜種的蛋白多態(tài)程度 ,可推測(cè)其遺 傳背景。蘭蓉等 對(duì)來(lái)自德欽縣、巧家縣、騰沖縣的綿羊進(jìn)行了 34 個(gè)同功酶及血液蛋白的研究, 表明云南不同地區(qū)綿羊在蛋白水平上遺傳多樣性較為豐富。 聚類(lèi)分析結(jié)果顯示 ,云南綿羊起源于同一共同祖先 ,與印度綿羊、尼泊爾綿羊關(guān)系較近 ,而與西藏綿羊關(guān)系較遠(yuǎn)。 細(xì)胞水平的遺傳變異產(chǎn)生于染色體的遺傳變異。染色體變異主要表現(xiàn)為染色體組型特征的變異 ,包括染色體數(shù)目變異 (整倍體、非整倍體 )和染色體結(jié)構(gòu)變異 (缺失、易位、倒位、重復(fù) )。蘭蓉等對(duì)云南昭通,德欽,騰沖綿羊染色體的核型, G 帶, C 帶, 結(jié)果反映出云南綿羊在進(jìn)化過(guò)程中有不同的分化。另外 ,染色體水平上的多樣性還體現(xiàn)在染色體的形態(tài)、縊痕和隨體等核型特征上。隨著染色體研究技術(shù)的發(fā)展 ,如細(xì)胞原位雜交技術(shù)的應(yīng)用 ,在染色體上將揭示出更加豐富的遺傳多樣性 ,這為研究中國(guó)畜禽的起源、演化和分類(lèi) ,以及開(kāi)展標(biāo)記輔助選擇提供了依據(jù)。 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 8 近二十年來(lái) ,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展 ,平上的多態(tài)性已為人們所熟知。 遺傳多樣性產(chǎn)生于 苷酸序列的差異,包括基因組編碼區(qū)或非編碼區(qū),保守區(qū)或高變區(qū),核 細(xì)胞質(zhì) 差異。畜禽品種在核 線(xiàn)粒體可呈現(xiàn)不同的多態(tài)性 ,對(duì)于了解畜禽的起源、遺傳分化和群體間的親緣關(guān)系以及合理利用和保護(hù)畜禽品種資源具有十分重要的意義。 第一代分子標(biāo)記 : 第一代分子標(biāo)記以電泳和分子雜交為核心,代表性的標(biāo)記有: 通常用 或非放射性物質(zhì) (如地高辛等 ) 標(biāo)記探針 ,與轉(zhuǎn)移于支持膜上的總基因組 限制性?xún)?nèi)切酶消化 )雜交 ,通過(guò)顯示限制性酶切片段的大小 ,來(lái)檢測(cè)不同遺傳位點(diǎn)等位變異 (多態(tài)性 )的一種技 術(shù)。用作 針 (即互補(bǔ) 用 模板通過(guò)反轉(zhuǎn)錄合成的 與基因組 探針兩種。 針的保守性較強(qiáng)是研究作物起源演化的較好探針。但是這類(lèi)探針檢測(cè)的多態(tài)性頻率較低 , 在育種上應(yīng)用可能會(huì)較少。 針是從總基因組 克隆出來(lái)的 , 這類(lèi)探針檢測(cè)的多態(tài)性頻率較高 ,但不同種屬特異性較強(qiáng)。 它可以區(qū)別純合基因型和雜合基因型 ,能夠提供單個(gè)位點(diǎn)上的較完整的資料。 遺傳 本質(zhì)是由單堿基的突變或結(jié)構(gòu)重排(插入、轉(zhuǎn)移、倒位等)引起的,它為符合孟德?tīng)栠z傳的共顯性標(biāo)記,結(jié)果穩(wěn)定可靠,重復(fù)性好 ,主要應(yīng)用于遺傳連鎖圖的繪制和目標(biāo)基因的標(biāo)記。但是由于 需要量較大 (5 10需要的儀器設(shè)備較多 , 技術(shù)也較為復(fù)雜 , 因而目前很難直接用于育種。為了解決這一問(wèn)題 , 1995)提出將 以便在育種上加以利用。 對(duì)核 行 析,探討物種的分類(lèi)、起源等雖有一些報(bào)道,但由于它的操作過(guò)程繁雜,因而限制了該技術(shù)的應(yīng) 用。由于動(dòng)物線(xiàn)粒體 子量小、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,為共價(jià)閉環(huán)雙鏈 直接酶切進(jìn)行 析,因此,目前 術(shù)的應(yīng)用較多是對(duì)線(xiàn)粒體 已有許多研究報(bào)道。 第二代分子標(biāo)記: 第二代分子標(biāo)記以電泳和 表性 的標(biāo)記有 。 微衛(wèi)星( 短串聯(lián)重復(fù) (稱(chēng)為 人類(lèi)及動(dòng)植物的基因組中廣泛存在的由 1 4 個(gè)堿基對(duì)組成的簡(jiǎn)單重復(fù)序列 ,如 (GA)n,(AC)n,(n(其 中 n 為重復(fù)次數(shù) )等。 具有 以下優(yōu)點(diǎn): ( 1) 作為一種高度多態(tài)性的分子標(biāo)記,微衛(wèi)星 泛存在:人和動(dòng)物( n, 植物( n 中, 具有豐度高、共顯性標(biāo)記、選擇中性的特點(diǎn); ( 2) 微衛(wèi)星采用單位點(diǎn)指紋技術(shù),檢測(cè)容易,重復(fù)性較好; ( 3) 微衛(wèi)星擴(kuò)大了取樣范圍,減輕了取樣工作的困難和對(duì)研究對(duì)象的影響; ( 4) 微衛(wèi)星的出現(xiàn)為種群生物學(xué)家們提供了空前豐富的遺傳信息資料,同時(shí)也促進(jìn)了相應(yīng)的統(tǒng)計(jì)分析方法的發(fā)展。 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 9 目前 記已被廣泛用于資源鑒定、連鎖圖繪制及目標(biāo)性狀基因的標(biāo)記等研究上。與記相比 ,測(cè)的 多態(tài)性頻率要高很多 。 用作探針外 ,還可通過(guò) 增基因組中所含的重復(fù)序列區(qū)域 ,因此它具有 法的優(yōu)點(diǎn)。但是要克隆足夠數(shù)量的 對(duì)其進(jìn)行測(cè)序和設(shè)計(jì)引物 ,沒(méi)有足夠的投資、人力和時(shí)間 ,是不可能實(shí)現(xiàn)的。 第三代分子標(biāo)記: G 998年建立的,它是由于基因組核苷酸的變異引起的 ,這種變異通??捎蓡蝹€(gè)堿基的轉(zhuǎn)換或顛換所引起。從理論上講 ,也可能是 3個(gè)或 4個(gè)等位多態(tài)性 (1998)。 種形式 ,其中 C/T(G/A)轉(zhuǎn)換最常見(jiàn) ,約占 2/3,其余 3種顛換為 C/A(G/T)、 C/G(G/C)和 T/A(A/T),發(fā)生幾率相似 (999)。根據(jù)其在基因組內(nèi)的位置可將 種 :基因編碼區(qū)的功能性突變 ,主要分布在基因編碼區(qū) ,稱(chēng)為 這類(lèi) 大概只有 1%的 遍布于全身的大量的堿基變異 (李艷杰等 ,2003)。根據(jù)其對(duì)生物的遺傳性狀的影響來(lái)看 ,種 :突變 堿基與未突變堿基的含義相同 ; 堿基序列的改變可使翻譯的蛋白質(zhì)改變 ,從而影響了蛋白質(zhì)的功能 ,這種改變常是導(dǎo)致生物性狀改變的直接原因 (杜瑋南等 ,2000; 003)。而非編碼區(qū)中出現(xiàn)在基因表達(dá)調(diào)控區(qū)的 能會(huì)影響基因的表達(dá)調(diào)控 因芯片技術(shù),同源雜交,限制性酶切法,直接測(cè)序法。 (1) 分布廣泛 ,密度高 在數(shù)量最多的一種遺傳多態(tài)性。 (2) 富有代表性 某些 接影響蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或表達(dá)水平 ,因此它們可能代表疾病遺傳機(jī)理中的某些作用因素。 (3) 遺傳穩(wěn)定性 尤其處于編碼區(qū)的 高度穩(wěn)定的 ; 因此在遺傳分析或基因診斷時(shí)的重現(xiàn)性、準(zhǔn)確性都優(yōu)于 (4) 通量檢出 ,易實(shí)現(xiàn)分析的自動(dòng)化。 由于具備上述優(yōu)點(diǎn) , 代限制性片段多態(tài)標(biāo)記、第 二 代微衛(wèi)星多態(tài)標(biāo)記之后的第 三 代基因作圖標(biāo)記 (楊昭慶等 ,2000)。 機(jī)保種理論 現(xiàn)有的隨機(jī) 保種理論是建立于群體遺傳學(xué)理論基礎(chǔ)上的,其目標(biāo)是長(zhǎng)時(shí)間的維持群體遺傳結(jié)構(gòu)的平衡,即使保種群始終維持 H 基 因頻率和基因型頻率代代不變,則保種工作有效。它最終目標(biāo)是原封不動(dòng)的保存品種所有的 基因而不使丟失。 群體遺傳學(xué)認(rèn)為影響群體基因頻率改變的主要因素有突變、選擇、遷移、遺傳漂變和近交。 隨機(jī)保種理論的中心即是控制群體近交系數(shù)的上升,盡量避免群體中的任何基因由于隨機(jī)漂 變而丟失。由于影響漂變和影響近交的效果基本相同,其關(guān)鍵是影響了群體的有效含量。據(jù)此 可采用中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 10 以下措施: (1)使保種畜群中公母數(shù)盡可能相等或保 持適當(dāng)?shù)墓副壤栽黾尤后w的有效含量,減少遺傳漂變的影響。 (2)盡可能避免保種群內(nèi)近交系數(shù)上升減慢基因的純合速度。 (3)建立專(zhuān)用的保種場(chǎng),實(shí)行隨機(jī)交配及家系等量留種,避免選擇,應(yīng)用現(xiàn)代技術(shù)延 長(zhǎng)世代間隔。 隨機(jī)保種理論的優(yōu)缺點(diǎn): (1)隨機(jī)保種理論目標(biāo)是在有限的群體中原封不動(dòng)地保存基因庫(kù)中的每個(gè)基因,根據(jù)前述的理論依據(jù)這是很難實(shí)現(xiàn)的。 (2)隨機(jī)保種理論為每一品種設(shè)立保種群使許多特性在品種間重復(fù)保存,浪費(fèi)人力財(cái)力。 (3)隨機(jī)保種最大的缺點(diǎn)是保種與選育之間矛盾突出,與我國(guó)地方品種的選育實(shí)踐在目的、方法等方 面都是不相容或背道而馳的。 (4)隨機(jī)保種理論使全部位點(diǎn)上的基因都能得到一定概率的保存,這對(duì)于滿(mǎn)足將來(lái)的育種工作似乎較為有利 。 統(tǒng)保種理論 盛志廉( 1989)認(rèn)為,隨機(jī)保種理論不適合中國(guó)國(guó)情,也不適合世界大多數(shù)國(guó)家的國(guó)情,從而提出了將保種工作視為一個(gè)整體系統(tǒng)工程的系統(tǒng)保種理論:以系統(tǒng)觀點(diǎn)為核心,已具有遺傳特性為目標(biāo),結(jié)合品種選育為主要手段。此后杜立新( 1992)、張志武( 1993)、芒來(lái)( 1993)、陳瑤生( 1995)等從不同角度對(duì)這個(gè)理論進(jìn)行了研究。 這個(gè)理論存在的主要問(wèn)題是: (1)在以畜禽保種 的條件下,沒(méi)有游離于具體品種的性狀; (2)不同品種的相同性狀不一定由同一基因型(或數(shù)量性狀基因群)控制,保護(hù)品種的省略可能導(dǎo)致有利基因的重大損失; (3)許多表型上難以看到的性狀,如抗病性狀可能被忽視; (4)小群體的近交速率仍無(wú)法控制; (5)遺傳力低的性狀,如繁殖性狀,無(wú)法選擇。 當(dāng)代畜禽遺傳資源保護(hù) ,從本質(zhì)上應(yīng)包括以下 3個(gè)部分 :保持各位 點(diǎn)的基因種類(lèi) ;保持基因組合體系 ;保持特定位點(diǎn)的基因純合態(tài)以及基因組合體系的穩(wěn)定性。 總之,無(wú)論哪種保種理論都要保持群體遺傳結(jié)構(gòu)的相對(duì)穩(wěn)定,保持基因頻率平衡 (杜立新,1992),否則將使群體結(jié)構(gòu)遭到破壞。 國(guó)綿羊起源的多樣性 綿羊( 是人類(lèi)早期馴化的動(dòng)物之一。系統(tǒng)分類(lèi)學(xué)上,綿羊?qū)儆谂继隳浚?、??疲ㄒ卜Q(chēng)洞角科, 山羊亞科( 、綿羊?qū)伲?表 分的體系為標(biāo)準(zhǔn)對(duì)綿羊?qū)賱?dòng)物的分類(lèi),中文名參照中國(guó)羊品種志。 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院碩士學(xué)位論文 第 一 章 緒論 11 1914)通過(guò)對(duì)中國(guó)內(nèi)蒙古地區(qū)脂尾綿羊與內(nèi)地綿羊顱骨的比較,認(rèn)為中國(guó)綿羊至少可分為兩種類(lèi)型,一種與 盤(pán)羊一致,一種與赤盤(pán)羊一致。張仲葛( 1953)、謝成俠( 1985)則認(rèn)為赤盤(pán)羊和盤(pán)羊及其若干亞種與中國(guó)現(xiàn)代家綿羊有血緣關(guān)系。馮維祺( 1991)根據(jù)中國(guó)考古發(fā)掘,從分布于內(nèi)蒙古地區(qū)的蒙古羊與分布于青藏地區(qū)的西藏羊彼此間在頭型、角型、體型外貌的不一致現(xiàn)象推斷中國(guó)綿羊的起源仍可追溯到赤盤(pán)羊與盤(pán)羊兩種類(lèi)型,同時(shí)指出中國(guó)不同地區(qū)的野生盤(pán)羊就是家綿羊的始祖。李志農(nóng)( 1993)明確指出中國(guó)家綿羊源于盤(pán)羊的蒙古亞種和西藏亞種。 我國(guó)地方綿羊品種在起源系統(tǒng)方面具有很大優(yōu)勢(shì),具體表現(xiàn)在以下兩個(gè)方面。我國(guó)地方綿羊品種在物種層次上 起源是多元的,眾多地方品種與目前幾乎遍布全球的歐美
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