信息及文獻(xiàn)的基本知識(shí)課件

1、醫(yī)學(xué)信息檢索與利用Medical Information Retrieval And Application 2005.2一、信息與信息類型 二、信息檢索技術(shù)及其發(fā)展 三、信息檢索的基本概念及原理 四、信息檢索的基本步驟 一、信息的基本概念信息知識(shí)文獻(xiàn)情報(bào)信息（information)廣義：信息是指事物存在方式及其運(yùn)動(dòng)規(guī)律、特點(diǎn)的外在表現(xiàn)形式，以及信息活動(dòng)中各種要素的總稱包括了信息本體、與信息有關(guān)的人員、設(shè)備、技術(shù)和資金等各種資源。狹義：信息是指文獻(xiàn)資源或數(shù)據(jù)資源，包括任何媒體中的片段、文章、圖書(shū)、情報(bào)、觀念等。文獻(xiàn)（literature）：記錄有知識(shí)的一切載體情報(bào)（information）：

2、解決特定問(wèn)題所需要的知識(shí)信息的主要類型1.按載體類型分： 傳統(tǒng)、電子文獻(xiàn)2.按出版類型分： 圖書(shū)、期刊、特種文獻(xiàn)3.按揭示內(nèi)容程度級(jí)別分： 一次文獻(xiàn) 二次文獻(xiàn) 三次文獻(xiàn) 零次文獻(xiàn)1.載體分類中的電子文獻(xiàn) 光盤(pán) (全世界近2000種數(shù)據(jù)庫(kù)，覆蓋所有學(xué)科） 網(wǎng)絡(luò)（近100種搜索引擎可搜索幾千萬(wàn)-上億網(wǎng)頁(yè)，基于internet檢索系統(tǒng)，各種文本、超媒體、虛擬平臺(tái)、網(wǎng)格） 以上兩種為主要存儲(chǔ)和傳輸文獻(xiàn)的載體電子文獻(xiàn)的文件類型 文本型: Txt，DOC ,PDF( Acrobat reader )超文本/超媒體型(hypertext/ multimedia): HTML, XHTML (eXtensib

3、le Hypertext Markup Language) JPG,流媒體視頻點(diǎn)播VOD網(wǎng)格： 21世紀(jì)出現(xiàn)的第三代因特網(wǎng)。即把整個(gè)因特網(wǎng)整合成一臺(tái)巨大的超級(jí)計(jì)算機(jī)，實(shí)現(xiàn)計(jì)算、存儲(chǔ)、數(shù)據(jù)、信息、知識(shí)、專家資源共享。 地區(qū)性、家庭性、個(gè)人網(wǎng)格。2.按學(xué)術(shù)信息資源發(fā)布的類型：圖書(shū)：是指一些記錄的知識(shí)比較系統(tǒng).成熟的文獻(xiàn)，比如教科書(shū).專著.工具書(shū)等。期刊：是指一些記錄的知識(shí)比較新穎.所含信息比較大的連續(xù)出版物，一般都有固定的期刊名稱。如：中國(guó)科學(xué)、中華醫(yī)學(xué)雜志等。特種文獻(xiàn)：無(wú)法歸入圖書(shū)或期刊的文獻(xiàn)，比如科技報(bào)告，學(xué)位論文，會(huì)議文獻(xiàn)、專利文獻(xiàn)等。一次信息源（原始學(xué)術(shù)信息）： 是指原始的創(chuàng)造，首次記錄科

4、研成果，新技術(shù)，新知識(shí)，新發(fā)明，新見(jiàn)解。 如期刊論文、學(xué)位論文、科研報(bào)告、專利文獻(xiàn)、會(huì)議文獻(xiàn)等。 一次文獻(xiàn)示例：前置部分正文參考文獻(xiàn)正文三次信息源在閱讀一次文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上，分析綜合歸納信息后，組織形成具有資料性、查考性、閱讀性的文獻(xiàn)（如教科書(shū)、綜述、工具書(shū)、進(jìn)展、調(diào)查報(bào)告等）綜述(Survey , Review)是指綜合分析和描述一定時(shí)間范圍內(nèi)，某一學(xué)科或?qū)I(yè)科研發(fā)展、現(xiàn)狀、并預(yù)測(cè)未來(lái)的一類文獻(xiàn)。綜述示例：內(nèi)容豐富、結(jié)構(gòu)靈活的綜述文獻(xiàn)現(xiàn)代三次文獻(xiàn)事實(shí)數(shù)據(jù)庫(kù)二、信息檢索技術(shù)及其發(fā)展 現(xiàn)代信息技術(shù)以計(jì)算機(jī)技術(shù)、通信技術(shù)和傳感技術(shù)為核心，進(jìn)行信息輸入、信息存貯、信息輸出、信息傳遞等。脫機(jī)檢索聯(lián)機(jī)檢索光

5、盤(pán)檢索網(wǎng)絡(luò)檢索計(jì)算機(jī)磁帶數(shù)據(jù)庫(kù)終端計(jì)算機(jī)磁盤(pán)、磁帶數(shù)據(jù)庫(kù)通訊系統(tǒng)（衛(wèi)星）光盤(pán)數(shù)據(jù)庫(kù)（單驅(qū)、塔網(wǎng)、鏡像）終端用戶網(wǎng)絡(luò)計(jì)算機(jī)（聯(lián)機(jī)、光盤(pán)多媒體、超媒體）數(shù)據(jù)庫(kù) 通訊系統(tǒng)終端終端終端（二）檢索技術(shù)的發(fā)展 巴伊贊.耶茨（Ricardo Baeza yates） 2004現(xiàn)代信息檢索書(shū)目Table of Contants: 4000年歷史 , 索引Index : 目前仍是現(xiàn)代信息系統(tǒng)的核心現(xiàn)代發(fā)布Modern Issue:引擎、全文檢索、多媒體、跨語(yǔ)種檢索等（采用的技術(shù) 包括 Scanning掃描 , optical character recognized光點(diǎn)識(shí)別等）。用戶輸入檢索需求分析轉(zhuǎn)換處理需求

6、數(shù)據(jù)庫(kù)概念詞典控制詞表信息源篩選錄入分類索引文檔預(yù)處理 信息檢索的基本原理概念詞相關(guān)匹配運(yùn)算數(shù)據(jù)庫(kù)及其結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)由計(jì)算機(jī)進(jìn)行處理的一定數(shù)量同類信息的有序集合，是用來(lái)存儲(chǔ)和查找文獻(xiàn)信息的電子化檢索工具。數(shù)據(jù)庫(kù)的種類書(shū)目數(shù)據(jù)庫(kù) (Bibliographic database)事實(shí)數(shù)據(jù)庫(kù) (Fact database)數(shù)值數(shù)據(jù)庫(kù) (Numeric database)全文數(shù)據(jù)庫(kù) (Full text database)超文本/超媒體系統(tǒng)（Hypertext/ Multimedia system)書(shū)目數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)文檔 順排文檔（記錄）倒排文檔（索引）記錄(Record)字段(Field)字段舉例TI:

7、New antibiotics miyakamides produced by a fungus.AU: Shiomi,-K; Hatae,-K; Yamaguchi,-Y; SO: J-Antibiot-(Tokyo). 2002 Nov; 55(11): 952-61IS: 0021-8820PY: 2002LA: EnglishAB: New antibiotics MESH: *Antibiotics-biosynthesis; *Aspergillus- flavus-metabolismPT: Journal-Article四、信息檢索步驟分析檢索課題，明確檢索要求選擇檢索工具，確

8、定檢索途徑確定檢索標(biāo)識(shí)，確定檢索運(yùn)算構(gòu)筑檢索提問(wèn)，獲取初步結(jié)果調(diào)整檢索策略，獲取所需信息1. 科研課題常見(jiàn)信息需求： 數(shù)據(jù)挖掘 發(fā)現(xiàn)知識(shí) 之類型查找某概念的確切含義：如“什么是端粒酶” 查找某概念的背景知識(shí)如：“誰(shuí)最先發(fā)現(xiàn)了傳染性蛋白”查找某些事物的數(shù)值及量化指標(biāo):如“2003-2004我國(guó)肺癌的發(fā)病率”如“阿司匹林的中毒劑量”查找某一類學(xué)科一般知識(shí)：如“有關(guān)分子生物學(xué)有哪些專著”查找學(xué)科專業(yè)領(lǐng)域的新進(jìn)展:“有關(guān)端粒酶與白血病相關(guān)性研究的綜述文獻(xiàn)”查找專業(yè)課題相關(guān)的研究文獻(xiàn)；“端粒酶在診斷白血病方面的價(jià)值評(píng)估”特征型知識(shí)（事實(shí)、數(shù)值類數(shù)據(jù)庫(kù)、搜索引擎）關(guān)聯(lián)型知識(shí)（文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)）2. 選擇檢索工具

9、：書(shū)目、文摘數(shù)據(jù)庫(kù)： 廣泛獲取檢索課題相關(guān)的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)概況 全文及網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)平臺(tái)：檢索重要研究論文或綜述學(xué)術(shù)全文 網(wǎng)絡(luò)檢索引擎、事實(shí)、數(shù)值數(shù)據(jù)庫(kù)：檢索具體數(shù)值、特征、事實(shí)信息（如名詞解釋、統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)等）或廣泛的信息概況 楓林校區(qū)數(shù)據(jù)庫(kù)查詢環(huán)境圖書(shū)館各閱覽室、院系教研室、宿舍有免費(fèi)查詢校園網(wǎng)大部分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)（全文、文摘、網(wǎng)絡(luò)、光盤(pán)）的計(jì)算機(jī)。4樓電子閱覽室有200臺(tái)計(jì)算機(jī)，其中14臺(tái)為免費(fèi)區(qū)，上機(jī)不收費(fèi)，但須辦證才能上機(jī)。校外代理服務(wù)器3.確定檢索途徑及檢索標(biāo)識(shí)分類檢索：分類名、分類號(hào)主題檢索：自由詞、規(guī)范詞著者檢索：姓名刊名：縮寫(xiě)引文：著者、關(guān)鍵詞機(jī)構(gòu)檢索：縮寫(xiě)與全稱分類檢索瀏覽學(xué)科、專業(yè)信息中圖法中國(guó)

10、圖書(shū)館分類法 Q 生物學(xué)R 醫(yī)藥衛(wèi)生 R1 預(yù)防醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生學(xué) R1 R6 外科學(xué)分類號(hào)分類名規(guī)范詞（規(guī)范主題詞subject headings)檢索 系統(tǒng)規(guī)范詞表控制的統(tǒng)一檢索用詞 文章A 著者用詞renal failure 規(guī)范詞：kidney failure 文章B著者用詞kidney failure規(guī)范詞：kidney failure詞表中：renal failure see kidney failure 自由詞檢索 任意詞檢索自由詞著者寫(xiě)文章時(shí)所用的自然詞語(yǔ), 在title, keyword, abstract,full text中檢索。無(wú)系統(tǒng)規(guī)范詞表情況下使用： (計(jì)算機(jī)，電腦，微機(jī)

11、）查最新的文獻(xiàn)時(shí)使用： （禽流感）一體化醫(yī)學(xué)語(yǔ)言系統(tǒng)（UMLS）Unified Medical Language System1.元敘詞表：提供95多個(gè)生物醫(yī)學(xué)辭典和分類法、詞表，210多萬(wàn)詞匯。2.語(yǔ)義網(wǎng)絡(luò)：提供語(yǔ)義分類、語(yǔ)義關(guān)系、語(yǔ)義結(jié)構(gòu)等。3.專家辭典：提供不同構(gòu)詞和句法信息應(yīng)用：PubMed, MWS，CliniWeb International機(jī)構(gòu)檢索 機(jī)構(gòu)檢索以機(jī)構(gòu)名稱為檢索詞，來(lái)查該機(jī)構(gòu)學(xué)者發(fā)表的文獻(xiàn)。常見(jiàn)字段名稱：address，address word，institution，organization?？麢z索刊名檢索檢索指定刊物上發(fā)表的文獻(xiàn)刊名全稱 New England

12、Journal of Medicine刊名縮寫(xiě) N Engl J Med引文檢索法引文回溯：是指通過(guò)文獻(xiàn)原文后附有的參考文獻(xiàn)（被引用文獻(xiàn)）來(lái)查找文獻(xiàn)的一種方法，它有助于研究課題的前期工作基礎(chǔ)、相關(guān)文獻(xiàn)，經(jīng)典著者，重要期刊等。引文檢索：是指通過(guò)被引用文獻(xiàn)，來(lái)檢索文獻(xiàn)的相互引證關(guān)系的情況，包括：某一著者的文獻(xiàn)被什么人、什么文章引用？引用的頻率？某些期刊被文獻(xiàn)引用的頻率？某些文獻(xiàn)的主題被引用的頻率等?！緟⒖嘉墨I(xiàn)】1.張嗣芳，汪晶瑩，柳秋云，等 干擾素2b 短療程治療98例腎綜合癥出血熱J 中華傳染病雜志，2000, 18: 572.楊為松，黃長(zhǎng)形. 腎綜合癥出血熱研究的現(xiàn)狀與未來(lái)J 中華傳染病雜志，

13、1996,14:1913.4.王耀宗，徐偉，李莉，等W 腎綜合癥出血熱抗病毒治療的實(shí)驗(yàn)研究JW 中華傳染病雜志，1994,12:69引文回溯例：馮智霖，徐邦強(qiáng). 干擾素-1b治療腎綜合癥出血熱的臨床療效. 中國(guó)臨床藥學(xué)雜志. 2003，12(1)：9-10參考文獻(xiàn)引文檢索從“被引用文獻(xiàn)”（cited paper）檢索到“引用文獻(xiàn)”(citing paper)例：1994年至2003年華羅庚教授的著作被別人引用的情況，并按相關(guān)度排序 最后一頁(yè)引文數(shù)據(jù)庫(kù)Web of science中國(guó)科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫(kù)全文數(shù)據(jù)庫(kù)、文摘數(shù)據(jù)庫(kù)中的引文（參考文獻(xiàn)）字段檢索 專業(yè)引文數(shù)據(jù)庫(kù)默認(rèn)檢索 默認(rèn)檢索又稱 缺省檢索、

14、隱含檢索，在檢索系統(tǒng)預(yù)先設(shè)定的多個(gè)字段中進(jìn)行檢索。 Medline默認(rèn)在標(biāo)題、著者、出處、文摘、主題詞等字段中檢索。 CBMDisc默認(rèn)在標(biāo)題、關(guān)鍵詞、主題詞、特征詞、出處、文摘字段中檢索。數(shù)據(jù)庫(kù)中的各種檢索方式分類瀏覽 Category browse簡(jiǎn)單檢索 Simple search, Basic search高級(jí)檢索 advancedDetailedFocus search 專家檢索 Expert search全文數(shù)據(jù)庫(kù)檢索方式界面例：確定檢索標(biāo)識(shí)課題：序列分析研究工具和方法的相關(guān)文獻(xiàn)檢索標(biāo)識(shí)： 序列分析（sequence analysis) 工具（instrument , tool)

15、方法（method, plan, technique, way)4.確定檢索運(yùn)算符 （operator）布爾算符： and，*（邏輯與） or， +（邏輯或） not，-（邏輯非）位置算符：有near, N, W, adj等形式字段限定符：常用的有 in . =截詞符：*，？布爾算符A B A and BB A or BA B A not B運(yùn)算次序：not and orA序列分析 and 方法工具 or 方法序列分析 not 綜述布爾算符應(yīng)用舉例 課題：序列分析的工具和方法 序列分析 and (工具 or 方法) sequence analysis and (instrument* or t

16、ool* or method*) 位置算符應(yīng)用舉例序列分析更具體的概念詞檢索：Sequence near3 analysisNear ：檢索詞出現(xiàn)在同一句子中，near3表示兩個(gè)檢索詞中間最多允許插2個(gè)詞。Sequence Amino Acid Analysis；Sequence Protein Analysis；Sequence DNA Analysis；Sequence Peptide Analysis；Sequence RNA Analysis；字段限定檢索舉例 hepatoma in ti標(biāo)題中檢索smith-b in au著者字段檢索anemia in ti,mesh標(biāo)題或MeSH字

17、段檢索nature in so檢索期刊Nature上的文章review in pt檢索綜述文獻(xiàn)綜述 in pt同上la=english檢索語(yǔ)種為英語(yǔ)的記錄 截詞符檢索舉例 用computer*可檢索到含有以下詞的記錄computerscomputeredcomputerizeComputerization Computer?能多檢索到computers的記錄5.構(gòu)筑檢索提問(wèn)（式）檢索式又稱檢索提問(wèn)式，是情報(bào)用戶向檢索系統(tǒng)表達(dá)文獻(xiàn)需求的句式。 簡(jiǎn)單檢索式含一個(gè)檢索詞復(fù)合檢索式含有布爾算符和至少兩個(gè)檢索詞檢索式舉例：課題1：人類序列分析的方法自由詞檢索：(Sequence near3 analys

18、is) in ti and (method* or tool* or instrument*) and human自由詞檢索限在ti 字段中，可提高提高檢索準(zhǔn)確度規(guī)范詞檢索：Explode sequence analysis / methods , instrumentation in mjme and human Explode 為規(guī)范詞檢索的系統(tǒng)擴(kuò)展指令，可檢索所有Sequence analysis的下位概念。mjme 為主要規(guī)范詞檢索指令。 methods , instrumentation為副主題詞副主題詞(subheading)：限定規(guī)范主題詞某一方面內(nèi)容的規(guī)范詞:MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)82個(gè)：如：診斷：diagnosis, radiography,治療: drug therapy, radiotherapy, surgery病因: etiology, pathology, chemically induced藥物作用： therapeutic use, adverse effects課題腎結(jié)石的手術(shù)治療（renal calculi or kidney calculi or