蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)預(yù)測(cè)詳解

蛋白質(zhì)修飾位點(diǎn)分析目錄TOC\o"1-4"\h\z\u實(shí)驗(yàn)?zāi)康?2實(shí)驗(yàn)平臺(tái) 3實(shí)驗(yàn)過程 4一、“人類connexin43”蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)修飾 41、“人類connexin43”蛋白質(zhì)序列下載 42、uniprot數(shù)據(jù)庫查看蛋白磷酸化位點(diǎn) 53、在線軟件預(yù)測(cè)指定蛋白磷酸化位點(diǎn) 6（1）DISPHOS1.3預(yù)測(cè)未知蛋白磷酸化位點(diǎn) 6（2）PhosphoSitePlus預(yù)測(cè)指定蛋白磷酸化位點(diǎn) 114、“人類connexin43”蛋白質(zhì)磷酸修飾結(jié)論 14二、“人類血紅蛋白”糖基化位點(diǎn)修飾 151、N型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè) 152、O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè) 18（1）哺乳動(dòng)物O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè) 18（2）真核生物O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè) 203、uniprot數(shù)據(jù)庫查看蛋白質(zhì)糖基化修飾位點(diǎn) 224、“人類血紅蛋白”糖基化位點(diǎn)修飾結(jié)論 22實(shí)驗(yàn)結(jié)論 23（特別提示:ctrl+單擊目錄下的標(biāo)題鏈接，能夠跟蹤標(biāo)題；ctrl+單擊標(biāo)題后的圖標(biāo)HYPERLINK\l"返回目錄"能夠返回目錄）實(shí)驗(yàn)?zāi)康恼页觥叭祟恈onnexin43”蛋白質(zhì)上面的全部可能磷酸化位點(diǎn)，并闡明為什么（注釋）找出“人類血紅蛋白”上面的糖基化位點(diǎn)，注釋成果實(shí)驗(yàn)平臺(tái)uniprot數(shù)據(jù)庫:(查看蛋白的修飾狀況)預(yù)測(cè)未知蛋白磷酸化位點(diǎn)DISPHOS:PhosphoSitePlus:預(yù)測(cè)未知蛋白的糖基化修飾位點(diǎn) N型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)：O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)：實(shí)驗(yàn)過程一、“人類connexin43”蛋白質(zhì)磷酸化位點(diǎn)修飾1、“人類connexin43”蛋白質(zhì)序列下載蛋白序列：fasta.txt2、uniprot數(shù)據(jù)庫查看蛋白磷酸化位點(diǎn)網(wǎng)站鏈接：3、在線軟件預(yù)測(cè)指定蛋白磷酸化位點(diǎn)（1）DISPHOS1.3預(yù)測(cè)未知蛋白磷酸化位點(diǎn)網(wǎng)站鏈接：開始預(yù)測(cè)成果DISPHOS由蛋白序列預(yù)測(cè)蛋白磷酸修飾位點(diǎn)，總共有37個(gè)絲氨酸修飾位點(diǎn)，13個(gè)蘇氨酸修飾位點(diǎn)，16個(gè)酪氨酸修飾位點(diǎn)。但是根據(jù)打分，只有8個(gè)絲氨酸修飾位點(diǎn)可能存在。（2）PhosphoSitePlus預(yù)測(cè)指定蛋白磷酸化位點(diǎn)網(wǎng)站鏈接：開始預(yù)測(cè)成果篩選參考文獻(xiàn)來源多于5篇的磷酸化修飾位點(diǎn)，丙氨酸磷酸化修飾位點(diǎn)數(shù)目為1、絲氨酸為17、蘇氨酸數(shù)目為1、酪氨酸數(shù)目為7。4、“人類connexin43”蛋白質(zhì)磷酸修飾結(jié)論在線數(shù)據(jù)庫查詢和在線軟件預(yù)測(cè)成果基本一致，“人類connexin43”蛋白質(zhì)磷酸位點(diǎn)數(shù)量相對(duì)普通蛋白質(zhì)較多，且絲氨酸磷酸修飾位點(diǎn)最多。“人類connexin43”蛋白質(zhì)極有可能是一種活性較高的蛋白質(zhì)，與機(jī)體的生物活性明顯有關(guān)。通過多個(gè)文獻(xiàn)閱讀和網(wǎng)絡(luò)篩選發(fā)現(xiàn)connexin43蛋白質(zhì)是一種哺乳動(dòng)物連接蛋白，是重要的細(xì)胞縫隙連接蛋白，其體現(xiàn)的異常與多個(gè)疾病的發(fā)生有關(guān)。二、“人類血紅蛋白”糖基化位點(diǎn)修飾Ncbi下載人類血紅蛋白的蛋白序列保存為：hemoglobin.txt1、N型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)網(wǎng)站鏈接：開始預(yù)測(cè)成果2、O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)（1）哺乳動(dòng)物O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)網(wǎng)站鏈接：開始預(yù)測(cè)成果（2）真核生物O型糖基化位點(diǎn)預(yù)測(cè)網(wǎng)站鏈接：開始預(yù)測(cè)成果3、uniprot數(shù)據(jù)庫查看蛋白質(zhì)糖基化修飾位點(diǎn)4、“人類血紅蛋白”糖基化位點(diǎn)修飾結(jié)論在線數(shù)據(jù)庫查詢和在線軟件預(yù)測(cè)成果基本一致，人類血紅蛋白基本沒有O型糖基化修飾位點(diǎn),但是存在N型糖基化修飾位點(diǎn)。血紅蛋白是高等生物體內(nèi)負(fù)責(zé)運(yùn)載氧的一種蛋白質(zhì)，糖基化修飾可能和血紅蛋白的信號(hào)傳導(dǎo)功效有關(guān)。實(shí)驗(yàn)結(jié)論