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文檔簡介
1、生物化學(xué) 復(fù)習(xí)大綱第一章 蛋白質(zhì)化學(xué)1.氨基酸的兩性解離和等電點。 等電點(pI):在某一pH環(huán)境中,氨基酸解離成陽性離子及陰性離子的趨勢相等,所帶凈電荷為零,在電場中不泳動。此時,氨基酸所處環(huán)境的pH值稱為該種氨基酸的等電點(pI)。 帶電狀態(tài)判定 pI-pH<0 .帶負(fù)電 pI-pH>0 .帶正電 pI-pH0 .不帶電2.氨基酸與蛋白質(zhì)的物理性質(zhì)和化學(xué)性質(zhì) 氨基酸: 1、物理性質(zhì):白色晶體、熔點很高(200度以上)、每種氨基酸都有特殊的結(jié)晶形狀、除胱氨酸和酪氨酸外,都能溶于水。 2、化學(xué)性質(zhì):茚三酮反應(yīng):氨基酸與印三酮水合物共熱??缮伤{紫色化合物,其最大吸收峰在570nm處
2、。(例外:Pro黃色;Asn棕色) 紫外吸收: Trp、Tyr和Phe在280nm波長附近具有最大吸收峰,其中Trp的最大吸收最接近280nm 成肽反應(yīng): 蛋白質(zhì):1、物理性質(zhì):等電點:當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時,蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點。兩性解離:蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團,在一定的溶液pH條件下都可解離成帶負(fù)電荷過正電荷的基團。2、化學(xué)性質(zhì):蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素:顆粒表面電荷、水化膜(溶劑化層)蛋白質(zhì)在溶液中維持穩(wěn)定的因素:表面電荷、水化層變性蛋白不一定沉淀,沉淀蛋白也不一定變性。紫外
3、吸收:最大吸收波長280nm3.蛋白質(zhì)二級和三級結(jié)構(gòu)的類型及特點,四級結(jié)構(gòu)的概念及亞基1、二級結(jié)構(gòu):穩(wěn)定力(氫鍵);類型(a螺旋,b折疊,b轉(zhuǎn)角,無規(guī)卷曲)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈骨架中原子的局部空間排列,不涉及側(cè)鏈的構(gòu)象,也就是該肽段主鏈骨架原子的相對空間位置,主要有-螺旋、-折疊、-轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲。維持二級結(jié)構(gòu)的力量為氫鍵。螺旋結(jié)構(gòu)特點:a、右手螺旋(蛋白質(zhì)中-螺旋幾乎都是右手的):3.6個AA/圈,螺距0.54nm;每個殘基繞軸旋轉(zhuǎn)100度,沿軸上升0.15mmb、氫鍵維系:鏈內(nèi)氫鍵(AA1AA4),平行長軸;c、側(cè)鏈伸出螺旋(殘基的側(cè)鏈伸向外側(cè))2、三級結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)的三級結(jié)構(gòu)是指在
4、一條多肽鏈中所有原子的整體空間排布,包括主鏈和側(cè)鏈。三級結(jié)構(gòu)的形成使得在序列中相隔較遠的氨基酸側(cè)鏈相互靠近。結(jié)構(gòu)特點:a、多數(shù)同時含有-螺旋和-折疊b、氨基酸位置由側(cè)鏈極性決定:非極性(內(nèi))、極性(表面,少數(shù)內(nèi)部)、帶電(表面)c、次級鍵維系:疏水鍵、鹽鍵、氫鍵、范德華力、二硫鍵d、功能區(qū):表面或特定部位3、四級結(jié)構(gòu):寡聚蛋白中亞基的立體排布及相互作用。 結(jié)構(gòu)特點:a、亞基之間以非共價鍵聯(lián)系,包括疏水鍵(主要)、鹽鍵、氫鍵、范德華力b、亞基可以相同或不同4.蛋白質(zhì)的變性作用蛋白質(zhì)的變性:在某些物理或化學(xué)因素作用下,使蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象破壞(但不包括肽鏈的斷裂等一級結(jié)構(gòu)的變化),導(dǎo)致蛋白質(zhì)若干理化
5、性質(zhì)(如溶解度、粘度、吸收光譜、電泳行為等)和生物學(xué)性質(zhì)(如催化活性、免疫學(xué)特性等)的改變,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)的變性。促使蛋白質(zhì)變性的物理因素有加熱、高壓、紫外線、X線和超聲波等;化學(xué)因素有強酸、強堿、重金屬鹽、沉淀生物堿的試劑、尿素等。 蛋白質(zhì)沉淀:改變?nèi)芤旱膒H達到蛋白質(zhì)的等電點使質(zhì)點的凈電荷為零,蛋白質(zhì)分子則聚集成大顆粒而沉淀。5.蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系一級結(jié)構(gòu)中的保守序列決定空間結(jié)構(gòu),一級結(jié)構(gòu)并非影響空間結(jié)構(gòu)的唯一因素。1、空間結(jié)構(gòu)體現(xiàn)生物特異性2、空間結(jié)構(gòu)體現(xiàn)生物活性3、空間結(jié)構(gòu)的靈活性,體現(xiàn)了生物活性的可調(diào)節(jié)特性4、空間構(gòu)象并非生物活性的唯一影響因素5、蛋白構(gòu)象疾?。哄e誤構(gòu)象相互聚
6、集,形成抗蛋白水解酶的淀粉樣纖維沉淀,產(chǎn)生毒性而致病。老年癡呆、瘋牛病別構(gòu)效應(yīng)(allosteric effect):蛋白質(zhì)分子的特定部位(調(diào)節(jié)部位)與小分子化合物(效應(yīng)物)結(jié)合后,引起空間構(gòu)象發(fā)生改變,從而促使生物學(xué)活性變化的現(xiàn)象稱為變構(gòu)效應(yīng)。包括正協(xié)同、負(fù)協(xié)同效應(yīng) 協(xié)同效應(yīng):P77重點:氨基酸的兩性解離,等電點的計算,氨基酸、蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與性質(zhì),1. 構(gòu)成蛋白質(zhì)的20種氨基酸的名稱(包括3字母名稱)?丙氨酸Ala 谷氨酸Glu 亮氨酸Leu 絲氨酸Ser精氨酸Arg 谷氨酰胺Gln 賴氨酸Lys 蘇氨酸Thr天冬氨酸Asp 甘氨酸Gly 甲硫氨酸Met 色氨酸Trp天冬酰胺Asn 組氨酸H
7、is 苯丙氨酸Phe 酪氨酸Tyr半胱氨酸Cys 異亮氨酸He 脯氨酸Pro 纈氨酸Val2. 20種氨基酸的分類?按R基化學(xué)結(jié)構(gòu)分為哪幾類?(脂肪族、芳香族、雜環(huán)族);按R基極性性質(zhì)分為哪幾類?每一類包括哪幾種氨基酸?p18(上面有)3氨基酸等電點?等電點的計算?(看書p22表2-3,一定要搞懂pI的計算) 特別是R基解離的氨基酸pI的計算(三種堿性氨基酸,兩種酸性氨基酸,還有半胱氨酸和酪氨酸)側(cè)鏈為非極性基團或雖為極性基團但不解離的氨基酸:pI=½(pK1+pK2) 酸性氨基酸(Glu、Asp)及Cys:pI=½(pK1+pKR)堿性氨基酸(賴、精、組):pI=
8、9;(pK2+pKR)4一級、二級、三級、四級結(jié)構(gòu)的概念?維持一級、二級、三級、四級結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵?(特別維持三級結(jié)構(gòu)的作用力包括哪些?仔細(xì)讀p57圖5-1)(上面的題目中已有答案)一級結(jié)構(gòu)由共價鍵連接。二級結(jié)構(gòu)和其他高級結(jié)構(gòu)主要由非共價力如:氫鍵、離子鍵、范德華力維系。一級結(jié)構(gòu)的連接鍵:肽鍵(主要)、二硫鍵二級結(jié)構(gòu):氫鍵 三級結(jié)構(gòu):氫鍵,疏水作用、范德華力、二硫鍵第二章 糖類化學(xué)1. 糖類的概念及功能概念:糖類是多羥基醛、多羥基酮或其衍生物,或水解時能產(chǎn)生這些化合物的多聚體。功能:1可作為生物體的結(jié)構(gòu)物質(zhì),如纖維素。 2可轉(zhuǎn)變?yōu)樯匦璧钠渌镔|(zhì),如脂類、蛋白質(zhì)等。 3是生物體主要的能量來源
9、。 4可作為細(xì)胞識別的信息分子。2. 重要的單糖、二糖、寡糖和多糖的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)單糖:葡萄糖C6H12O6+(CH3CO)2OC6H7O6(COCH3)5能與Fehling試劑(CuSO4、NaOH、酒石酸鉀鈉)反應(yīng),說明葡萄糖分子內(nèi)含有醛基 。但葡萄糖的醛基不能和NaHSO3反應(yīng),也不能和Schiff試劑(品紅-亞硫酸)反應(yīng),說明葡萄糖的醛基不如一般醛基活潑。性質(zhì):(1)由醛、酮基產(chǎn)生的化學(xué)性質(zhì):單糖的氧化(即單糖的還原性),單糖的還原形成糖脎 (2)由羥基(半縮醛羥基和醇性羥基)產(chǎn)生的性質(zhì):形成糖酯 形成糖苷:單糖半縮醛羥基與另一個分子(例如醇、糖、嘌呤或嘧啶)的羥基、胺基或巰基縮合形成的含
10、糖衍生物。 單糖脫水(無機酸的作用):單糖與強酸(如H2SO4,HCl)作用,單糖脫水生成糠醛或糠醛的衍生物蔗糖:物理性質(zhì):白色結(jié)晶,易溶于水,很甜。有旋光性,無變旋現(xiàn)象?;瘜W(xué)性質(zhì):無還原性,不能成脎。麥芽糖:麥芽糖是由2分子D-葡萄糖通過-1,4糖苷鍵連接而成。乳糖:乳糖由1分子D-半乳糖和1分子D-葡萄糖通過-1,4糖苷鍵連接而成。 多糖:1分子量一般很大,在幾萬以上。在水中不能形成真溶液,有的根本不溶于水,如纖維素。 2物理性質(zhì):有旋光性,但無變旋現(xiàn)象。無甜味。 3化學(xué)性質(zhì):無還原性,不能成脎。淀粉:直鏈淀粉:-1,4糖苷鍵 支鏈淀粉:-1,4糖苷鍵(主鏈),-1,6糖苷鍵(支鏈)支鏈淀
11、粉易溶于水,平均分子質(zhì)量較大,都有方向性(P101-102)糖原:結(jié)構(gòu)與支鏈淀粉相似,卻分支程度高纖維素:是葡萄糖通過-1,4糖苷鍵連接的線性同多糖。3. 糖的鑒定原理 重點:重要的單糖,二糖及其相關(guān)概念復(fù)習(xí)題:1、 葡萄糖的環(huán)式結(jié)構(gòu)、解釋變旋現(xiàn)象第三章 脂類、生物膜1.脂質(zhì)的分類、功能(1)單脂:脂: 必需脂肪酸共有三種,亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸 蠟(保護作用,常分布于皮膚、毛皮、羽毛、葉片、果實等表面以及許多昆蟲的外骨骼 (2) 復(fù)脂: 磷脂: 含磷酸的單脂衍生物 甘油醇磷脂膽堿的功能:1.乙酰膽堿是重要的神經(jīng)遞質(zhì),傳導(dǎo)神經(jīng)沖動。2.防止脂肪肝。 3.生物體內(nèi)的甲基供體。糖脂: 含糖的單
12、脂衍生物 功能:1.構(gòu)成細(xì)胞膜脂質(zhì)雙層 2.細(xì)胞膜表面糖脂具有受體的功能,如神經(jīng)節(jié)苷脂固醇:固醇是環(huán)戊烷多氫菲的衍生物功能:1.形成膽酸2.構(gòu)成細(xì)胞膜3.合成激素 脂蛋白:脂質(zhì)與蛋白質(zhì)以非共價鍵結(jié)合而成的復(fù)合物2.油脂和甘油磷脂的結(jié)構(gòu)與性質(zhì)甘油磷脂:主要是磷酸甘油二脂。甘油中第1,2位碳原子與脂肪酸酯基(主要是含16碳的軟脂酸和18碳的油酸)相連,第3位碳原子則與磷酸酯基相連。磷脂分子中含有親水性的磷酸酯基和親脂的脂肪酸鏈,是優(yōu)良的兩親性分子重點:脂類的結(jié)構(gòu)、性質(zhì)復(fù)習(xí)題1、 軟脂酸、硬脂酸、油酸 2、 飽和脂肪酸:軟脂酸:16碳1元酸;C15H31COOH硬脂酸:18碳1元酸;C17H35CO
13、OH不飽和脂肪酸:油酸:18碳1烯酸 18:1(9)CH3(CH2)7CH=CH(CH2)7COOH亞油酸:18碳2烯酸 18:2(9,12)CH3(CH2)4CH=CH-CH2-CH=CH(CH2)7COOH3、 必需脂肪酸? 凡是體內(nèi)不能合成,必須由飼糧供給,或能通過體內(nèi)特定先體物形成,對機體正常機能和健康具有重要保護作用的脂肪酸稱為必需脂肪酸(essential fatty acids,縮寫EFA)。因為人體可以合成最多一個不飽和鍵的脂肪酸,故必須脂肪酸含兩個或多個不飽和鍵。以往認(rèn)為必需脂肪酸共有三種,亞油酸、亞麻酸和花生四烯酸。但是現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究表明只有亞油酸、亞麻酸是必需脂肪酸,只要亞
14、油酸供給充足,人體可以利用亞油酸合成花生四烯酸。4磷脂的結(jié)構(gòu)特點、常見的甘油磷脂? 磷脂酰肌醇、磷脂酰膽堿、磷脂酰乙醇胺、磷脂酰絲氨酸4、 簡述流動鑲嵌模型?所有生物膜幾乎都是由蛋白質(zhì)和脂類兩大物質(zhì)組成。尚含有少量糖、金屬離子和水(15%-20%)流動鑲嵌模型:(1)膜的基質(zhì)或膜結(jié)構(gòu)的連續(xù)主體是極性的脂質(zhì)雙分子層(2) 脂肪酸在細(xì)胞的正常溫度下呈液體狀態(tài),因此脂質(zhì)雙分子層具有流動性(3) 外周蛋白的表面主要含有親水性R基,可通過靜電引力與帶電荷的雙分子層的極性頭鏈接(4) 雙分子層中的脂質(zhì)分子之間或蛋白質(zhì)組分與脂質(zhì)之間無共價結(jié)合(5) 膜蛋白可作橫向移動第四章 酶學(xué)1.酶的概念及酶的特點概念:
15、酶是一類由活細(xì)胞產(chǎn)生的,對其特異底物具有高效催化作用的蛋白質(zhì)(化學(xué)本質(zhì))。特點:只能進行熱力學(xué)上允許進行的反應(yīng);可以縮短化學(xué)反應(yīng)到達平衡的時間,而不改變反應(yīng)的平衡點;自身不參與反應(yīng);通過降低活化能加快化學(xué)反應(yīng)速度。2.酶活性調(diào)節(jié)的因素和酶的作用機制(1)酶活性調(diào)節(jié)的活性因素:必需基團:酶表現(xiàn)活性不可缺少的基團別構(gòu)調(diào)節(jié):酶分子中存在著一些可以與其他分子發(fā)生某種程度的結(jié)合的部位,從而引起酶分子空間構(gòu)象的變化,對酶起激活或抑制作用(2)酶的作用機制:化學(xué)反應(yīng)速率的依賴因素:分子間碰撞頻率;有效碰撞分子的百分?jǐn)?shù)。1、中間產(chǎn)物學(xué)說2、鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng)3、多元催化作用:酸堿催化,共價催化4、表面效應(yīng):疏
16、水“口袋”3.酶促反應(yīng)動力學(xué)以及酶活力的測定(1)酶促反應(yīng)動力學(xué):(2)酶活力(酶催化化學(xué)反應(yīng)的能力。)的測定:酶活性測定的主要指標(biāo):活力單位(特定條件下酶促反應(yīng)在單位時間內(nèi)生成一定量的產(chǎn)物或消耗一定數(shù)量的底物所需要的酶量。活力單位包括國際單位和Kat)國際單位:在特定條件下,每分鐘催化1mol底物轉(zhuǎn)化為產(chǎn)物所需要的酶量酶的比活力(specific activity)代表酶制劑的純度。比活力用每毫克蛋白所含的酶活力單位數(shù)表示。對于同一種酶來說,比活力愈大,表示酶的純度愈高。重點:米氏方程及Km的定義及意義,酶活測定復(fù)習(xí)題1、 酶的專一性p141專一性的假說(鎖與鑰匙學(xué)說、誘導(dǎo)契合學(xué)說)p141
17、2、 酶的活力單位?比活力?(一定要理解,會計算,p336)3、 酶純化過程中總活力、比活力、純化倍數(shù)、回收率的計算(一定要弄清楚,看書p142)4、 米氏常數(shù)的意義?(5點 p115)1、重要特征物理常數(shù),與酶濃度無關(guān)。不同的酶具有不同Km值2、物理意義:Km等于酶促反應(yīng)速度為最大反應(yīng)速度一半時的底物濃度。3、Km值只是在固定的底物,一定的溫度和pH條件下,一定的緩沖體系中測定的,不同條件下具有不同的Km值。4、Km值近似等于ES的解離常數(shù),可表示酶與底物之間的親和力:Km值大表示親和程度小,酶的催化活性低; Km值小表示親和程度大,酶的催化活性高5、從km可判斷酶的專一性和天然底物。 Km
18、最小的底物,通常就是該酶的最適底物,也就是天然底物。6、km還可以推斷某一代謝物在體內(nèi)可能的代謝途徑。7、從km的大小,可以知道正確測定酶活力時所需的底物濃度。在進行酶活力測定時,通常用4km的底物濃度即可。5、 什么是可逆抑制、不可逆抑制、競爭性抑制與非競爭性抑制的區(qū)別(p162)?激活劑的概念(p162)不可逆抑制:抑制劑與酶反應(yīng)中心的活性基團以共價形式結(jié)合,引起酶的永久性失活。如有機磷毒劑二異丙基氟磷酸酯。 可逆抑制:抑制劑與酶蛋白以非共價方式結(jié)合,引起酶活性暫時性喪失。抑制劑可以通過透析等方法被除去,并且能部分或全部恢復(fù)酶的活性。競爭性抑制; 某些抑制劑的化學(xué)結(jié)構(gòu)與底物相似,因而能與底
19、物竟?fàn)幣c酶活性中心結(jié)合。當(dāng)抑制劑與活性中心結(jié)合后,底物被排斥在反應(yīng)中心之外,其結(jié)果是酶促反應(yīng)被抑制了。競爭性抑制通常可以通過增大底物濃度,即提高底物的競爭能力來消除。 非競爭性抑制:酶可同時與底物及抑制劑結(jié)合,引起酶分子構(gòu)象變化,并導(dǎo)至酶活性下降。由于這類物質(zhì)并不是與底物競爭與活性中心的結(jié)合,所以稱為非競爭性抑制劑。6、 酶活性中心?7、 酶的別構(gòu)調(diào)控?激活劑: 凡能使酶由無活性變?yōu)橛谢钚曰蚴姑富钚栽黾拥奈镔|(zhì)。別構(gòu)酶: 酶分子通過活性中心以外的特異調(diào)節(jié)位點與小分子調(diào)節(jié)物(效應(yīng)物)結(jié)合后,酶分子的構(gòu)象改變,從而調(diào)節(jié)酶活性 別構(gòu)調(diào)節(jié): 一些代謝物可與某些酶分子活性中心外的某部分可逆地結(jié)合,使酶構(gòu)象
20、改變,從而改變酶的催化活性,此種調(diào)節(jié)方式稱變構(gòu)調(diào)節(jié)。8、 別構(gòu)酶的性質(zhì)9、 酶原的激活酶原的激活:由無活性的酶原轉(zhuǎn)變?yōu)橛谢钚缘拿傅倪^程。共價調(diào)節(jié):在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽鏈上的一些基團可與某種化學(xué)基團發(fā)生可逆的共價結(jié)合,從而改變酶的活性10、 同工酶的概念?同工酶(isoenzyme)是指催化相同的化學(xué)反應(yīng),而酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。第五章 維生素與輔酶1.水溶性維生素的主要生理功能和缺乏病1.VitB1和焦磷酸硫胺素(TPP):形成的輔酶:焦磷酸硫胺素(TPP)是酮酸脫羧酶的輔酶功能:催化-酮酸的脫羧反應(yīng)缺乏?。耗_氣病。缺乏時表現(xiàn)出多發(fā)性神經(jīng)炎、皮膚麻木
21、、心力衰竭、四肢無力、下肢水腫。 2、VitB2和黃素輔酶形成的輔基: FAD和FMN功能:在脫氫酶催化的氧化-還原反應(yīng)中,起著電子和質(zhì)子的傳遞體作用 FAD + 2H = FADH2 FMN + 2H = FMNH2缺乏病:缺乏時組織呼吸減弱,代謝強度降低。主要癥狀為口腔發(fā)炎,舌炎、角膜炎、皮炎等3.VitPP(VB5)(尼克酸和尼克煙酰胺)形成的輔酶:NAD+:煙酰胺腺嘌呤二核苷酸,輔酶INADP+:煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸,輔酶II多種氧化還原酶的輔酶 功能:作為脫氫酶的輔酶,在催化底物時通過氧化態(tài)與還原態(tài)的互變而傳遞氫 缺乏?。耗芫S持神經(jīng)組織的健康。缺乏時表現(xiàn)出神經(jīng)營養(yǎng)障礙,出現(xiàn)皮炎(
22、癩皮?。?。4、 泛酸和輔酶A(CoA-SH)形成的輔酶:與巰基乙胺、核苷酸形成輔酶A (CoA-SH)功能:傳遞?;?5. VitB6形成的輔酶:磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺功能:Aa轉(zhuǎn)氨酶、脫羧酶、消旋酶的輔酶。轉(zhuǎn)氨酶通過磷酸吡多醛和磷酸吡多胺的相互轉(zhuǎn)換,起轉(zhuǎn)移氨基的作用。2.脂溶性維生素的主要生理功能1.維生素A:維生素A1又稱為視黃醇,A2稱為脫氫視黃醇。主要功能是維持上皮組織的健康和正常視覺 2. 維生素D主要功能:調(diào)節(jié)鈣、磷代謝,可促使小腸吸收鈣,使血鈣濃度增加,也可促使小腸吸收磷,使血磷濃度升高。有助于血液凝固。降低神經(jīng)興奮的作用 3.維生素E主要功能:維持動物的生殖功能(抗動物不育癥)
23、。具有抗氧化作用(油脂中常用)4維生素K主要功能:促進肝臟合成凝血酶原。調(diào)節(jié)凝血因子、的合成。重點:B族維生素與輔酶的關(guān)系復(fù)習(xí)題1、 脂溶性維生素?水溶性維生素?2、 B族維生素與輔酶第六章 核酸化學(xué)1.核酸的組成與結(jié)構(gòu)(1)組成:主要元素組成: C、H、O、N、P(911%)。與蛋白質(zhì)比較,核酸一般不含S,而P的含量較為穩(wěn)定,占9-11%。 基本構(gòu)成單位:核苷酸(核苷酸的組成:含氮堿基、戊糖和磷酸。)嘌呤堿和嘧啶堿分子中都含有共軛雙鍵體系,在紫外區(qū)有吸收(260 nm左右)(2)結(jié)構(gòu):1.一級結(jié)構(gòu):一級結(jié)構(gòu)是指核酸分子中核苷酸的排列順序及連接方式。核苷酸的排列順序代表了遺傳信息。5端3端2.
24、二級結(jié)構(gòu):DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)螺旋橫截面的直徑約為2nm,每條鏈相鄰兩個堿基平面之間的距離為0.34 nm,每10個核苷酸形成一個螺旋,其螺矩(即螺旋旋轉(zhuǎn)一圈的高度)為3.4 nm。維持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力量:氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定,堿基堆積力維持螺旋縱向穩(wěn)定 3.DNA三級結(jié)構(gòu):雙螺旋進一步扭曲,形成一種比雙螺旋更高層次的空間構(gòu)象。2.核酸的理化性質(zhì)作用于磷酸二酯鍵和糖苷鍵;DNA/RNA對酸/堿的耐受程度有差別(一)堿基的解離2.核苷的解離:戊糖可增強堿基的酸性解離;核糖中的羥基也可發(fā)生解離3.核苷酸的解離:磷酸基使核苷酸具有很強的酸性(三)、核酸的紫外吸收:堿基含有共軛雙鍵。最大吸收峰260nm左右(
25、四)、核酸的變性、復(fù)性與雜交完全變性后核酸紫外吸收值增加。Tm:DNA變性時,OD260達到最大值的50%時的溫度稱為DNA的解鏈溫度或融解溫度(Tm)。大小與G+C含量成正比。3.核酸的研究方法 DNA聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR):變性退火延伸重點:核酸的變性、復(fù)性及分子雜交及核酸的序列測定復(fù)習(xí)題1、 DNA二級結(jié)構(gòu)(雙螺旋),結(jié)構(gòu)特點、維持力?DNA分子由兩條DNA單鏈組成。DNA的雙螺旋結(jié)構(gòu)是分子中兩條DNA單鏈之間基團相互識別和作用的結(jié)果。雙螺旋結(jié)構(gòu)是DNA二級結(jié)構(gòu)的最基本形式。維持結(jié)構(gòu)穩(wěn)定的力量:氫鍵維持雙鏈橫向穩(wěn)定,堿基堆積力維持螺旋縱向穩(wěn)定2、 核小體的結(jié)構(gòu)?p238圖14-14核小
26、體: 由DNA和組蛋白構(gòu)成3、 tRNA的二級結(jié)構(gòu)、三級結(jié)構(gòu)特點?以及tRNA的功能?p240tRNA的二級結(jié)構(gòu)三葉草形功能: DHU環(huán)(二氫尿嘧啶環(huán)):識別氨酰tRNA合成酶 反密碼環(huán):連接氨基酸 TC環(huán):識別核蛋白體tRNA的“倒L”型三級結(jié)構(gòu)4、 核酸的紫外吸收(p249)堿基含有共軛雙鍵,最大吸收峰260nm左右5、 核酸的變性、熔解溫度、影響Tm的因素?(p250-252);復(fù)性(p251)DNA的變性: 在某些理化因素作用下,DNA雙鏈解開成兩條單鏈的過程。Tm:DNA變性時,OD260達到最大值的50%時的溫度稱為DNA的解鏈溫度或融解溫度(Tm)。第二篇 新陳代謝1. EMP,
27、 TCA發(fā)生部位?關(guān)鍵調(diào)控點,調(diào)控酶?底物磷酸化的部位?產(chǎn)氫的部位?脫羧部位?EMP:(1)反應(yīng)部位:胞液(2)關(guān)鍵酶:己糖激酶,6-磷酸果糖激酶-1,丙酮酸激酶在糖酵解過程發(fā)生了兩次底物水平磷酸化反應(yīng),一次是1,3-二磷酸甘油酸生成3-磷酸甘油酸的反應(yīng),另外是磷酸烯醇式丙酮酸生成丙酮酸的反應(yīng)。TCA:(1)進行部位:線粒體 (2)關(guān)鍵酶:檸檬酸合酶,異檸檬酸脫氫酶,a-酮戊二酸脫氫酶復(fù)合體 三羧酸循環(huán)中只有一步底物水平磷酸化,就是琥珀酰CoA生成琥珀酸的反應(yīng)。2. 1mol的葡萄糖通過EMP, TCA徹底分解為和產(chǎn)生多少mol(計算)?(肝臟、心肌,蘋果酸穿梭機制,38mol;骨骼肌、神經(jīng)系
28、統(tǒng),磷酸甘油穿梭機制36mol)。3. 糖異生的關(guān)鍵步驟?丙酮酸生成草酰乙酸的反應(yīng)4. 糖原合成與分解的關(guān)鍵酶、步驟?合成過程:關(guān)鍵酶:糖原合酶。代謝過程:關(guān)鍵酶:糖原磷酸化酶。l 合成過程:l 分解過程:5. HMP途徑的生理意義?1) 磷酸戊糖途徑是體內(nèi)利用葡萄糖生成5-磷酸核糖的唯一途徑。為體內(nèi)核酸的合成提供了原料。2) NADPH的生成及其功用:磷酸戊糖途徑的另一主要生理意義是提供細(xì)胞合成代謝所需的NADPH。 NADPH的功用: j在脂肪酸及膽固醇等物質(zhì)的生物合成中提供氫,作為供氫體。 kNADPH作為谷胱甘肽還原酶的輔酶,對于維持細(xì)胞中還原型 谷胱甘肽(G-SH)的正常含量,從而對
29、維持細(xì)胞特別是紅細(xì)胞的完整性有重要作用。 lNADPH參與肝臟內(nèi)的生理轉(zhuǎn)化反應(yīng)。3) 通過磷酸戊糖途徑中的轉(zhuǎn)酮醇基及轉(zhuǎn)醛醇基反應(yīng),使丙糖,丁糖,戊糖,己糖,庚糖在體內(nèi)得以互相轉(zhuǎn)變。4)6. 丙酮酸脫氫酶系包括哪幾種? 丙酮酸脫氫酶(E1),二氫硫辛酰胺轉(zhuǎn)乙酰酶(E2),二氫硫辛酰胺脫氫酶(E3) 底物磷酸化?氧化磷酸化?P/O?l 底物水平磷酸化(substrate level phoaphorylation):高能化合物在進行反應(yīng)的過程中,將能量轉(zhuǎn)給ADP生成ATP。l 氧化磷酸化:代謝物氧化脫氫經(jīng)呼吸鏈傳遞給氧生成水的同時,伴有ADP磷酸化生成ATP的過程為氧化磷酸化,因氧化反應(yīng)與ADP的
30、磷酸化反應(yīng)偶聯(lián)發(fā)生,又稱偶聯(lián)磷酸化。 l P/O:物質(zhì)氧化時,每消耗1摩爾氧原子所消耗的無機磷的摩爾數(shù),即生成ATP的摩爾數(shù)。7. ATP的貯存: 磷酸肌酸是肌肉中能量的貯存形式8. 氧化磷酸化的解偶聯(lián)? 解偶聯(lián):有代謝物的氧化過程,不伴有ADP磷酸化的過程為氧化磷酸化的解偶聯(lián)。9. 軟脂酸氧化:活化: -2 ATP;7次氧化: 5 × 7 = 35 ATP8個乙酰CoA:12 × 8 = 96 ATPCH3-(CH2)14-COOH + 23O2 16CO2 + 16H2O + 2340 kcal/mol10. 氧化發(fā)生部位?肉堿?脫氫 加水(再)脫氫 硫解。部位:線粒體
31、 肉堿:羥三甲基氨基丁酸carnitine 11. 酮體?生成過程?生理意義?限速酶 酮體:乙酰乙酸,羥丁酸 ,丙酮 生理意義:能源物質(zhì):肝外組織,大腦、肌肉14.軟脂酸的合成:限速酶: 乙酰CoA羧化酶; 16.聯(lián)合脫氨基作用的過程和意義(轉(zhuǎn)氨基,L谷氨酸氧化脫氨基作用)?尿素合成的部位和全過程?(鳥氨酸循環(huán)) 尿素合成部位:肝臟 細(xì)胞溶膠17.氨在血液中的運輸形式:丙氨酸和谷氨酰胺1) 丙氨酸-葡萄糖循環(huán):使肌肉的氨以無毒的丙氨酸形式運輸?shù)礁?) 谷氨酰胺:氨的解毒產(chǎn)物,氨的貯存和運輸形式18.嘌呤核苷酸的從頭合成?v 活性磷酸核糖形式:磷酸核糖焦磷酸(PRPP)v 兩個階段:
32、首先合成IMP,再由IMP轉(zhuǎn)變成AMP與GMPv 嘌呤核苷酸是在一磷酸水平上合成的v 在合成嘌呤核苷酸的過程中逐步合成嘌呤環(huán)v 調(diào)節(jié)酶:磷酸核糖焦磷酸激酶、磷酸核糖酰氨基轉(zhuǎn)移酶 脫氧(還原)過程發(fā)生在二磷酸水平19. 嘌呤核苷酸的分解代謝Ø 最終產(chǎn)物:尿酸 Ø 關(guān)鍵酶:黃嘌呤氧化酶Ø 代謝抑制劑別嘌呤醇 痛風(fēng) Ø 痛風(fēng)的機理:尿酸生成過量或尿酸排出過少。如:次黃嘌呤-鳥嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶(HGPRT)不完全缺乏促使嘌呤核苷酸過度生成 Ø 別嘌呤醇治療痛風(fēng)的機理:次黃嘌呤類似物,競爭性抑制黃嘌呤氧化酶;或轉(zhuǎn)變?yōu)閯e嘌呤醇核苷酸,抑制嘌呤
33、核苷酸從頭合成 20. 嘧啶核苷酸的分解代謝 Ø 最終產(chǎn)物:氨基酸、CO2、NH3 Ø U、C -Ala、CO2、NH3 Ø T -氨基丁酸、CO2、NH3 第三篇 遺傳信息1. 中心法則? 生物的遺傳信息以密碼的形式儲存在DNA分子上,表現(xiàn)為特定的核苷酸排列順序。在細(xì)胞分裂的過程中,通過DNA復(fù)制把親代細(xì)胞所含的遺傳信息忠實地傳遞給兩個子代細(xì)胞。在子代細(xì)胞的生長發(fā)育過程中,這些遺傳信息通過轉(zhuǎn)錄傳遞給RNA,再由RNA通過翻譯轉(zhuǎn)變成相應(yīng)的蛋白質(zhì)多肽鏈上的氨基酸排列順序,由蛋白質(zhì)執(zhí)行各種各樣的生物學(xué)功能,使后代表現(xiàn)出與親代相似的遺傳特征。后來人們又發(fā)現(xiàn),在宿主細(xì)胞中
34、一些RNA病毒能以自己的RNA為模板復(fù)制出新的病毒RNA,還有一些RNA病毒能以其RNA為模板合成DNA,稱為逆轉(zhuǎn)錄這是中心法則的補充。2. 半保留復(fù)制的特點? DNA在復(fù)制時,兩條鏈解開分別作為模板,在DNA聚合酶的催化下按堿基互補的原則合成兩條與模板鏈互補的新鏈,以組成新的DNA分子。這樣新形成的兩個DNA分子與親代DNA分子的堿基順序完全一樣。由于子代DNA分子中一條鏈來自親代,另一條鏈?zhǔn)切潞铣傻模@種復(fù)制方式稱為半保留復(fù)制。3. 大腸桿菌三種DNA聚合酶(DNA聚合酶,復(fù)制) 4. 前導(dǎo)鏈,隨后鏈?DNA復(fù)制時,以35走向為模板的一條鏈合成方向為53,與復(fù)制叉方向一致,稱為前導(dǎo)鏈;另一
35、條以53走向為模板鏈的合成鏈走向與復(fù)制叉移動的方向相反,稱為滯后鏈,其合成是不連續(xù)的,先形成許多不連續(xù)的片斷(岡崎片斷),最后連成一條完整的DNA鏈。5. 真核RNA聚合酶() RNA聚合酶:轉(zhuǎn)錄所有mRNA前體和大多數(shù)核內(nèi)小RNA(snRNA)6. 啟動子?終止子?終止因子?l 啟動子( promoter)是指RNA聚合酶識別、結(jié)合和開始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。l 終止子:提供轉(zhuǎn)錄停止信號的DNA序列稱為終止子( termter)。l 終止因子:協(xié)助RNA聚合酶識別終止信號的輔助因子(蛋白質(zhì))則稱為終止因子 (termination factor)。7. 內(nèi)含子?外顯子? 大多數(shù)的真核基因都是
36、斷裂基因,斷裂基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物產(chǎn)物需要通過拼接,去除插入部分(即內(nèi)含子,intron),使編碼區(qū)(即外顯子,Exon)成為連續(xù)序列8. 原核蛋白質(zhì)生物合成過程?過程: 1. 氨基酸的活化與搬運:氨基酸的活化以及活化氨基酸與tRNA的結(jié)合,均由氨基酰tRNA合成酶催化完成。反應(yīng)完成后,形成氨基酰tRNA。2. 活化氨基酸的縮合核蛋白體循環(huán):活化氨基酸在核蛋白體上反復(fù)翻譯mRNA上的密碼并縮合生成多肽鏈的循環(huán)反應(yīng)過程,稱為核蛋白體循環(huán)。核蛋白體循環(huán)過程可分為三個階段: 1) 起動階段:30S起動復(fù)合物的形成。在IF促進下,30S小亞基與mRNA的起動部位,起動tRNA(tRNAfmet),和GTP結(jié)
37、合,形成復(fù)合體。70S起動前復(fù)合體的形成。IF3從30S起動復(fù)合體上脫落,50S大亞基與復(fù)合體結(jié)合,形成70S起動前復(fù)合體。70S起動復(fù)合體的形成。GTP被水解,IF1和IF2從復(fù)合物上脫落。 2) 肽鏈延長階段:進位:與mRNA下一個密碼相對應(yīng)的氨基酰tRNA進入核蛋白體的受位。此步驟需GTP,Mg2+,和EF參與。成肽:在轉(zhuǎn)肽酶的催化下,將給位上的tRNA所攜帶的甲酰蛋氨?;螂孽;D(zhuǎn)移到受位上的氨基酰tRNA上,與其-氨基縮合形成肽鍵。給位上已失去蛋氨?;螂孽;膖RNA從核蛋白上脫落。移位:核蛋白體向mRNA的3'- 端滑動相當(dāng)于一個密碼的距離,同時使肽?;鵷RNA從受體移到
38、給位。此步驟需EF(EFG)、GTP和Mg2+參與。 此時,核蛋白體的受位留空,與下一個密碼相對應(yīng)的氨基酰tRNA即可再進入,重復(fù)以上循環(huán)過程,使多肽鏈不斷延長 3) 肽鏈終止階段:核蛋白體沿mRNA鏈滑動,不斷使多肽鏈延長,直到終止信號進入受位。識別:RF識別終止密碼,進入核蛋白體的受位。水解:RF使轉(zhuǎn)肽酶變?yōu)樗饷?,多肽鏈與tRNA之間的酯鍵被水解,多肽鏈釋放。解離:通過水解GTP,使核蛋白體與mRNA分離,tRNA、RF脫落,核蛋白體解離為大、小亞基。 真核、原核的區(qū)別:a) 真核細(xì)胞核糖體比原核細(xì)胞核糖體更大更復(fù)雜;b) 起始氨基酸為Met,不是fMet;c) 肽鏈合成的起始:由40S核糖體亞基首 先識別mRNA的5端-帽子,然后沿mRNA移動尋找AUG;d) 起始因子有12種,但只有2種延長因子和1種終止因子;e) 真核細(xì)胞種線粒體、葉綠體的核糖體大小、組成及蛋白質(zhì)合成過程都類似于原核細(xì)胞。9. 順式作用元件?反式作用因子? 順式作用元件(cis-acting element):可影響自身基因表達活性的DNA序列。包括啟動子、增強子及沉默子等 反式作用因子(trans-acting factor):某一基因的編碼產(chǎn)物,與其它基因的調(diào)節(jié)序列結(jié)合,調(diào)節(jié)其它基因的表達活性。大多數(shù)反式作用因子是DNA結(jié)合蛋白10. SD序列?真核mRNA能在原核中正常翻譯嗎? SD序列
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