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文檔簡介
生物化學(xué)實驗報告論文班級:質(zhì)量121學(xué)號:200XXXX4119姓名:張XX
一、前言生物化學(xué)是一門聯(lián)系生物和化學(xué)的一門科學(xué)學(xué)科,學(xué)習(xí)生物化學(xué)可以提高我們嚴(yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)分析以及熟練的實驗操作,本文主要講了金黃色葡萄球菌核糖核酸酶的分離實驗,金黃色葡萄球菌是人類的一種重要病原菌,屬于葡萄球菌屬,可引起許多嚴(yán)重污染,本文主要通過核酸酶活性的測定,考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)溶液濃度,DEAE-纖維素的處理及裝柱,蛋白質(zhì)亞基分子量測定SDS凝膠電泳
二、實驗材料準(zhǔn)備共分為四組,了解實驗?zāi)康?、方案、原理?/p>
2.1、取已配制好的金黃色葡萄球菌于離心管內(nèi),8000rpm離心除掉菌體,保留上清(留1-2ml,p1),用作后續(xù)實驗。
2.2、將錐形瓶中的金黃色葡萄球菌液體放到沸水中煮30分鐘,10000rpm離心,保留上清液(留1-2ml,p2),用作后續(xù)實驗。
2.3、將離心好的上清液取60ml進(jìn)行75%硫酸銨飽和度沉淀實驗,放置離心管,配平后4度冰箱中放置24小時。將硫酸銨沉淀液10000rpm離心,去上清,保留沉淀,緩沖液洗滌,方法是在第一支離心管中加入2ml緩沖液混勻倒入第二支離心管中,再取2ml于第一支離心管中洗一次,再倒入第二支離心管中,最后在第二支離心管中再加入2ml緩沖液。終體積為6ml(留.5ml,p3)。
2.4、DEAE-纖維素的處理及裝柱
2.4.1、處理本實驗采用的是DEAE-纖維素DE52是弱酸型陰離子交換劑,具體處理方法為:先將DE52陰離子交換劑干粉浸泡于蒸餾水中,去除雜質(zhì);再在.5N的Hcl溶液中浸泡1h,再用無離子水或蒸餾水洗至pH4以上,并將其在抽濾中抽干;將抽干的離子交換劑浸在.5N的NaOH溶液中1h,再用無離子水或蒸餾水將其洗至中性。
2.4.2、裝柱將層析柱清洗干凈垂直固定到層析架上,加體積的無離子水,打開下出液口,水流暢通,即刻將小燒杯中裝有適宜濃度的柱才,輕輕倒入層析柱中,凝膠自然慢慢沉降在層析柱底部;凝膠沉積至高度10cm處,停止裝柱;夾上止液夾。
2.4.3、平衡在柱層析上樣前必須對層析柱進(jìn)行平衡,將平衡緩沖液泵入到層析柱內(nèi),打開層析柱下端的出口,當(dāng)下出口流出液的PH值與平衡緩沖液的PH值一致時(大于50ml平衡液),層析柱達(dá)到了平衡。在本實驗中,用.001MTrs-HCl緩沖液PH
9.0(內(nèi)含.0001MEDTA),預(yù)先將DE-52柱進(jìn)行平衡。
2.5、上樣平衡液50ml用于收集,收集30-40ml即可。然后裝入透析袋,PEG2包埋,濃縮。收集濃縮液p4-_;
2.6、透析袋預(yù)處理新的透析袋在沸水中煮沸10mn.即可進(jìn)行透析。
三、核酸酶活性的測定將甲苯胺藍(lán)核酸瓊脂溶化后,倒入平板中,凝固后,用直徑為2mm的打孔器打孔,將瓊脂取出,將待檢酶液10ul,滴入孔中,置于加有濕棉紗的濕盒內(nèi),在37培養(yǎng)4h,陽性反應(yīng)在孔的周圍會出現(xiàn)1mm以上的粉紅圈,測量粉紅圈的直徑。
四、考馬XX藍(lán)法測定蛋白質(zhì)濃度
4.1、實驗原理考馬XX藍(lán)能與蛋白質(zhì)的疏水微區(qū)相結(jié)合,這種結(jié)合具有高度敏感性??捡R斯亮藍(lán)G250的磷酸溶液呈棕紅色,最大吸收峰在465nm。當(dāng)它與蛋白質(zhì)結(jié)合形成復(fù)合物時呈藍(lán)色,其最大吸收峰改變?yōu)?95nm,考馬斯亮G250-蛋白質(zhì)復(fù)合物的高消光效應(yīng)導(dǎo)致了蛋白質(zhì)定量測定的高度敏感度。在一定范圍內(nèi),考馬斯亮藍(lán)G250-蛋白質(zhì)復(fù)合物呈色后,在595nm下,吸光度與蛋白質(zhì)含量呈線性關(guān)系,故可用于蛋白質(zhì)濃度的測定。
4.2、實驗儀器及用品實驗試劑:(1)水;
(2)標(biāo)準(zhǔn)蛋白液:牛血清蛋白(.1ml);
(3)染液:考馬斯亮藍(lán)G250(.01%),稱取.1g考馬斯亮藍(lán)G250溶于50ml95%乙醇,再加入100ml濃磷酸,加蒸餾水定容到1000ml;
(4)樣品液:取牛血清白蛋白(.1ml)溶液,用.9%NaCL稀釋至一定濃度。
4.3、實驗內(nèi)容及步驟
4.
3.1、標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
4.
3.2、取7支干凈試管,按下表進(jìn)行編號并加入試劑試劑1234567標(biāo)準(zhǔn)蛋白液(ml)0.
1.
204.6.8.8樣液S水(ml)
1.0.9.8.6.4.
202考馬斯亮藍(lán)染液(ml)
4.0
4.0
4.0
4.0
4.0
4.0
4.0蛋白質(zhì)濃度(ml)010XXXX6080未知AXXX.106.214.350.46
3.29
9.4
3.3、數(shù)據(jù)記錄及處理根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)溶液的吸光度,在坐標(biāo)紙上繪制出濃度-吸光度曲線,測出未知液的吸光度后,在標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出未知液的濃度。
五、蛋白質(zhì)亞基分子量測定SDS凝膠電泳
5.1目的掌握SDS凝膠電泳測定蛋白質(zhì)亞基分子量的基本原理和操作方法
5.2、原理SDS是一種陰離子去污劑,作為變性劑和助溶性試劑,能斷裂分子內(nèi)和分子間的氫鍵,使分子去折疊,破壞蛋白質(zhì)分子的二級,三級結(jié)構(gòu);而強還原劑,如二硫蘇糖醇,-巰基乙醇能使半胱氨酸殘基之間的二硫鍵斷裂。因此,在樣品和凝膠中加入SDS和還原劑后,蛋白質(zhì)分子被解聚為組成它們的多肽鏈,解聚后的氨基酸側(cè)鏈與SDS結(jié)合后,形成帶負(fù)電的蛋白質(zhì)-SDS膠束,所帶電荷遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過了蛋白質(zhì)原有的電荷量,消除了不同分子間的電荷差異;同時,蛋白質(zhì)-SDS聚合體的形狀也基本相同,這就消除了在電泳過程中分子形狀對遷移率的影響。
5.3、試劑和器材試劑:1低分子量標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)2待測蛋白質(zhì)樣品3凝膠貯液:30克丙烯酰胺,.8克甲叉雙丙烯酰胺,溶于100ml蒸餾水中,過濾,于4暗處儲藏,一個月內(nèi)使用4:1moll,ph
8.8trs-HCl緩沖液,trs
1.21g溶于蒸餾水,用濃鹽酸調(diào)至PH
8.8,以蒸餾水定容至100ml5:10%(wv)SDS6:10%(wv)過硫酸銨溶液(當(dāng)天配)7:四甲基乙二胺(TEMED)8:電極緩沖液PH
8.3:Trs
3.3g,甘氨酸14.42g,SDS10g,溶于蒸餾水并定容至1000ml,使用時稀釋十倍9:樣品稀釋液:SDS500mg,巰基乙醇1ml,甘油3ml,溴酚藍(lán)4mg,1mollTrs-HCL(pH
6.8),用蒸餾水溶解并定容至10ml,按每份1ml分裝,可在4存放數(shù)周,或在-20數(shù)月。以此液制備樣品時,樣品若為液體,則加入與陽平等體積的原液混合即可。10固定液:500ml乙醇,100ml冰醋酸,用蒸餾水定容至1000ml11脫色液:250ml乙醇,80ml冰醋酸,用蒸餾水定容至1000ml12染色液:.29g考馬斯亮藍(lán)R-250溶解在250ml脫色液中器材:微量進(jìn)樣針,電泳儀,電泳槽
5.4操作步驟
5.
4.1分離膠制備:凝膠濃度
1.25%,凝膠貯液
1.25ml,Trs-HCLPH
8.81molL
1.12ml,水
8.7ml,10%SDS.3ml,10%過硫酸胺.1ml,TEMED20上述膠液配好,混勻后,迅速加入兩塊玻璃板間隙中,使膠液面與矮玻璃和高玻璃之間形成凹槽處處平齊,而后插入“加樣梳”,在室溫下放置1小時左右,分離膠即可完全凝集。凝聚后,慢慢取出“加樣梳”,取出時應(yīng)防止把加樣孔弄破,取出“加樣梳”后,在形成的加樣孔中加入蒸餾水,沖洗未凝集的丙烯酰胺,倒出加樣孔中的蒸餾水后,在加入已稀釋的電極緩沖液。
5.
4.2樣品制備:標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)制備,待測蛋白樣品制備:液體待測樣品,可取500L,加入等體積的“2樣品稀釋液”,混勻,在沸水浴中加熱5mn,取出,冷卻至室溫備用。若液體待測樣品蛋白質(zhì)濃度太稀可經(jīng)濃縮后再制備。
5.
4.3,點樣用微量進(jìn)樣針吸取上述蛋白質(zhì)樣品20別加入到各個加樣孔中,為了獲得準(zhǔn)確的結(jié)果,每個樣品應(yīng)做兩次重復(fù)。
5.
4.4,電泳將電泳槽與電泳儀連結(jié),在電泳槽中加入已經(jīng)稀釋的電極緩沖液,打開電源,選擇合適電壓,保持恒電壓300v,進(jìn)行電泳,直至樣品中燃料遷移至離下端1cm處,停止。
5.
4.5,固定,染色,脫色將凝膠浸入考馬斯亮藍(lán)染色液中,置搖床上緩慢震蕩30mn以上(染色時間需要根據(jù)凝膠厚度適當(dāng)調(diào)整)。取出凝膠在水中漂洗數(shù)次,再加入考馬斯亮藍(lán)脫色液,震蕩。凝膠脫色至大致看清條帶約需1h,完全脫色則需要更換脫色液2-3次,震蕩達(dá)24h以上。凝膠脫色后可經(jīng)過掃描、攝錄等方法進(jìn)行蛋白質(zhì)定量檢測。
六、結(jié)果分析及討論
6.1、核酸酶活性的測定的結(jié)果分析P1:粉紅圈內(nèi)直徑
6.4mm,外直徑
1.96mmP2:粉紅圈內(nèi)直徑
6.6mm,外直徑
1.98mmp3:粉紅圈內(nèi)直徑
6.8mm,外直徑
2000mmp4:粉紅圈內(nèi)直徑
7.0mm,外直徑
2.200mm
6.2、考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)濃度的結(jié)果分析試劑XXX標(biāo)準(zhǔn)蛋白液(ml)0.
1.
204.6.8.8樣液蛋白質(zhì)濃度(ml)010XXXX6080未知A595.075.106.214.350.46
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