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文檔簡介
第5章1051基因表達(dá)的調(diào)控基因表達(dá)調(diào)控的基本概念乳糖操縱子色氨酸操縱子轉(zhuǎn)錄后水平的調(diào)控1052本章主要內(nèi)容是指儲存遺傳信息的基因經(jīng)過一系列步驟表現(xiàn)出其生物功能的整個(gè)過程。典型的基因表達(dá)是基因經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯,產(chǎn)生有生物活性的蛋白質(zhì)的過程?;虮磉_(dá)(gene
expression)1053大腸桿菌基因組(約4000個(gè)基因),一般情況下只有5-10%在高水平轉(zhuǎn)錄狀態(tài),其它基因有的處于較低水平的表達(dá),或者暫時(shí)不表達(dá)。人的基因組約含有10萬個(gè)基因,但在一個(gè)組織細(xì)胞中通常只有一部分基因表達(dá),多數(shù)基因處在沉靜狀態(tài),典型的哺乳類細(xì)胞中開放轉(zhuǎn)錄的基因約在1萬個(gè)上下,即使蛋白質(zhì)合成量比較多、基因開放比例較高的肝細(xì)胞,一般也只有不超過20%的基因處于表達(dá)狀態(tài)。1054生物基因組的遺傳信息并不是同時(shí)全部都表達(dá)出來的基因表達(dá)的時(shí)間性及空間性1055☆時(shí)間特異性按功能需要,某一特定基因的表達(dá)嚴(yán)格按特定的時(shí)間順序發(fā)生,稱之為基因表達(dá)的時(shí)間特異性(temporal
specificity)。多細(xì)胞生物基因表達(dá)的時(shí)間特異性又稱階段特異性(stage
specificity)。☆
空間特異性1056在個(gè)體生長全過程,某種基因產(chǎn)物在個(gè)體按不同組織空間順序出現(xiàn),稱之為基因表達(dá)的空間特異性(spatial
specificity)?;虮磉_(dá)伴隨時(shí)間順序所表現(xiàn)出的這種分布差異,實(shí)際上是由細(xì)胞在器官的分布決定的,所以空間特異性又稱細(xì)胞或組織特異性(cellor
tissue
specificity)?;虮磉_(dá)的方式1057按對刺激的反應(yīng)性,基因表達(dá)的方式分為:☆
組成性表達(dá)某些基因在一個(gè)個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá),通常被稱為管家基因(housekeepinggene)。管家基因管家基因(housekeeping
gene)某些基因在一個(gè)個(gè)體的幾乎所有細(xì)胞中持續(xù)表達(dá)。bcl-21058β-actin1
2常用的管家基因1059中文名稱Beta-肌動(dòng)蛋白甘油醛3-磷酸脫氫酶
TATA
Box結(jié)合蛋白
18s
核糖體核糖核酸微管蛋白α英文縮寫
β-actinGAPDHTBP18s
rRNAα-Tubulin無論表達(dá)水平高低,管家基因較少受環(huán)境因素影響,而是在個(gè)體各個(gè)生長階段的大多數(shù)或幾乎全部組織中持續(xù)表達(dá),或變化很小。區(qū)別于其他基因,這類基因表達(dá)被視為組成性基因表達(dá)(constitutive
gene
expression)?;镜幕虮磉_(dá)只受到啟動(dòng)序列或者啟動(dòng)子與RNA聚合酶相互作用的影響組成性基因表達(dá)也是相對的,而不是一成不變的,其表達(dá)強(qiáng)弱也是受一定機(jī)制調(diào)控的。10510☆
誘導(dǎo)和阻遏表達(dá)10511適應(yīng)性表達(dá)(adaptive
expression)指環(huán)境
的變化容易使其表達(dá)水平變動(dòng)的一類基因表達(dá)。改變基因表達(dá)的情況以適應(yīng)環(huán)境,例如與適宜溫度下生活相比較,在冷或熱環(huán)境下適應(yīng)生活的動(dòng)物,其肝臟合成的蛋白質(zhì)圖譜就有明顯的不同;長期攝取不同的食物,體內(nèi)合成代謝酶類的情況也會(huì)有所不同。所以,基因表達(dá)調(diào)控是生物適應(yīng)環(huán)境生存的必需。是指在特定環(huán)境因素刺激下,可誘導(dǎo)基因被激活,從而使基因的表達(dá)產(chǎn)物增加。如:DNA發(fā)生損傷時(shí),修復(fù)酶的誘導(dǎo)激活。10512誘導(dǎo)表達(dá)(induction)在特定環(huán)境信號刺激下,相應(yīng)的基因被激活,基因表達(dá)產(chǎn)物增加,這種基因稱為可誘導(dǎo)基因。阻遏(repression)10513如果基因?qū)Νh(huán)境信號應(yīng)答是被抑制,這種基因是可阻遏基因??勺瓒艋虮磉_(dá)產(chǎn)物水平降低的過程稱為阻遏。如:周圍有充足的葡萄糖,細(xì)菌就可以利用葡萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖類的酶類,如乳糖操縱子被阻遏、關(guān)閉。10514在一定機(jī)制控制下,功能上相關(guān)的一組基因,無論其為何種表達(dá)方式,均需協(xié)調(diào)一致、共同表達(dá),即為協(xié)調(diào)表達(dá)(c
o
o
r
d
i
n
a
t
ee
x
p
r
e
s
s
i
o
n),這種調(diào)節(jié)稱為協(xié)調(diào)調(diào)節(jié)
(coordinate
regulation)。10515基因激活轉(zhuǎn)錄起始
轉(zhuǎn)錄后加工
mRNA降解蛋白質(zhì)翻譯翻譯后加工修飾蛋白質(zhì)降解等轉(zhuǎn)錄水平的基因表達(dá)調(diào)控最重要基因表達(dá)的多級調(diào)控10516基因表達(dá)調(diào)控的生物學(xué)意義10517(一)適應(yīng)環(huán)境、維持生長和增殖(二)維持個(gè)體發(fā)育與分化2基本概念10518結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控基因操縱基因啟動(dòng)子和終止子順式作用元件和反式作用因子轉(zhuǎn)錄因子控基因(r10519gulator
gene):參與其他因表達(dá)結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控基因結(jié)構(gòu)基因(structural
gene):編碼蛋白質(zhì)或RNA的任何基因。原核生物的結(jié)構(gòu)基因一般成簇排列,真核生物獨(dú)立存在。調(diào)調(diào)控的RNA或蛋白質(zhì)的編碼基因。其編碼產(chǎn)物與DNA上的特定位點(diǎn)結(jié)合調(diào)控基因表達(dá)。2基本概念Promotere
Gene
1Gene
2Gene
3基TerminatorPromoterGene調(diào)控基因調(diào)控蛋白影響結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)105202.2
操縱基因操縱基因(operatorgene,O):調(diào)控蛋白特異性結(jié)合的一段DNA序列;調(diào)控蛋白結(jié)合在操縱基因的序列上,會(huì)影響其下游基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱:調(diào)控基因影響結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)調(diào)控蛋白10521根據(jù)操縱子對調(diào)節(jié)蛋白(阻遏蛋白或激活蛋白)的應(yīng)答情況,可分為:正轉(zhuǎn)錄調(diào)控(正控制)和負(fù)
轉(zhuǎn)錄調(diào)控(負(fù)控制)。調(diào)節(jié)蛋白(轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子):由調(diào)節(jié)基因所編碼的蛋白因子。負(fù)調(diào)節(jié)蛋白:阻遏蛋白正調(diào)節(jié)蛋白:激活蛋白1052223圖 轉(zhuǎn)錄水平的10負(fù)5調(diào)控與正調(diào)控105
24操縱子調(diào)控系統(tǒng)的基本類型2.3
啟動(dòng)子和終止子啟動(dòng)子(promoter,P):能被RNA聚合酶識別、結(jié)合并啟動(dòng)基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。終止子(terminator,T):給予RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號的DNA序列。105252基本概念10526結(jié)構(gòu)基因和調(diào)控基因操縱基因啟動(dòng)子和終止子順式作用元件和反式作用因子轉(zhuǎn)錄因子2.4
順式作用元件和反式作用因子順式作用元件(cis-actingelement):對基因表達(dá)有調(diào)節(jié)活性的DNA序列,其活性只影響與其自身同處在一個(gè)DNA分子上的基因;通常不編碼蛋白質(zhì),多位于基因旁側(cè)或內(nèi)含子中,如啟動(dòng)子、終止子、操縱基因等。調(diào)控基因10527過在反式作用因子(trans-acting
factor):通擴(kuò)散自身表達(dá)產(chǎn)物(酶、調(diào)節(jié)蛋白)控制其他基因的表達(dá),其編碼基因與其識別或結(jié)合的靶序列不同一個(gè)DNA分子上。如調(diào)控蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等。調(diào)控基因10528調(diào)控蛋白影響結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)2.5
轉(zhuǎn)錄因子10529轉(zhuǎn)錄因子:轉(zhuǎn)錄起始過程中,RNA聚合酶所需要的輔助因子。轉(zhuǎn)錄因子是參與正調(diào)控的反式作用因子。在無轉(zhuǎn)錄因子時(shí),RNA聚合酶不能起始轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄因子通常識別位于基因上游啟動(dòng)子附近的順式作用元件。30RNA
pol
IITFIIDTBPPol
III
啟動(dòng)子TFIIIBTFIIICTBPRNA
pol
IIIPol
I
啟動(dòng)子RNA
pol
ISL1UBF1Pol
II
啟TAFs
TBP動(dòng)子轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)105TATA基因表達(dá)的調(diào)控主要通過反式作用因子(通常是蛋白質(zhì))和順式作用元件(通常在DNA上)相互識別、相互作用而實(shí)現(xiàn)。順式作用元件轉(zhuǎn)錄因子
反式作用因子調(diào)控基因RNA
polymarase啟動(dòng)子10531操縱子:是基因表達(dá)的協(xié)調(diào)單位,由啟動(dòng)子、操縱基因及其所控制的一組功能上相關(guān)的結(jié)構(gòu)基因所組成。操縱基因受調(diào)節(jié)基因產(chǎn)物的控制。105323.操縱子1
乳糖操縱子(lac
operon)的結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn):1940年Monod:細(xì)菌在含葡萄糖和乳糖的培養(yǎng)基上生長時(shí),細(xì)菌優(yōu)先使用葡萄糖,當(dāng)葡萄糖耗盡,細(xì)菌才利用乳糖繁殖增長;1961年,法國人Jacob& Monod提出乳糖操縱子學(xué)說。獲1965年諾貝爾生理學(xué)和醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)。FrancisJacobJacquesMonod1053310534大腸桿菌可以利用葡萄糖、乳糖、麥芽糖、阿拉伯糖等作為碳源而生長繁殖,當(dāng)培養(yǎng)基中含有葡萄糖和乳糖時(shí),細(xì)菌優(yōu)先使用葡萄糖,當(dāng)葡萄糖耗盡,細(xì)菌停止生長,經(jīng)過短時(shí)間所以適應(yīng),就能利用乳糖,細(xì)菌繼續(xù)呈指數(shù)式繁殖增長。105
35乳糖操縱子調(diào)控模型①Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子mRNA分子所編碼。②啟動(dòng)子區(qū)(P)緊接著操縱區(qū)(O)區(qū)。③操縱區(qū)(O)是一小段序列(26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。④當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時(shí),lac
mRNA轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。Z編碼β-半乳糖苷酶:將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。Y編碼β-半乳糖苷透過酶:使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。A編碼β-半乳糖苷乙酰基轉(zhuǎn)移酶:乙酰輔酶A上的乙?;D(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。外周胞質(zhì)乳糖細(xì)胞內(nèi)面乳糖透(性)酶透(性)酶β-半乳糖苷酶葡萄糖半乳糖內(nèi)膜lac操縱子的本底水平表達(dá)有兩個(gè)矛盾是操縱子理論所不能解釋的:①誘導(dǎo)物需要穿過細(xì)胞膜才能與阻遏物結(jié)合,而轉(zhuǎn)運(yùn)誘導(dǎo)物需要透過酶,而后者的合成也需要誘導(dǎo)。解釋:一些誘導(dǎo)物可以在透過酶不存在時(shí)進(jìn)入細(xì)胞?(×)一些透過酶可以在沒有誘導(dǎo)物的情況下合成?(√)②真正的誘導(dǎo)物是異構(gòu)乳糖而非乳糖,前者是在β-半乳糖苷酶的催化下由乳糖形成的,因此,需要有β-半乳糖苷酶的預(yù)先存在。解釋:在本底水平上,有β-半乳糖苷酶的組成型合成,即,在非誘導(dǎo)狀態(tài)下,lac
Z操縱子有本底水平上的表達(dá)(有少量
lac
mRNA合成及翻譯)。10537操縱子的結(jié)構(gòu)組成:
結(jié)構(gòu)基因群:Z
Y
A
啟動(dòng)子:P
操縱基因:O
調(diào)控基因:I
終止子:TP
laci
P
OlacZlacYlacADNAmRNA多肽蛋白10408235107808253601021260275381253030四聚體四聚體膜蛋白二聚體1525003060氨基酸分子量(KDa)結(jié)構(gòu)分子量(KDa)功能阻遏蛋白β-半乳糖苷酶透性酶轉(zhuǎn)乙酰酶T1053810539阻遏蛋白與特異DNA(操縱基因)的結(jié)合位點(diǎn)操縱基因的對稱序列對稱軸:+11105402.3
阻遏蛋白對DNA的特異結(jié)合作用:
非誘導(dǎo)條件下,阻遏蛋白都結(jié)合在DNA上,特異位點(diǎn)的親和力高,非特異位點(diǎn)的親和力低。
誘導(dǎo)物的加入改變了阻抑蛋白的分布。維持阻遏
過量的阻遏物可結(jié)合在
DNA阻遏物結(jié)合在
的其它位點(diǎn)操縱基因上aaaaaaa
aa105
41誘導(dǎo)物
a誘導(dǎo)
所有的阻遏物都結(jié)合
在DNA
的隨機(jī)位點(diǎn)上a
aaaaaa誘導(dǎo)物解離a建立阻遏阻遏物恢復(fù)活性狀態(tài)aaa阻遏蛋白通過直接取代aa從隨機(jī)位點(diǎn)移向操縱基因aaaa
a
a圖
16
-
14
在
細(xì)
胞
中
所
有
的
阻
遏
蛋
白
都
結(jié)
合
在
D
N
A
上2105
42.4阻遏蛋白對RNA聚合酶的影響阻遏蛋白和RNA
pol可同時(shí)與DNA結(jié)合;阻遏蛋白存在增強(qiáng)了RNA
pol的結(jié)合:RNA
pol
與啟動(dòng)子結(jié)合的平衡常數(shù)1.9X107;有阻抑蛋白時(shí),2.5X109。雖然阻遏蛋白存在使得RNA
pol不能轉(zhuǎn)錄。但加入誘導(dǎo)物后,釋放出阻遏蛋白,閉合復(fù)合體變成為開放復(fù)合體,立即起始轉(zhuǎn)錄。轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)D
N
A解鏈區(qū)—
50
-
40
-
30
-
20
-
10R
N
A
聚合酶結(jié)合的起動(dòng)子區(qū)1
10
20
30阻遏蛋白結(jié)合區(qū)105StartpointgalaroHtrptrpRlacPromoterOperator
location圖16-1343操縱基因可位于啟動(dòng)子不同的相對位點(diǎn)操縱基因和啟動(dòng)子的相對位置關(guān)系
阻遏蛋白與操縱基因的結(jié)合方式:每個(gè)單體靠次級鍵與操縱基因的一半相結(jié)合。λ阻遏蛋白為二聚體。10544乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(沒有乳糖時(shí))RPOlacZlacYlacA調(diào)節(jié)基因
啟動(dòng)子
操縱基因
結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄信使RNA翻譯阻抑物與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄受阻.阻抑物10545105乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(有乳糖時(shí))RPOlacZlacYlacA調(diào)節(jié)基因
啟動(dòng)子
操縱基因
結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄信使RNA翻譯阻抑物與乳糖結(jié)合后構(gòu)象發(fā)生了改變,因而不能與操縱基因結(jié)合,使得結(jié)構(gòu)
基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。阻抑物乳糖轉(zhuǎn)錄半乳糖苷酶
酶酶乳糖分解代謝調(diào)控過程是一個(gè)自我調(diào)控過程462.3
葡萄糖對乳糖操縱子的影響lacIlacZlacYlacA10547PlacI
Plac
Olac現(xiàn)象:培養(yǎng)基中含葡萄糖、乳糖——lacZ等低表達(dá)無葡萄糖、有乳糖——lacZ等高表達(dá)問題:是否有另外的調(diào)控途徑?2.3.1
cAMP-CRP結(jié)合位點(diǎn)(另一調(diào)控元件)位于啟動(dòng)子Plac上游,與Plac部分重疊能與cAMP-CRP特異結(jié)合cAMP-CRP與該位點(diǎn)的結(jié)合是lacmRNA合成起始所必需的Plac
/
RNA
polymerase-50-1030-40 -30 -20
1-60CRPbindinglac1054810
20O /
repressor2.3.2
CRP
:cAMP
receptor
protein(cAMP受體蛋白)又稱CAP:Catabolite
activator
protein(降解物激活蛋白)由CRP基因編碼可通過與cAMP
結(jié)合而激活,即CRP只有與cAMP結(jié)合才有活性10549CRP-cAMPCRPcAMPglucosecAMP
receptor
protein105502.3.3
cAMP-CRP
的作用CRP-cAMP
與cAMP-CRP結(jié)合位點(diǎn)結(jié)合,增強(qiáng)了RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合力,使轉(zhuǎn)錄效率提高50倍。10551CRP的結(jié)合引起DNA鏈發(fā)生90°的彎曲附:葡萄糖水平與CRP的關(guān)系CRP只有與cAMP結(jié)合才有活性,而
cAMP
受葡萄糖水平的控制。葡萄糖含量高------cAMP水平低葡萄糖含量低------cAMP水平高10552105532.3.4
葡萄糖對乳糖操縱子影響的機(jī)制10554培養(yǎng)基中含葡萄糖、乳糖-----cAMP水平低沒有cAMP結(jié)合的CRP沒有活性CRP不與Plac結(jié)合RNA聚合酶不能與啟動(dòng)子牢固結(jié)合lacZ,lacY,lacA低表達(dá)10555葡萄糖對乳糖操縱子的影響機(jī)制(一)10556葡萄糖對乳糖操縱子影響機(jī)制(二)10557培養(yǎng)基中無葡萄糖、有乳糖-----cAMP水平高cAMP與CRP結(jié)合形成有活性的CRP-cAMP
復(fù)合物CRP-cAMP與Plac結(jié)合增強(qiáng)了RNA聚合酶與啟動(dòng)子的結(jié)合lacZ,lacY
、lacA高表達(dá)10558乳糖、G存在與否及與操縱子正、負(fù)控因素、基因開放與關(guān)閉情況如下:葡萄糖(G)乳糖基因開放×基因關(guān)閉 機(jī)理簡述(學(xué)生填充)√
細(xì)菌優(yōu)先用G,無CRP結(jié)合,無誘導(dǎo)物去阻遏√√CRP正控、乳糖去阻遏、基因開放、轉(zhuǎn)錄進(jìn)行×√無誘導(dǎo)物去阻遏,CRP即使結(jié)合,基因未開放√√cAMP-CRP復(fù)合物無,CRP位點(diǎn)空,去阻遏也無RNA
pol結(jié)合①
√②
×③
×④
√10559The
Lac
Operon:When
Glucose
Is
Present
But
Not
LactoseLacYLacALacZOperatorCRPRepressor
Binding
PromoterRNAPol.RepressorRepressorRepressormRNAHey
man,
I’mconstitutiveCome
on,
let
me
throughNo
wayJose!CRP10560The
Lac
Operon:When
Lactose
Is
Present
But
Not
GlucoseRepressorCRPBinding
PromRepressorRepressormRNAHey
man,
I’mconstitutiveCRPcAMPRepressorRepressoroter
Operator
LacZ
LacY
LacAXThis
lactose
hasbent
meoutofshapeCRPcAMPCRPcAMPBind
to
mePolymeraseRNAPol.RNAPol.Yippee…!10561The
Lac
Operon:When
Neither
Glucose
Nor
Lactose
Is
PresentLacYLacALacZOperatorCRPRepressor
Binding
PromoterCRPcAMPCRPcAMPCRPcAMPBind
to
mePolymeraseRNAPol.RepressorRepressormRNAHey
man,
I’mconstitutiveRepressorSTOPRight
therePolymeraseCome
on,
letmethrough!10562The
Lac
Operon:When
Glucose
and
Lactose
are
PresentRepressorPromoterLacYLacALacZOperatorCRPBindingRepressorRepressormRNAHey
man,
I’mconstitutiveCRPRepressorRepressorXThis
lactose
hasbent
meoutofshapeRNAPol.105633色氨酸操縱子10564細(xì)菌基因組中含有負(fù)責(zé)某些物質(zhì)合成的操縱子,如負(fù)責(zé)AA合成的操縱子。當(dāng)無外源AA時(shí),這類操縱子表達(dá),使細(xì)胞內(nèi)有足夠的AA以進(jìn)行蛋白質(zhì)的合成;有外源AA時(shí),細(xì)菌就不必自己合成,這類操縱子就受到阻遏。這類可被最終合成產(chǎn)物所阻遏的操縱子叫做可阻遏操縱子。色氨酸操縱子就是一個(gè)典型的可阻遏操縱子。3.1
組成3.1.1
結(jié)構(gòu)基因(1)基因E、D、C、B、A(2)編碼色氨酸合成所需要酶類頭尾相接串連排列組成結(jié)構(gòu)基因群組成一個(gè)轉(zhuǎn)錄單元多順反子mRNA3.1.2
調(diào)節(jié)基因trpR位置:遠(yuǎn)離P-o-結(jié)構(gòu)基因群編碼調(diào)控蛋白RR沒有與操縱元件o結(jié)合的活性當(dāng)環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時(shí),R與色氨酸結(jié)合后構(gòu)象變化而活化R與o特異性結(jié)合,抑制結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄3.1.3
操縱元件o含有18bp的回文結(jié)構(gòu)與色氨酸啟動(dòng)子Ptrp序列(-40~+18)在-21
~+1堿基之間重疊Trp-R與o的特異性結(jié)合,可以阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄3.2
色氨酸操縱子與轉(zhuǎn)錄調(diào)控現(xiàn)象:
培養(yǎng)基中Trp
濃度較低時(shí)---基因E、D、C、B、A高表達(dá)Trp
濃度較高時(shí)---基因E、D、C、B、A低表達(dá)Trp操縱子與負(fù)控阻遏系統(tǒng)Low
Trp3.2.1
Trp操縱子與負(fù)控阻遏系統(tǒng)(一)培養(yǎng)基中Trp
濃度較低調(diào)控蛋白R不能被活化未活化的調(diào)控蛋白R不能與操縱元件結(jié)合基因E、D、C、B、A高表達(dá)Trp操縱子與負(fù)控阻遏系統(tǒng)TrpHigh
Trp3.2.2
Trp操縱子與負(fù)控阻遏系統(tǒng)(二)培養(yǎng)基中Trp
濃度較高調(diào)控蛋白R與Trp結(jié)合Trp-R復(fù)合物與操縱子結(jié)合基因E、D、C、B、A低表達(dá)3.3
色氨酸操縱子總結(jié)1、通常是開放轉(zhuǎn)錄的,有效應(yīng)物(色氨酸)作用時(shí)則阻遏關(guān)閉轉(zhuǎn)錄。2、負(fù)控阻遏型操縱子。3、色氨酸可以作為共阻遏物起作用,并通過終產(chǎn)物抑制自身的合成(負(fù)反饋調(diào)節(jié))。4、細(xì)菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱子都屬于這種類型,其調(diào)控可使細(xì)菌處在生存繁殖最經(jīng)濟(jì)最節(jié)省的狀態(tài)。實(shí)驗(yàn)觀察表明:當(dāng)色氨酸達(dá)到一定濃度、但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時(shí),產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負(fù)相關(guān)。這種調(diào)控現(xiàn)象與色氨酸操縱子特殊的結(jié)構(gòu)----衰減子有關(guān)。3.4
轉(zhuǎn)錄終止的調(diào)控衰減子(Attenuator)位于轉(zhuǎn)錄起始部位的終止子,即可導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄過早終止的一段核苷酸序列。G-C區(qū)poly
(U)E
D
C
B
APromoter
Operator
Leader
AttenuatorRNA*
*
*
*
*
*
*
*
*
Trp
Trp
*
*
*(一)衰減子(attenuator)1、位置:在trpE起始密碼子上游,前導(dǎo)序列的末端。2、特點(diǎn):是一個(gè)不依賴ρ因子的終止子區(qū)域在富含GC的回文結(jié)構(gòu)之后是8個(gè)連續(xù)的U殘基在RNA轉(zhuǎn)錄物中可能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)3、作用:衰減作用(阻礙結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄)1、在trp
mRNA5’端trpE基因的起始密碼前一個(gè)長162bp的mRNA片段,序列分析發(fā)現(xiàn),其中4個(gè)片段進(jìn)行配對,形成不同的二級結(jié)構(gòu)。3與4---衰減子(終止子)發(fā)夾結(jié)構(gòu)(二)前導(dǎo)序列(leading
sequence)poly
(U)G-C區(qū)4AB105
78(二)前導(dǎo)序列(leading
sequence)2、前導(dǎo)RNA序列編碼14個(gè)氨基酸的前導(dǎo)肽,第10和第11個(gè)密碼子編碼連續(xù)的色氨酸殘基*
*
*
*
*
*
*
*
*
Trp
Trp
*
*
*RNA105
80S312P
OE4321LDNARNAAUGUGA2
trp
codons1432前導(dǎo)肽14aa(三)Attenuation(衰減作用)使正在進(jìn)行的操縱子轉(zhuǎn)錄在到達(dá)結(jié)構(gòu)基因以前就中途停止的基因調(diào)控作用?,F(xiàn)象:培養(yǎng)基中Trp含量較低時(shí)---轉(zhuǎn)錄不在衰減子上終止,結(jié)構(gòu)基因表達(dá)。Trp含量較高時(shí)---轉(zhuǎn)錄在衰減子上終止,結(jié)構(gòu)基因不表達(dá)。衰減子怎樣對色氨酸含量做出應(yīng)答反應(yīng)呢?(四)衰減作用機(jī)制4AB轉(zhuǎn)錄到達(dá)衰減子時(shí),終止子(衰減子)發(fā)夾結(jié)構(gòu)能否形成(轉(zhuǎn)錄終止/通讀)是衰減作用的關(guān)鍵。前導(dǎo)序列mRNA能形成兩種形式的發(fā)夾結(jié)構(gòu)A
、終止子發(fā)夾結(jié)構(gòu)可形成(3與4)B、終止子發(fā)夾結(jié)構(gòu)不能形成前導(dǎo)肽合成時(shí)核糖體在轉(zhuǎn)錄物上所在位置控制著兩種發(fā)夾結(jié)構(gòu)形式的轉(zhuǎn)換Trp
Trp2334TrpTrpTrp含量較高時(shí)Trp含量較低時(shí)(五)色氨酸操縱子衰減作用機(jī)制色氨酸濃度高時(shí)1、tRNAtrp-色氨酸供給充足,核糖體迅速通過色氨酸密碼子到達(dá)2區(qū)2、3區(qū)和4區(qū)形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(終止信號)3、衰減作用發(fā)生,轉(zhuǎn)錄終止,RNA聚合酶釋放,不能完成結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄色氨酸濃度低時(shí)1、tRNAtrp-色氨酸供給不足,核糖體遇到色氨酸密碼子時(shí)就停頓2、在4區(qū)轉(zhuǎn)錄未完成時(shí),2區(qū)和3區(qū)就形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)3、3區(qū)和4區(qū)不能形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)(終止信號),導(dǎo)致轉(zhuǎn)錄通讀;RNA聚合酶繼續(xù)沿DNA移動(dòng),完成結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄TrpTrp
高時(shí)Trp
低時(shí)mRNAtrpR調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因RNA聚P合酶ORNA聚合酶補(bǔ):色氨酸操縱子動(dòng)畫10588色氨酸操縱子24
3
423UUUU…U…UUU……前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA核1
糖體5’trp
密碼子結(jié)構(gòu)基因前導(dǎo)DNARNA聚合酶105891.當(dāng)色氨酸濃度低時(shí)Trp合成酶系相關(guān)結(jié)構(gòu)基因被轉(zhuǎn)錄序列3、4不能形成衰減子結(jié)構(gòu)…UUUUUUUU……調(diào)節(jié)區(qū)結(jié)構(gòu)基因trpRPO衰減子區(qū)域UUUU……前導(dǎo)mRNA前導(dǎo)序列1
234衰減子結(jié)構(gòu)第10、11密碼子為trp密碼子…14aa前導(dǎo)肽編碼區(qū):包含序列1形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)能力強(qiáng)弱:序列1/2>序列2/3>序列3/4trp
密碼子
終止密碼子UUUU……1059034UUUU
3U’UUU……34核糖體前導(dǎo)肽前導(dǎo)mRNA2.當(dāng)色氨酸濃度高時(shí)轉(zhuǎn)錄衰減機(jī)制125’trp
密碼子前導(dǎo)DNAUUUU
3’RNA聚合酶10591衰減子結(jié)構(gòu)就是終止子可使轉(zhuǎn)錄終止(六)衰減作用和負(fù)控阻遏的關(guān)系1、負(fù)控阻遏系統(tǒng)和衰減作用同樣對色氨酸水平應(yīng)答2、衰減作用使色氨酸操縱子結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄被抑制了10倍(細(xì)調(diào));3、色氨酸阻遏蛋白的阻遏作用使轉(zhuǎn)錄被抑制了70倍(粗調(diào));4、色氨酸水平對色氨酸操縱子結(jié)構(gòu)基因的表達(dá)施加了700倍的調(diào)節(jié)效果。原核生物細(xì)致的精細(xì)調(diào)控機(jī)制增強(qiáng)原核生物對環(huán)境的適應(yīng)性(七)衰減作用的重要性(衰減子的生物學(xué)意義)活性阻遏蛋白和非活性阻遏蛋白的轉(zhuǎn)變可能較慢, 而tRNA負(fù)載與否可能更為靈敏;aa主要用途是合成蛋白質(zhì),因而以tRNA負(fù)載情況 為標(biāo)準(zhǔn)來進(jìn)行控制可能更為恰當(dāng);大多數(shù)這樣的操縱子又同時(shí)需要阻遏蛋白。再論弱化子(attenuator)與弱化作用
(attenuation)弱化子是指Trp等操縱子前導(dǎo)序列的末端部分,具有減弱轉(zhuǎn)錄的功能。當(dāng)Trp過剩時(shí),前導(dǎo)肽的翻
譯合成到達(dá)前導(dǎo)mRNA的終止密碼子處,這時(shí),弱化子形成終止子發(fā)夾以阻遏下游相應(yīng)氨基酸操縱子的轉(zhuǎn)錄,即,使正在進(jìn)行的操縱子轉(zhuǎn)錄在到達(dá)結(jié)構(gòu)基因以前就中途停止——弱化作用。105944.翻譯水平的調(diào)控10595mRNA二級結(jié)構(gòu)對翻譯起始的調(diào)控SD序列與起始密碼子AUG之間的距離是影響mRNA轉(zhuǎn)錄、翻譯成蛋白的重要因素之一,某些蛋白質(zhì)與SD序列結(jié)合也會(huì)影響mRNA與核糖體的結(jié)合,從而影響蛋白質(zhì)的翻譯。SD序列與16SrRNA3’-端的相應(yīng)序列配對影響翻譯起始。強(qiáng)的配對可使翻譯頻率提高,反之翻譯頻率低。mRNA二級結(jié)構(gòu)影響隱蔽SD序列,影響核糖體小亞基與mRNA的結(jié)合,影響翻譯??烧T導(dǎo)和可阻遏的操縱子類型結(jié)合O
方式i
基因產(chǎn)物i
基因產(chǎn)物加上代謝終產(chǎn)物通常開放
由代謝終產(chǎn)物關(guān)閉O
的開放方
結(jié)構(gòu)基因產(chǎn)式
物功能由代謝底物
分解代謝開放合成代謝可誘導(dǎo)Lac10596可阻遏Trp乳糖和色氨酸操縱子的不同點(diǎn)乳糖操縱子
色氨酸操縱阻遏物 阻遏物R基子因R基因阻遏物阻遏物代謝物10597基因開放基因關(guān)閉mRNA的降解速度受細(xì)菌的生理狀態(tài)、環(huán)境因素及mRNA結(jié)構(gòu)的影響;mRNA分子自身回折產(chǎn)生的莖環(huán)結(jié)構(gòu)有助于維持mRNA穩(wěn)定性;105982)
mRNA穩(wěn)定性對翻譯的調(diào)控3)反義RNA的調(diào)控105991984年Mizuno,T.和Iwoue發(fā)現(xiàn)反義RNA可與特定的mRNA結(jié)合,影響轉(zhuǎn)錄,又叫干擾
mRNA的互補(bǔ)RNA
(
mic-RNA,mRNA-interferingcomplementary
RNA
)Antisense
RNA的作用可能有三種機(jī)制。反義RNA與mRNA上SD序列結(jié)合,形成雙鏈區(qū),使核糖體不能結(jié)合,使翻譯不能起始;在復(fù)制水平,與引物RNA互補(bǔ)結(jié)合,抑制DNA復(fù)制;在轉(zhuǎn)錄水平,與RNA結(jié)合,阻遏轉(zhuǎn)錄(4)在靶分子的部分區(qū)域形成雙鏈區(qū),使靶分子成為內(nèi)切酶的特異底物。4)蛋白質(zhì)合成水平的自體調(diào)控(翻譯阻遏)105100指一個(gè)基因的表達(dá)產(chǎn)物蛋白質(zhì)或者RNA反過來控制自身基因的翻譯表達(dá)。細(xì)菌編碼核糖體蛋白質(zhì)、蛋白質(zhì)合成因子和
RNA聚合酶亞基等蛋白質(zhì)的基因混合組成幾個(gè)操縱子。每個(gè)操縱子都含有數(shù)個(gè)基因。這些操縱子的表達(dá)都受操縱子自身的一些基因產(chǎn)物的調(diào)控。操縱子自身編碼的蛋白質(zhì)的
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