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1、第6章 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,蛋白質(zhì)的生物功能是以其化學(xué)組成和結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ)的。 蛋白質(zhì)的空間構(gòu)象取決于其一級結(jié)構(gòu)和周圍環(huán)境。,(一)蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,1.種屬差異 不同有機(jī)體中執(zhí)行同一功能的蛋白質(zhì)的氨基酸排列順序存在十分明顯的種屬差異。,例1 胰島素,來自哺乳動物、鳥類和魚類的胰島素一級結(jié)構(gòu)都是由51個氨基酸組成,但排列順序有差異。 主要差異在A鏈小環(huán)的8、9、10和B鏈30位氨基酸殘基。這4個氨基酸的改變不影響胰島素的功能,但所有來源的胰島素中二硫鍵的位置是固定不變的,說明其對胰島素的功能十分重要。,例1 胰島素,來自哺乳動物、鳥類和魚類的胰島素一級結(jié)構(gòu)都是由51個氨基酸組成,但排
2、列順序有差異。 主要差異在A鏈小環(huán)的8、9、10和B鏈30位氨基酸殘基。這4個氨基酸的改變不影響胰島素的功能,但所有來源的胰島素中二硫鍵的位置是固定不變的,說明其對胰島素的功能十分重要。,表 不同哺乳動物的胰島素分子中的氨基酸差異,例2 細(xì)胞色素C(cytC),廣泛存在于需氧生物細(xì)胞的線粒體中,是一種與血紅素輔基相結(jié)合的單鏈蛋白質(zhì),在生物氧化中起重要作用。 親緣關(guān)系越近c(diǎn)ytC組成和結(jié)構(gòu)的相似性越大,從而為生物的進(jìn)化提供了證據(jù)。 與功能密切相關(guān)的氨基酸序列是不變的。,表 不同生物與人的細(xì)胞色素c相比較的氨基酸差異數(shù)目,正常紅細(xì)胞,鐮刀狀紅細(xì)胞,血紅蛋白分子病,1、引起鐮刀狀紅細(xì)胞貧血病的原因:
3、 Hb A H2N Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu-Lys COOH Hb S H2N Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu-Lys COOH 鏈 1 2 3 4 5 6 7 8 2、分子?。褐改撤N蛋白質(zhì)分子一級結(jié)構(gòu)的氨基酸排列順序與正常的有所不同引起的的遺傳病。,血紅蛋白A和S胰蛋白酶消化液的指紋圖譜,HbA H2N Val-His-Leu-Thr-Pro-Glu-Glu-Lys-COOH HbS H2N Val-His-Leu-Thr-Pro-Val-Glu-Lys-COOH,濾紙層析電泳雙向圖譜,正常人的HbA的鏈第六位是Glu,而病人(HbS)
4、則被Val取代(遺傳密碼由CTTCAT)。,每種蛋白質(zhì)分子都具有特定的結(jié)構(gòu)來行使特定的功能,即使是一級結(jié)構(gòu)個別AA的變化也能引起功能的改變或喪失。,當(dāng)Glu被Val取代后,由于Glu的側(cè)鏈?zhǔn)菐ж?fù)電荷的羧基, Val的側(cè)鏈?zhǔn)遣粠щ姾傻氖杷?,因此這種改變顯著降低了血紅蛋白的溶解度,使患者的血紅蛋白分子容易聚集成纖維狀血紅蛋白,導(dǎo)致紅細(xì)胞收縮變形成鐮刀狀,輸氧能力下降,細(xì)胞脆弱易破碎,引起頭暈、胸悶等貧血癥狀。,別構(gòu)現(xiàn)象(allosteric effect):蛋白質(zhì)的構(gòu)象并不是固定不變的,當(dāng)有些蛋白質(zhì)的表現(xiàn)其生物活性時,其構(gòu)象發(fā)生改變,從而改變了整個分子的性質(zhì),這種現(xiàn)象就稱為別構(gòu)現(xiàn)象(別構(gòu)效應(yīng)、變
5、構(gòu)效應(yīng))。具有這種現(xiàn)象的蛋白質(zhì)叫別構(gòu)蛋白。,(二)蛋白質(zhì)構(gòu)象與功能的關(guān)系,主要學(xué)習(xí),氧的運(yùn)轉(zhuǎn):血紅蛋白 氧 (肺) 血紅蛋白 (血液循環(huán)) 肌紅蛋白(組織)(貯存氧) 耗氧的細(xì)胞器,肌紅蛋白的結(jié)構(gòu)與功能肌紅蛋白的三級結(jié)構(gòu),1、肌紅蛋白是哺乳動物細(xì)胞主要是肌細(xì)胞貯存和分配氧的蛋白質(zhì) 2、肌紅蛋白由一條多肽鏈(稱為珠蛋白)和一個輔基血紅素分子組成,多肽鏈主鏈由8段螺旋組成:A、B、C、D、E、F、G、H;共153個AA,肌紅蛋白三級結(jié)構(gòu)圖示,X-射線結(jié)晶學(xué)分析的三個階段: 分辨率0.6nm 多肽主鏈的折疊和走向 分辨率0.2nm 可以辨認(rèn)分子的側(cè)鏈基團(tuán) 分辨率0.14nm 識別所有的氨基酸,196
6、3年,Kendrew,氧的轉(zhuǎn)運(yùn),氧的溶解性差,蛋白質(zhì)運(yùn)輸,儲存,氨基酸側(cè)鏈不適合與氧可逆結(jié)合,金屬,鐵,易產(chǎn)生自由基,血紅素輔基,輔基血紅素原卟啉結(jié)構(gòu)示意圖和血紅素結(jié)構(gòu)及其與Fe2+的結(jié)合,卟啉癥,(三)氧與肌紅蛋白的結(jié)合,F8 His的咪唑基,亞鐵離子 與氧結(jié)合 不被氧化 這由肌紅蛋 白內(nèi)部疏水 環(huán)境決定,氧與肌紅蛋白結(jié)合的整體結(jié)構(gòu),氫鍵,肌紅蛋白多肽鏈形成的微環(huán)境有三個作用: 固定血紅素輔基; 保護(hù)血紅素鐵免遭氧化; 為O2提供一個合適的結(jié)合部位。,血紅素與CO結(jié)合肌紅蛋白中血紅素與CO親和力比O2大250倍,整體肌紅蛋白氧合圖示,二、血紅蛋白結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系,血紅蛋白的主要功能:在血液中
7、結(jié)合并轉(zhuǎn)運(yùn)氧氣。 研究血紅蛋白結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系:主要是研究血紅蛋白如何與氧分子的結(jié)合作用。,血紅蛋白的結(jié)構(gòu)(1),血紅蛋白組成: 1. 4個多肽亞基,兩個是亞基(141AA),兩個是亞基(146AA) ; 2.4個血紅素基,每個亞基共價結(jié)合一個。 每個亞基和亞基在三級結(jié)構(gòu)上與肌紅蛋白(153AA)極為相似。,血紅蛋白的結(jié)構(gòu)(2),血紅蛋白完整的三維結(jié)構(gòu)圖,氧結(jié)合改變血紅蛋白的構(gòu)象,*去氧血紅蛋白每個亞基中Fe()離子只有5個配體,并位于卟啉環(huán)上方,因此鐵卟啉環(huán)呈圓頂狀。HisF8與Fe()配位,空間位阻迫使Fe-N鍵略傾斜于血紅素卟啉環(huán)。 *當(dāng)與氧結(jié)合后, Fe()將被拉回卟啉環(huán)平面,卟啉環(huán)變
8、成平面,同時牽動HisF8,并進(jìn)而引起F螺旋和拐彎EF和FG的位移。這些移動傳到亞基界面,引發(fā)構(gòu)象重調(diào),從面使其它亞基易于和氧結(jié)合。,與氧結(jié)合時血紅蛋白的變構(gòu)過程,血紅素中鐵原子的變化 高自旋狀態(tài) 低自旋 (非氧合,原子半徑較大) (氧合,原子半徑較小),電子效應(yīng) 空間效應(yīng),血紅蛋白的T態(tài)和R態(tài),亞基T態(tài) R態(tài)引起的結(jié)果,*氧與一個處于T態(tài)的血紅蛋白亞基結(jié)合將引發(fā)構(gòu)象由T態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)镽態(tài),此時穩(wěn)定T態(tài)的那些相互作用被斷裂,亞基C-末端處于完全自由旋轉(zhuǎn)狀態(tài)。鏈和鏈的倒數(shù)第二位都是TyrHC2。在去氧血紅蛋白中這些Tyr殘基的酚-OH與ValFG5提供的肽C=O形成氫鍵。氧合時由于F螺旋移動導(dǎo)致上述氫
9、鍵斷裂,進(jìn)而連接亞基的8個鹽鍵斷裂。,去氧血紅蛋白中各亞基間鹽鍵:8個,去氧血紅蛋白中亞基間鹽鍵,*8個鹽鍵有6個處于不同亞基間。 *6個中4個涉及C-末端或N-末端殘基:鏈:兩個; 鏈:兩個。另兩個連接兩鏈的Asp126和Arg141殘基。 *此外,每條鏈的AspFG1和HisHC3間有鹽鍵。,氧合和去氧血紅蛋白不同構(gòu)象態(tài),血紅蛋白的協(xié)同性氧結(jié)合氧的結(jié)合,*血紅蛋白與氧的結(jié)合具有正協(xié)同效應(yīng):即其一個亞基與氧結(jié)合后能使得其它亞基很容易與氧結(jié)合。從而其氧結(jié)合曲線呈現(xiàn)S形。 而肌紅蛋白與氧的結(jié)合則呈雙曲線。,肌紅蛋白,血紅蛋白,1、Bohr效應(yīng):氫離子和二氧 化碳促進(jìn)血紅蛋白中氧氣的釋放 以供應(yīng)機(jī)
10、體組織需要,H+、CO2和BPG對血紅蛋白結(jié)合氧的影響,具有重要的生理意義,H+、CO2和BPG 對血紅蛋白結(jié)合氧的影響,H+、CO2的影響,1914年,C.Bohr發(fā)現(xiàn),高濃度的H+和 CO2促使氧合血紅蛋白分子釋放O2,而 高濃度的O2促使脫氧血紅蛋白分子釋放 H+和CO2。血紅蛋白對O2、 H+和CO2結(jié)合的這種相互關(guān)系叫波耳效應(yīng),H+、CO2對血紅蛋白氧合能力影響的解釋,H+的結(jié)合部位,146-His N-Val 122-His,使血紅蛋白保持T態(tài),CO2的結(jié)合部位,四個亞基N-末端氨基,Hb-NH2 + CO2,Hb-NH-COO- + H+ 氨甲酰衍生物,CO2 + H2O,H2C
11、O3,HCO3 + H+,-,(氧合態(tài)),Bohr效應(yīng)的生理意義及其機(jī)理,生理意義:血液流經(jīng)肌肉時利于氧的釋放和二氧化碳的結(jié)合;流經(jīng)肺部時利于二氧化碳的釋放和氧的結(jié)合。 機(jī)理:氫離子與血紅蛋白結(jié)合利于構(gòu)成T態(tài)的鹽橋形成,從而使氧釋放;在肺部由于氧分壓較高,促進(jìn)氧和血紅蛋白的結(jié)合,打斷鹽橋,使得氫離子和二氧化碳釋放。,2、BPG(2,3-二磷酸甘油酸) 降低血紅蛋白對氧氣的親和力從而 促進(jìn)氧從血紅蛋白釋放,以供應(yīng)機(jī) 體組織需要,BPG是血紅蛋白的別構(gòu)效應(yīng)物,與亞基的結(jié)合部位: Val1-NH3+ Lys82-NH3+ His143-咪唑基,BPG的影響:,Hb-BPG Hb(O2)4+ BPG
12、BPG降低血紅蛋白親氧能力的重要生理意義: BPG是紅細(xì)胞中存在的糖代謝中間產(chǎn)物。當(dāng)血液流經(jīng)O2分壓較低的組織時,紅細(xì)胞中的BPG可促進(jìn)氧合血紅蛋白釋放氧,以滿足組織對O2需要。 BPG濃度越大, O2的釋放量越多。紅細(xì)胞中BPG濃度的變化是調(diào)節(jié)血紅蛋白對氧親和力的重要因素。實(shí)例:在高山上;肺氣腫病人;儲藏血液(用肌苷代替酸性檸檬酸葡萄糖)。,BPG和O2對血紅蛋白的結(jié)合是排斥的,與氧結(jié)合時血紅蛋白的變構(gòu)過程,亞基三級結(jié)構(gòu)及整個蛋白四級結(jié)構(gòu)的變化,胎兒血紅蛋白的氧合能力大于HbA,胎兒血紅蛋白(HbF)為22,而成人血紅蛋白(HbA)為22, 與的區(qū)別為: 143His (BPG與亞基的結(jié)合部位: Val1-NH3+ Lys82-NH3+ His143-咪唑基) 143Ser,使HbF與BPG的結(jié)合能力減弱,因而增加了HbF對氧的親和力。其意義在于胎兒血液流經(jīng) 胎盤時HbF可以從母體HbA獲得O2。,T構(gòu)象 R 構(gòu)象,O2,構(gòu)象緊密 構(gòu)象松弛 氧親和力低 氧親和力高,蛋白質(zhì)分子中不止有一個配基的結(jié)合部位(活性部位),還有別的配基的結(jié)合部位(別構(gòu)部位)。別構(gòu)蛋白都有別構(gòu)效應(yīng)。,別構(gòu)效應(yīng):蛋白質(zhì)與
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